| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,332,322 | C→T | intergenic (‑98/‑157) | unknown ← / → unknown | Cystathionine beta‑lyase (EC 4.4.1.8)/CDP‑diacylglycerol‑‑glycerol‑3‑phosphate 3‑phosphatidyltransferase (EC 2.7.8.5) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,332,322 | 0 | C | T | 100.0% | 146.5 / NA | 54 | intergenic (‑98/‑157) | unknown/unknown | Cystathionine beta‑lyase (EC 4.4.1.8)/CDP‑diacylglycerol‑‑glycerol‑3‑phosphate 3‑phosphatidyltransferase (EC 2.7.8.5) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (31/23); total (31/23) | |||||||||||
GATTAATGGTGGCGTGTTTCTTATCCGCTAAAGAATCAAATACCAACGATGAAGCGCGTTGTACTACCGGATTGACGGAACCGTGGGTATAACGTTTTTTTCTGCCGGCATGAACGAATGTGGTGGCTAAAGAGAATTTTTTTGACATGGAGAGTCCTATAAAATCAAAGAAAAAGTGCGGTCACCAAAATTTACATTTTTTAAACGTTGGCATAGCTAACAACTCTGGCGGAGCAAATAAATTACTTTGATGATTTATACATAAGTTGACAAGCATATTAACGCTAATCCGGTCTGATAACAAAACCCTTTTTGCGACAAAATTTTACGAAATTACCATTTAAAAAAGGCATAATCTGATTTACAATAACTCTCCAATCAATGGCAACCTAAAGCAATCCTATGAAATTTAACATCCCCATTTTTCTGACGCTATTTCGGATTATTTTAATTCCTTTCTTTATCATCGCTTTCTACCTCCCCTTTGATTG > 1/1332077‑1332567 | gATTAATGGTGGCGTGTTTCTTATCCGCTAAAGAATCAAATACCAACGATGAAGCGCGTTGTACTACCGGATTGACGGAACCGTGGGTATAACGTTTTTTTCTGCCGGCATGAACGAATGTGGTGGCTAAAGAGAATTTTTTTGACATGGAGAGTCCTATAAAATCAAAGAAAAAGTGCGGTCACCAAAATTTACATTTTTTAAACGTTGGCATAGCTAACAACTCTGGCGGAGCAAATAAATTATTTtga > 1:139582/1‑251 (MQ=255)gATTAATGGTGGCGTGTTTCTTATCCGCTAAAGAATCAAATACCAACGATGAAGCGCGTTGTACTACCGGATTGACGGAACCGTGGGTATAACGTTTTTTTCTGCCGGCATGAACGAATGTGGTGGCTAAAGAGAATTTTTTTGACATGGAGAGTCCTATAAAATCAAAGAAAAAGTGCGGTCACCAAAATTTACATTTTTTAAACGTTGGCATAGCTAACAACTCTGGCGGAGCAAATAAATTATTTtga > 1:268172/1‑251 (MQ=255)gATTAATGGTGGCGTGTTTCTTATCCGCTAAAGAATCAAATACCAACGATGAAGCGCGTTGTACTACCGGATTGACGGAACCGTGGGTATAACGTTTTTTTCTGCCGGCATGAACGAATGTGGTGGCTAAAGAGAATTTTTTTGACATGGAGAGTCCTATAAAATCAAAGAAAAAGTGCGGTCACCAAAATTTACATTTTTTAAACGTTGGCATAGCTAACAACTCTGGCGGAGCAAATAAATTATTTtg > 1:576490/1‑250 (MQ=255) aTTAATGGTGGCGTGTTTCTTATCCGCTAAAGAATCAAATACCAACGATGAAGCGCGTTGTACTACCGGATTGACGGAACCGTGGGTATAACGTTTTTTTCTGCCGGCATGAACGAATGTGGTGGCTAAAGAGAATTTTTTTGACATGGAGAGTCCTATAAAATCAAAGAAAAAGTGCGGTCACCAAAATTTACATTTTTTAAACGTTGGCATAGCTAACAACTCTGGCGGAGCAAATAAATTATTTtgat > 1:467213/1‑251 (MQ=255) aTTAATGGTGGCGTGTTTCTTATCCGCTAAAGAATCAAATACCAACGATGAAGCGCGTTGTACTACCGGATTGACGGAACCGTGGGTATAACGTTTTTTTCTGCCGGCATGAACGAATGTGGTGGCTAAAGAGAATTTTTTTGACATGGAGAGTCCTATAAAATCAAAGAAAAAGTGCGGTCACCAAAATTTACATTTTTTAAACGTTGGCATAGCTAACAACTCTGGCGGAGCAAATAAATTATTTtgat > 1:813827/1‑251 (MQ=255) aTTAATGGTGGCGTGTTTCTTATCCGCTAAAGAATCAAATACCAACGATGAAGCGCGTTGTACTACCGGATTGACGGAACCGTGGGTATAACGTTTTTTTCTGCCGGCATGAACGAATGTGGTGGCTAAAGAGAATTTTTTTGACATGGAGAGTCCTATAAAATCAAAGAAAAAGTGCGGTCACCAAAATTTACATTTTTTAAACGTTGGCATAGCTAACAACTCTGGCGGAGCAAATAAATTATTTtgat > 1:287072/1‑251 (MQ=255) aTTAATGGTGGCGTGTTTCTTATCCGCTAAAGAATCAAATACCAACGATGAAGCGCGTTGTACTACCGGATTGACGGAACCGTGGGTATAACGTTTTTTTCTGCCGGCATGAACGAATGTGGTGGCTAAAGAGAATTTTTTTGACATGGAGAGTCCTATAAAATCAAAGAAAAAGTGCGGTCACCAAAATTTACATTTTTTAAACGTTGGCATAGCTAACAACTCTGGCGGAGCAAATAAATTATTTtgat > 1:528009/1‑251 (MQ=255) 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GATTAATGGTGGCGTGTTTCTTATCCGCTAAAGAATCAAATACCAACGATGAAGCGCGTTGTACTACCGGATTGACGGAACCGTGGGTATAACGTTTTTTTCTGCCGGCATGAACGAATGTGGTGGCTAAAGAGAATTTTTTTGACATGGAGAGTCCTATAAAATCAAAGAAAAAGTGCGGTCACCAAAATTTACATTTTTTAAACGTTGGCATAGCTAACAACTCTGGCGGAGCAAATAAATTACTTTGATGATTTATACATAAGTTGACAAGCATATTAACGCTAATCCGGTCTGATAACAAAACCCTTTTTGCGACAAAATTTTACGAAATTACCATTTAAAAAAGGCATAATCTGATTTACAATAACTCTCCAATCAATGGCAACCTAAAGCAATCCTATGAAATTTAACATCCCCATTTTTCTGACGCTATTTCGGATTATTTTAATTCCTTTCTTTATCATCGCTTTCTACCTCCCCTTTGATTG > 1/1332077‑1332567 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |