| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,294,371 | T→C | intergenic (+133/+87) | unknown → / ← unknown | Cysteine synthase (EC 2.5.1.47)/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,294,371 | 0 | T | C | 100.0% | 378.8 / NA | 131 | intergenic (+133/+87) | unknown/unknown | Cysteine synthase (EC 2.5.1.47)/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (42/89); total (42/89) | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |