| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 176,738 | A→G | R91R (CGT→CGC) | unknown ← | Type IV pilus biogenesis protein PilF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 176,738 | 0 | A | G | 100.0% | 224.3 / NA | 82 | R91R (CGT→CGC) | unknown | Type IV pilus biogenesis protein PilF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (35/47); total (35/47) | |||||||||||
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atcTAATTTTATCGCGTTTAAATAGGCGGTGCGGGCTTGTTCAATGTCGCCCTGTTGTTGATAGAAATAGGCAAATGCCGCTGACACTAAATAATAATCggg < 1:52215/102‑1 (MQ=255) aTTTTATCGCGTTTAAATAGGCGGTGCGGGCTTGTTCAATGTCGCCCTGTTGTTGATAGAAATAGGCAAATGCCGCTGACACTAAATAATAATCGGGAGCGTAAGAAAAGGCTTTATCCAGGTTCAGCTTGGCTTGTGCCGAATCTTGCTGCTGTAAATAGCCTAATGCCAGTTCCACGCGTGCTTTGGCGGCTTTTTGCTTGTCAAAATCCACCGCACTTTGTTGGGTGACGCAGGCGGAAAGCaaaaa > 1:610219/1‑250 (MQ=255) cgTTTAAATAGGCGGTGCGGGCTTGTTCAATGTCGCCCTGTTGTTGATAGAAATAGGCAAATGCCGCTGACACTAAATAATAATCGGGAGCGTAAGAAAAGGCTTTATCCAGGTTCAGCTTGGCTTGTGCCGACTCTTGCTGCTGTAAATAGCCTAATGCCAGTTCCACGCGTGCTTTGGCGGCTTTTTGCTTGTCAAAATCCACCGCACTTTGTTGGGTGACGCAGGCGGAAAGCAAAAACGGTAAAATa > 1:610775/1‑251 (MQ=255) cgTTTAAATAGGCGGTGCGGGCTTGTTCAATGTCGCCCTGTTGTTGATAGAAATAGGCAAATGCCGCTGACACTAAATAATAATCGGGAGCGTAAGAAAAGGCTTTATCCAGGTTCAGCTTGGCTTGTGCCGAATCTTGCTGCTGTAAATAGCCTAATGCCAGTTCCACGCGTGCTTTGGCGGCTTTTTGCTTGTCAAAATCCACCGCACTTTGTTGGGt > 1:160431/1‑220 (MQ=255) 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ggCGGTGCGGGCTTGTTCAATGTCGCCCTGTTGTTGATAGAAATAGGCAAATGCCGCTGACACTAAATAATAATCGGGAGCGTAAGAAAAGGCTTTATCCAGGTTCAGCTTGGCTTGTGCCGAATCTTGCTGCTGTAAATAGCCTAATGCCAGTTc < 1:159554/156‑1 (MQ=255) ggCGGTGCGGGCTTGTTCAATGTCGCCCTGTTGTTGATAGAAATAGGCAAATGCCGCTGACACTAAATAATAATCGGGAGCGTAAGAAAAGGCTTTATCCAGGTTCAGCTTGGCTTGTGCCGAATCTTGCTGCTGTAAATAGCCTAATGCCAGTTCCACGCGTGCTTTGGCGGCTTTTTGCTTGTCAAAATCCACCGCACTTTGTTGGGTGACGCAGGCGGAAAGCAAAAACGGAAAAATAAACGGTATTg > 1:71965/1‑251 (MQ=255) ggCGGTGCGGGCTTGTTCAATGTCGCCCTGTTGTTGATAGAAATAGGCAAATGCCGCTGACACTAAATAATAATCGGGAGCGTAAGAAAAGGCTTTATCCAGGTTCAGCTTGGCTTGTGCCGAATCTTGCTGCTGTAAATAGCCTAATGCCAGTTCCACGCGTGCTTTGGCGGCTTTTTGCTTGTCAAAATCCACCGCACTTTGTTGGGTGACGCAGGCGGAAAGCAAAAACGGAAAAATAAACGGTATTg > 1:279587/1‑251 (MQ=255) | TCGGAGAGATTTTCGTCAATAATGCGAGATTTTGCCGATAAATCGCCTGATTTTTGGCGGATAAAGCACATAACGCCAAGTTTTCATAAGTGTCCGCCTGATGGTAATAATTCGAGCTTTTTAAGGCGCGTTCAAATTGTACATAGGCACTGTCGAATTCCCCTTGCGCACAAAGAAATGCACCGTAATTATTGAACACAT‑CCCCTTGTTTATCATCTAATTTTATCGCGTTTAAATAGGCGGTACGGGCTTGTTCAATGTCGCCCTGTTGTTGATAGAAATAGGCAAATGCCGCTGACACTAAATAATAATCGGGAGCGTAAGAAAAGGCTTTATCCAGGTTCAGCTTGGCTTGTGCCGAATCTTGCTGCTGTAAATAGCCTAATGCCAGTTCCACGCGTGCTTTGGCGGCTTTTTGCTTGTCAAAATCCACCGCACTTTGTTGGGTGACGCAGGCGGAAAGCAAAAACGGAAAAATAAACGGTATTG > 1/176494‑176982 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |