| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,339,314 | T→C | M1M (ATG→GTG) † | unknown ← | Haemophilus‑specific protein, uncharacterized |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,339,314 | 0 | T | C | 100.0% | 136.3 / NA | 48 | M1M (ATG→GTG) † | unknown | Haemophilus‑specific protein, uncharacterized |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (28/20); total (28/20) | |||||||||||
CTCTATTTCCTCAATGAATTTGTCAGCTACTTCCTTATTTTGGCTTTGTGTGTAAATATATTCTGCTTTATCTAAAAGCTGAAATCTAGCCATTTCAGACCATTGAACAATGTAGTCTTGTTTCATCGCTTCAATGCCTTGCGCAAATCTTTCATTACATCTTCATGTGAGTAAGTCTTAATTTTTCCATTTAAGACACCTTGTAAAAAGCGCTGCTCTTCTGTTAAGGATTGCTCAAACATTGATAAAACTCTTTCTTGAAGA‑TGAGTTTGCCCATTTTTTGATTTAGCTTGATTTAACATATTTTCTCCAACGCGCGCGGATTGTAATAATGATCTATCTTGGAATCATACAACAAAATTGCCAAAAGGTAAAAGGCCCAAGGGAGCCCTATCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTCCCAAGGGAAAGGTCTTACCTAAAAAGGTCAAAAGGCCTTTTCAAAAGGCTGGAACTACACTCACTATATTTGTT > 1/1339073‑1339572 | ctctATTTCCTCAATGAATTTGTCAGCCACTTCCTTACTTTGGCTTTGTGTGTAAATATATTCCGCTTTATCTAAAAGCTGAAATCTAGCCATTTCAGACCATTGAACAACGTAATCCTGTTTCATCGTTTCAATGCCTTGCGCAAATCTTTCATTACCTCTTCATGTGAGTAGGTCTTAATTTTGCCATTCAAGACACCTTGTAAAAAGCGTTGCTCTTCAGTTAAGGACTGTTCAAACACTGATaatac < 1:686141/251‑4 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CTCTATTTCCTCAATGAATTTGTCAGCTACTTCCTTATTTTGGCTTTGTGTGTAAATATATTCTGCTTTATCTAAAAGCTGAAATCTAGCCATTTCAGACCATTGAACAATGTAGTCTTGTTTCATCGCTTCAATGCCTTGCGCAAATCTTTCATTACATCTTCATGTGAGTAAGTCTTAATTTTTCCATTTAAGACACCTTGTAAAAAGCGCTGCTCTTCTGTTAAGGATTGCTCAAACATTGATAAAACTCTTTCTTGAAGA‑TGAGTTTGCCCATTTTTTGATTTAGCTTGATTTAACATATTTTCTCCAACGCGCGCGGATTGTAATAATGATCTATCTTGGAATCATACAACAAAATTGCCAAAAGGTAAAAGGCCCAAGGGAGCCCTATCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTCCCAAGGGAAAGGTCTTACCTAAAAAGGTCAAAAGGCCTTTTCAAAAGGCTGGAACTACACTCACTATATTTGTT > 1/1339073‑1339572 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |