| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,329,690 | C→T | intergenic (‑66/+78) | unknown ← / ← unknown | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,329,690 | 0 | C | T | 100.0% | 199.1 / NA | 75 | intergenic (‑66/+78) | unknown/unknown | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (42/33); total (42/33) | |||||||||||
TTAATCGTTTCTTTGGGCTGTTTTTAGGAATAACCGTTAAAATAAATTTATTATCCACTTGGTTTAATTCTAAAAAATCACCCGTATCAAGATTTAGTGTATGAATAAAATCTTTCGGTAAGCGAATTGCCTTGCTATTTCCCCATTGTTTAATTTCTAGTCTTGTATTCATTACCTCACCTCAACGTATCATTTTGTGATACATTTTAGCCTAATAAGAACAAAAATCAAGTACAGCCCAAAAACACTTCTTTTTCCTAATAAGCAAAAAAAGACCGACTTAAAGTCGGTCTTTTCAATGAGATTTAACTCAAATTAGAAAAATACACGCAAACCTGCACCATAAATATTTTCGTTTTTACGGATTTTATCATCTTTATCAGTTGCACGAATATATGACACATAAGGAATTACATGTTTATTAAATTCATAATCAACATTCACAATATAGTGATTTTCAATATGGCTTGGCGCTG > 1/1329453‑1329928 | gtgcagtttccactttcttaatcgctcgattaACCGTTAAAATAAATTTATTATCCACTTGGTTTAATTCTAAAAAATCACCCGTATCAAGATTTAGTGTATGAATAAAATCTTTCGGTAAGCGAATTGCCTTGCTATTTCCCCATTGTTTAATTTCTAGTCTTGTATTCATTACCTCACCTCAACGTATCATTTTGTGATACATTTTAGCCTAATAAGAACAAAAATCAAGTACAGTCCAAAAACActt > 1:787599‑M2/33‑250 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1:285408/1‑125 (MQ=255) aTCAAGTACAGTCCAAAAACACTTCTTTTTCCTAATAAGCAAAAAAAGACCGACTTAAAGTCGGTCTTTTCAATGAGATTTAACTCAAATTAGAAAAATACACGCAAACCTGCACCATAAATATTTTCGTTTTTACGGATTTTATCATCTTTATCAGTTGCACGAATATATGACACATAAGGAATTACa > 1:861266/1‑189 (MQ=255) aTCAAGTACAGTCCAAAAACACTTCTTTTTCCTAATAAGCAAAAAAAGACCGACTTAAAGTCGGTCTTTTCAATGAGATTTAACTCAAATTAGAAAAATACACGCAAACCTGCACCATAAATATTTTCGTTTTTACGGATTTTATCATCTTTATCAGTTGCACGAATATATGACACATAAGGAATTACa < 1:794339/189‑1 (MQ=255) aTCAAGTACAGTCCAAAAACACTTCTTTTTCCTAATAAGCAAAAAAAGACCGACTTAAAGTCGGTCTTTTCAATGAGATTTAACTCAAATTAGAAAAATACACGCAAACCTGCACCATAAATATTTTCGTTTTTACGGATTTTATCATCTTTATCAGTTGCACGAATATATGACACATAAGGAATTACATGTTTATTAAATTCATAATCAACATTCACAATATAGt < 1:128971/226‑1 (MQ=255) aTCAAGTACAGTCCAAAAACACTTCTTTTTCCTAATAAGCAAAAAAAGACCGACTTAAAGTCGGTCTTTTCAATGAGATTTAACTCAAATTAGAAAAATACACGCAAACCTGCACCATAAATATTTTCGTTTTTACGGATTTTATCATCTTTATCAGTTGCACGAATATATGACACATAAGGAATTACATGTTTATTAAATTCATAATCAACATTCACAATATAGTGATTTTCAATATGGCTTGGCgctg > 1:889105/1‑250 (MQ=255) cAAGTACAGTCCAAAAACACTTCTTTTTCCTAATAAGCAAAAAAAGACCGACTTAAAGt < 1:842506/59‑1 (MQ=255) cAAGTACAGTCCAAAAACACTTCTTTTTCCTAATAAGCAAAAAAAGACCGACTTAAAGTCGGTCTTTTCAATGAGATTTAACTCAAATTAGAAAAATACACGCAAACCTGCACCATAAATATTTTCGTTTTTACGGATTTTATCATCTTTATCAGTTGCACGAATATATGACACATAAGGAATTACATGTTTATTAAATTCATAATCAACATTCACAATATAGTGATTTTCAATATGGCTTGGCgctg > 1:899131/1‑248 (MQ=255) | TTAATCGTTTCTTTGGGCTGTTTTTAGGAATAACCGTTAAAATAAATTTATTATCCACTTGGTTTAATTCTAAAAAATCACCCGTATCAAGATTTAGTGTATGAATAAAATCTTTCGGTAAGCGAATTGCCTTGCTATTTCCCCATTGTTTAATTTCTAGTCTTGTATTCATTACCTCACCTCAACGTATCATTTTGTGATACATTTTAGCCTAATAAGAACAAAAATCAAGTACAGCCCAAAAACACTTCTTTTTCCTAATAAGCAAAAAAAGACCGACTTAAAGTCGGTCTTTTCAATGAGATTTAACTCAAATTAGAAAAATACACGCAAACCTGCACCATAAATATTTTCGTTTTTACGGATTTTATCATCTTTATCAGTTGCACGAATATATGACACATAAGGAATTACATGTTTATTAAATTCATAATCAACATTCACAATATAGTGATTTTCAATATGGCTTGGCGCTG > 1/1329453‑1329928 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |