| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,335,521 | G→A | A253V (GCA→GTA) | unknown ← | Cytolethal distending toxin subunit B, DNase I‑like |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,335,521 | 0 | G | A | 100.0% | 160.5 / NA | 60 | A253V (GCA→GTA) | unknown | Cytolethal distending toxin subunit B, DNase I‑like |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (28/32); total (28/32) | |||||||||||
AAACTACGCAAGCTAATACGTGGAGGAGGCGATAACTCTACATCAGGATAAGTAGTCGGATCAGGATTTGATTCTGCATGACTCGTCAAAGTCAATATCATGCTTAATAAGAAGCTCAATAAATATTTTTTCATAGTATTCTCCTTAGCGATCACGAACAAAACTAACAGGAAAATGATCGGATGTAATTTGTGAGCGTAACTGATTTAACATTAAACTTGCGCCGATACGTTCACGTGCTTGCTCTCGACGTGGTAAATGTGCGTCATGTAAAATCGCATAATCTAAAATATTACCGGACCGATGAGTCGGTTCTGTTGGCGCAATAATAATTGTATTTTCACTCACGGCGGGTTCCTGTCTTAATGCAGCTTCCAGATTAACCGGCGCA‑CGATTGAAATCACCAACAACCATCCAGCTATATCCTCGTCTTTCCGGTGATGATGGTGATGAGGTAAAAGTAGTGAAGATA > 1/1335283‑1335754 | aaaCTACGCAAGCTAATACGTGGAGGAGGCGATAACTCTACATCAGGATAAGTAGTCGGATCAGGATTTGATTCTGCATGACTCGTCAAAGTCAATATCATGCTTAATAAGAAGCTCAATAAATATTTTTTCATAGTATTCTCCTTAGCGATCATGAACAAAACTAACAGGAAAATGATCGGATGTAATTTGTGAGCGTAACTGATTTAACATTAAACTTGCGCCGATACGTTCACGTACTTGCTCTCGAc < 1:778995/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |