| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,339,258 | T→G | G19G (GGA→GGC) | unknown ← | Haemophilus‑specific protein, uncharacterized |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,339,258 | 0 | T | G | 100.0% | 173.2 / NA | 60 | G19G (GGA→GGC) | unknown | Haemophilus‑specific protein, uncharacterized |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (32/28); total (32/28) | |||||||||||
ATGAAACTTCCCGTCGGTATAGGCATCAGCAATATAACTAAGTTTTTCTGATAGACACTCTATTTCCTCAATGAATTTGTCAGCTACTTCCTTATTTTGGCTTTGTGTGTAAATATATTCTGCTTTATCTAAAAGCTGAAATCTAGCCATTTCAGACCATTGAACAATGTAGTCTTGTTTCATCGCTTCAATGCCTTGCGCAAATCTTTCATTACATCTTCATGTGAGTAAGTCTTAATTTTTCCATTTAAGACACCTTGTAAAAAGCGCTGCTCTTCTGTTAAGGATTGCTCAAACATTGATAAAACTCTTTCTTGAAGATGAGTTTGCCCATTTTTTGATTTAGCTTGATTTAACATATTTTCTCCAACGCGCGCGGATTGTAATAATGATCTATCTTGGAATCATACAACAAAATTGCCAAAAGGTAAAAGGCCCAAGGGAGCCCTATCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTCC > 1/1339016‑1339499 | gtgaaatctCCCGTCAGTATAGGCGTCAGCAATGTAACTAAGTTTTTCTGATAGACGCTCTATTTCCTCAATGAATTTGTCAGCCACTTCCTTACTTTGGCTTTGTGTGTAAATATATTCCGCTTTATCTAAAAGCTGAAATCTAGCCATTTCAGACCATTGAACAACGTAATCCTGTTTCATCGTTTCAATGCCTTGCGCAAATCTTTCATTACCTCTTCATGTGAGTAGGTCTTAATTTTGCCAttcaa > 1:50896/9‑248 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |