| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,335,437 | C→T | R281H (CGT→CAT) | unknown ← | Cytolethal distending toxin subunit B, DNase I‑like |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,335,437 | 0 | C | T | 100.0% | 164.0 / NA | 61 | R281H (CGT→CAT) | unknown | Cytolethal distending toxin subunit B, DNase I‑like |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (29/32); total (29/32) | |||||||||||
CTTTTCCCTTGTAATCAATTAATTCCCAATGTGTACTTAAATAATTATGTGAATCATAATGGTCATTTTTAATTGGTTGAGCCGTAAGCAAACTACGCAAGCTAATACGTGGAGGAGGCGATAACTCTACATCAGGATAAGTAGTCGGATCAGGATTTGATTCTGCATGACTCGTCAAAGTCAATATCATGCTTAATAAGAAGCTCAATAAATATTTTTTCATAGTATTCTCCTTAGCGATCACGAACAAAACTAACAGGAAAATGATCGGATGTAATTTGTGAGCGTAACTGATTTAACATTAAACTTGCGCCGATACGTTCACGTGCTTGCTCTCGACGTGGTAAATGTGCGTCATGTAAAATCGCATAATCTAAAATATTACCGGACCGATGAGTCGGTTCTGTTGGCGCAATAATAATTGTATTTTCACTCACGGCGGGTTCCTGTCTTAATGCAGCTTCCAGATTAACCGGCGCACGATTGAAA > 1/1335194‑1335682 | cTTTTCCCTTGTAATCAATTAATTCCCAATGTGTACTTAAATAATTATGTGAATCATAATGGTCATTTTTAATTGGTTGAGCCGTAAGCAAACTACGCAAGCTAATACGTGGAGGAGGCGATAACTCTACATCAGGATAAGTAGTCGGATCAGGATTTGATTCTGCATGACTCGTCAAAGTCAATATCATGCTTAATAAGAAGCTCAATAAATATTTTTTCATAGTATTCTCCTTAGCGATCATGAACaaa > 1:213578/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) tttttAATTGGTTGAGCCGTAAGCAAACTACGCAAGCTAATACGTGGAGGAGGCGATAACTCTACATCAGGATAAGTAGTCGGATCAGGATTTGATTCTGCATGACTCGTCAAAGTCAATATCATGCTTAATAAGAAGCTCAATAAATATTTTTTCATAGTATTCTCCTTAGCGATCATGAACAAAACTAACAGGAAAATGATCGGATGTAATTTGTGAGCGTAACTGATTTAACATTAAACTTGCGCCGa > 1:694284/1‑251 (MQ=255) ggTTGAGCCGTAAGCAAACTACGCAAGCTAATACGTGGAGGAGGCGATAACTCTACATCAGGATAAGTAGTCGGATCAGGATTTGATTCTGCATGACTCGTCAAAGTCAATATCATGCTTAATAAGAAGCTCAATAAATATTTTTTCATAGTATTCTCCTTAGCGATCATGAACAAAACTAACAGGAAAATGATCGGATGTAAtt > 1:519569/1‑205 (MQ=255) tGAGCCGTAAGCAAACTACGCAAGCTAATACGTGGAGGAGGCGATAACTCTACATCAGGATAAGTAGTCGGATCAGGATTTGATTCTGCATGACTCGTCAAAGTCAATATCATGCTTAATAAGAAGCTCAATAAATATTTTTTCATAGTATTCTCCTTAGCGATCATGAACAAAACTAACAGGAAAATGATCGGATGTAATTTGTGAGCGTAACTGATTTAACATTAAACTTGCGCCGATACGTTCACGta < 1:565647/251‑2 (MQ=255) 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|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |