| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,297,484 | C→T | intergenic (‑50/‑415) | unknown ← / → unknown | Peptidyl‑tRNA hydrolase (EC 3.1.1.29)/Mobile element protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,297,484 | 0 | C | T | 100.0% | 284.0 / NA | 99 | intergenic (‑50/‑415) | unknown/unknown | Peptidyl‑tRNA hydrolase (EC 3.1.1.29)/Mobile element protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (55/44); total (55/44) | |||||||||||
CACCAAAAAACGCACTTCTTTGCCGTTCACCACGGCACGCGCGGTGTAGCCGAAAAATTTGTTTTCCGGATTTAAGATAACGTTAAAACGGCGCGCTAAACGCTCCATTAACCACACACCTGCATTGTGACGGGTGTCCGCATATTTGTCACCGGGATTGCCAATCCCGACGATAAGTTTGATTTCTGACATAGTGCTTTGCTTGCTAAAAAGAATGGCGCGTATTGTAGCGGAAAGTCGGCTTTTTCTCAATGAAAGGGAAGACCAAACCGCACTTTGATCTGCCCCCAAAAGCTAGGCACCACAGCTCACCAATTAAGGTGCAGATTATTATGGGTAAACATTATTCAATCGAATTCAAAAATCACATCGTCAACCTAGCACAGCGAGAAAAATGAAAATACCAAGTGAACAGAAACGTCACCTTGCAATAATCCTCAAGATATTAAGGCATTACTTAAGGAACTGGAGTATTTAAGAG > 1/1297243‑1297723 | cACCAAAAAACGCACTTCTTTGCCGTTCACCACGGCACGCGCGGTGTAGCCGAAAAATTTGTTTTCCGGATTTAAGATAACGTTAAAACGGCGCGCTAAACGCTCCATTAACCACACACCTGCATTGTGACGGGTGTCCGCATATTTGTCACCGGGATTGCCAATCCCGACGATAAGTTTGATTTCTGACATAGTGCTTTGCTTGCTAAAAAGAATGGCGCGTATTGTAGCGGAAAGTCGGTTTTTtctc < 1:894846/250‑1 (MQ=255) 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1:134168/1‑251 (MQ=255) aTAGGGCTTTGCTTGCTAAAAAGAATGGCGCGTATTGTAGCGGAAAGTCGGTTTTTTCTCAATGAAAGGGAAGACCAAACCGCACTTTGATCTGCCCCCAAAAGCTAGGCACCACAGCTCACCAATTAAGGTGCAGATTATTATGGGTAAACATTATTCAATCGAATTCAAAAATCACATCGTCAACCTAGCACAGCGAGAAAAATGAAAATACCAAGTGAGCAGAAACGTCACCTTGCAATAATCCTCaa > 1:29577/1‑251 (MQ=255) gTGCTTTGCTTGCTAAAAAGAATGGCGCGTATTGTAGCGGAAAGTCGGTTTTTTCTCAATGAAAGGGAAGACCAAACCGCACTTTGATCTGCCCCCAAAAGCTAGGcaccac > 1:100310/1‑112 (MQ=255) gTGCTTTGCTTGCTAAAAAGAATGGCGCGTATTGTAGCGGAAAGTCGGTTTTTTCTCAATGAAAGGGAAGACCAAACCGCACTTTGATCTGCCCCCAAAAGCTAGGCACCACAGCTCACCAATTAAGGTGCAGATTATTATGGGTAAACATTATTCAATCGAATTCAAAAATCACATCGTCAACCTAGCACAg < 1:446132/193‑1 (MQ=255) gTGCTTTGCTTGCTAAAAAGAATGGCGCGTATTGTAGCGGAAAGTCGGTTTTTTCTCAATGAAAGGGAAGACCAAACCGCACTTTGATCTGCCCCCAAAAGCTAGGCACCACAGCTCACCAATTAAGGTGCAGATTATTATGGGTAAACATTATTCAATCGAATTCAAAAATCACATCGTCAACCTAGCACAGCGAGAAAAATGAAAATACCAAGTGAGCAGAAACGTCACCTTGCAATAATCCTCAAGat > 1:188155/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |