| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,298,587 | A→G | intergenic (+146/+143) | unknown → / ← unknown | Mobile element protein/tRNA‑Trp‑CCA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,298,587 | 0 | A | G | 100.0% | 178.3 / NA | 62 | intergenic (+146/+143) | unknown/unknown | Mobile element protein/tRNA‑Trp‑CCA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (28/34); total (28/34) | |||||||||||
CTACCTTTACGGACGTGCCCGTTGGCGTAAGATGTTGATACGGGATAACGGTTCGCCTTATGCCATCCAGAACATGGGCCGACGGAGGAGACGGTTATGATAATGCGGTGATAAAGAGTTTTTTCAGCACGTTGATTACCGTCAGTTTAAGGACATTGATGAATCAGAATGGATGATACATGATATATTCGTTATTATACCTAGGAGCAAATTAAGCTCGGGTTAGACGATTTAAACCCTGTGCAATATAGAGCTCAATATTTAGTTATCTGTCCAACTTTTGGGGCTCAAATCACTTTTTTAATCTGATTTTAAAGTACAGTTTTCTTTTTTAAAGAAATTAGATTTAAAACGGATAGAGACAATTTTCAGTTTAGGATGAAGTAAATGGCAGGGGCGGAGAGTCTCGAACTCCCAACACCCGGTTTTGGAGACCGGTGCTCTACCAATTGAACTACGCCCCTATTGGTATGTATAACCTGAAAAGGTTA > 1/1298342‑1298832 | cTACCTTTACGGACGTGCCCGTTGGCGTAAGATGTTGATACGGGATAACGGTTCGCCTTATGCCATCCAGAACATGGGCCGACGGAGGAGACGGTTATGATAATGCGGTGATAAAGAGTTTTTTCAGCACGTTGATTACCGTCAGTTTAAGGACATTGATGAATCAGAATGGATGATACATGATATATTCGTTATTATACCTAGGAGCAAATTAAGCTCGGGTTAGACGATTTAAACCCTGTGCAGTATag < 1:470329/251‑1 (MQ=255) 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ccTTTACGGACGTGCCCGTTGGCGTAAGATGTTGATACGGGATAACGGTTCGCCTTATGCCATCCAGAACATGGGCCGACGGAGGAGACGGTTATGATAATGCGGTGATAAAGAGTTTTTTCAGCACGTTGATTACCGTCAGTTTAAGGACATTGATGAATCAGAATGGATGATACATGATATATTCGTTATTATACCTAGGAGCAAATTAAGCTCGGGTTAGACGATTTAAACCCTGTGCAGTATAGAGc < 1:720488/251‑1 (MQ=255) ccTTTACGGACGTGCCCGTTGGCGTAAGATGTTGATACGGGATAACGGTTCGCCTTATGCCATCCAGAACATGGGCCGACGGAGGAGACGGTTATGATAATGCGGTGATAAAGAGTTTTTTCAGCACGTTGATTACCGTCAGTTTAAGGACATAGATGAATCAGAATGGATGATACATGATATATTCGTTATTATACCTAGGAGCAAATTAAGCTCGGGTTAGACGATTTAAACCCTGTGCAGTATAGAGc < 1:81065/251‑1 (MQ=255) ttACGGACGTGCCCGTTGGCGTAAGATGTTGATACGGGATAACGGTTCGCCTTATGCCATCCAGAACATGGGCCGACGGAGGAGACGGTTATGATAATGCGGTGATAAAGAGTTTTTTCAGCACGTTGATTACCGTCAGTTTAAGGACATTGATGAATCAGAATGGATGATACATGATATATTCGTTATTATACCTAGGAGCAAATTAAGCTCGGGTTAGACGATTTAAACCCTGTGCAGTATAGAGc < 1:411085/248‑1 (MQ=255) 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cTGTGCAGTATAGAGCTCAATATTTAGTTATCTGTCCAACTTTTGGGGCTCAAATCACTTTTTTAATCTGATTTTAAAGTACAGTTTTCTTTTTTAAAGAAATTAGATTTAAAACGGATAGAGACAATTTTCAGTTCAGGATGAAGTAAATGGCAGGGGCGGAGAGTCTCGAACTCCCAACACCCGGTTTTGGAGACCGGTGCTCTACCAATTGAACTACGCCCCTATTGGTATGTATAAcc < 1:465185/242‑1 (MQ=255) gtgCAGTATAGAGCTCAATATTTAGTTATCTGTCCAACTTTTGGGGCTCAAATCACTTTTTTAATCTGATTTTAAAGTACAGTTTTCTTTTTTAAAGAAATTAGATTTAAAACGGATAGAGACAATTTTCAGTTCAGGATGAAGTAAATGGCAGGGGCGGAGAGTCTCGAACTCCCAac > 1:335815/1‑179 (MQ=255) gtgCAGTATAGAGCTCAATATTTAGTTATCTGTCCAACTTTTGGGGCTCAAATCACTTTTTTAATCTGATTTTAAAGTACAGTTTTCTTTTTTAAAGAAATTAGATTTAAAACGGATAGAGACAATTTTCAGTTCAGGATGAAGTAAATGGCAGGGGCGGAGAGTCTCGAACTCCCAACACCCGGTTTTGGAGACCGGTGCTCTACCAATTGAACTACGCCCCTATTGgta < 1:547344/231‑1 (MQ=255) gtgCAGTATAGAGCTCAATATTTAGTTATCTGTCCAACTTTTGGGGCTCAAATCACTTTTTTAATCTGATTTTAAAGTACAGTTTTCTTTTTTAAAGAAATTAGATTTAAAACGGATAGAGACAATTTTCAGTTCAGGATGAAGTAAATGGCAGGGGCGGAGAGTCTCGAACTCCCAACACCCGGTTTTGGAGACCGGTGCTCTACCAATTGAACTACGCCCCTATTGgta < 1:735932/231‑1 (MQ=255) gtgCAGTATAGAGCTCAATATTTAGTTATCTGTCCAACTTTTGGGGCTCAAATCACTTTTTTAATCTGATTTTAAAGTACAGTTTTCTTTTTTAAAGAAATTAGATTTAAAACGGATAGAGACAATTTTCAGTTCAGGATGAAGTAAATGGCAGGGGCGGAGAGTCTCGAACTCCCAACACCCGGTTTTGGAGACCGGTGCTCTACCAATTGAACTACGCCCCTATTGGTATGTATAACCt < 1:32587/241‑1 (MQ=255) gtgCAGTATAGAGCTCAATATTTAGTTATCTGTCCAACTTTTGGGGCTCAAATCACTTTTTTAATCTGATTTTAAAGTACAGTTTTCTTTTTTAAAGAAATTAGATTTAAAACGGATAGAGACAATTTTCAGTTCAGGATGAAGTAAATGGCAGGGGCGGAGAGTCTCGAACTCCCAACACCCGGTTTTGGAGACCGGTGCTCTACCAATTGAACTACGCCCCTATTGGTATGTATAACCTGAAAAGGTTa > 1:895590/1‑251 (MQ=255) | CTACCTTTACGGACGTGCCCGTTGGCGTAAGATGTTGATACGGGATAACGGTTCGCCTTATGCCATCCAGAACATGGGCCGACGGAGGAGACGGTTATGATAATGCGGTGATAAAGAGTTTTTTCAGCACGTTGATTACCGTCAGTTTAAGGACATTGATGAATCAGAATGGATGATACATGATATATTCGTTATTATACCTAGGAGCAAATTAAGCTCGGGTTAGACGATTTAAACCCTGTGCAATATAGAGCTCAATATTTAGTTATCTGTCCAACTTTTGGGGCTCAAATCACTTTTTTAATCTGATTTTAAAGTACAGTTTTCTTTTTTAAAGAAATTAGATTTAAAACGGATAGAGACAATTTTCAGTTTAGGATGAAGTAAATGGCAGGGGCGGAGAGTCTCGAACTCCCAACACCCGGTTTTGGAGACCGGTGCTCTACCAATTGAACTACGCCCCTATTGGTATGTATAACCTGAAAAGGTTA > 1/1298342‑1298832 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |