| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,324,074 | T→C | K374R (AAA→AGA) | unknown ← | GTP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,324,074 | 0 | T | C | 100.0% | 120.7 / NA | 43 | K374R (AAA→AGA) | unknown | GTP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (19/24); total (19/24) | |||||||||||
AATTTCAGCTGGCCTTTTTCCAATACGAGATCCAATTTTACTTGTTTACCGTCTTCGACCAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTTTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAGGAATTTCTTCGCTGCCTGTAATTTGGCTTCGGCAAATTCTTCTTGCTGCTTTTTCGCCGCCTCGGTATAAACCTGAATTAATTGATTAAAAGTTTCACCGTCAACGTGATTAAAAGCAGAATCAATAG > 1/1323834‑1324317 | aaTTTCAGCTGGCCTTTTTCCAATACGAGATCCAATTTTACTTGTTTACCGTCTTCGACCAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGa < 1:820154/251‑1 (MQ=255) aTTTCAGCTGGCCTTTTTCCAATACGAGATCCAATTTTACTTGTTTACCGTCTTCGACCAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGaa > 1:240012/1‑251 (MQ=255) cTGGCCTTTTTCCAATACGAGATCCAATTTTACTTGTTTACCGTCTTCGACCAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCa < 1:637410/250‑1 (MQ=255) ttCCAATACGAGATCCAATTTTACTTGTTTACCGTCTTCGACCAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCagag > 1:508412/1‑250 (MQ=255) aCGAGATCCAATTTTACTTGTTTACCGTCTTCGACCAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAAt < 1:341531/251‑1 (MQ=255) aTCCAATTTTACTTGTTTACCGTCTTCGACCAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGaaa < 1:403173/251‑1 (MQ=255) aTCCAATTTTACTTGTTTACCGTCTTCGACCAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGaaa < 1:698526/251‑1 (MQ=255) gTCTTCGACCAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAAttt > 1:786655/1‑251 (MQ=255) aCCAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGa > 1:243830/1‑250 (MQ=255) ccAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCg < 1:464012/248‑1 (MQ=255) 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1:501407/251‑1 (MQ=255) aTTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCACCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAGGAATttctt < 1:438356/251‑1 (MQ=255) tttCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTg < 1:817666/225‑1 (MQ=255) ttCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGGCTTGATTATTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGATTGAGTATCAAGGAATTTCTTCGc < 1:800140/251‑1 (MQ=255) gctCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCCATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAGGAATTTCTTCGCTGCCTGTAAt > 1:439756/1‑251 (MQ=255) ctctctATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAgg < 1:260170/229‑1 (MQ=255) ctctctATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAGGAATTTCTTCGCTGCCTGTAAt < 1:583510/250‑1 (MQ=255) ctctATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGaaa > 1:848467/1‑150 (MQ=255) cTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAGGAATTTCTTCGCTGCCTGTAATTTGGCTTCGGCaaa > 1:56937/1‑251 (MQ=255) cAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAGGAATTTCTTCGCTGCCTGTAATTTGGCTTCGGCAAAttctt > 1:660737/1‑251 (MQ=255) cGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGAtt > 1:861241/1‑153 (MQ=255) ccATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAGGAATTTCTTCGCTGCCTGTAATTTGGCTTCGGCAAATTCTTCTTGCTGCTTTTTcgc > 1:203671/1‑250 (MQ=255) aaGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAGGAATTTCTTCGCTGCCTGTAATTTGGCTTCGGCAAATTCTTCTTGCTGCTTTTTCGCCGCCTCGGTATAAAcc < 1:174657/251‑1 (MQ=255) aaGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAGGAATTTCTTCGCTGCCTGTAATTTGGCTTCGGCAAATTCTTCTTGCTGCTTTTTCGCCGCCTCGGTATAAAcc < 1:458033/251‑1 (MQ=255) gCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGt < 1:747770/143‑1 (MQ=255) 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ttttCCTCTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAGGAATTTCTTCGCTGCCTGTAATTTGGCTTCGGCAAATTCTTCTTGCTGCTTTTTCGCCGCCTCGGTATAAACCTGAATTAATTGATTAAAAGTTTCACCGTCAACGTGATTAAAAGCAGAATCAATAg < 1:582676/251‑1 (MQ=255) | AATTTCAGCTGGCCTTTTTCCAATACGAGATCCAATTTTACTTGTTTACCGTCTTCGACCAATACACCTTGCAGAACACCGCTTTTCACACCTTCATTCACTTGTGTGGCTGCCATTTTCATTGCTTGCTCTCTATCCGGGCTTTTCAATTGCAGTGCGTTCGCCATTTCTTCGATTAAAGCATCTTTGTTCGCATCCACTTTGAAAATAAAGTGATTAAATAGATTGAAGATTTTTCCTTTGCTAATAGAATTTTCAAAATCAGAGCTTGCAATAGAAATATCTAAATTTGAGGCAATTTTACCGACTTGATTAGTTAATGTCGGACTAAACACAAATTGCGGTTGAGTATCAAGGAATTTCTTCGCTGCCTGTAATTTGGCTTCGGCAAATTCTTCTTGCTGCTTTTTCGCCGCCTCGGTATAAACCTGAATTAATTGATTAAAAGTTTCACCGTCAACGTGATTAAAAGCAGAATCAATAG > 1/1323834‑1324317 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |