| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,291,079 | A→G | T3T (ACT→ACC) | unknown ← | DNA ligase (NAD(+)) (EC 6.5.1.2) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,291,079 | 0 | A | G | 100.0% | 253.0 / NA | 87 | T3T (ACT→ACC) | unknown | DNA ligase (NAD(+)) (EC 6.5.1.2) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (51/36); total (51/36) | |||||||||||
ATCCAAGGACAGCATGGGAATTTCATGGCGAATTTGTGCAAATTCGGACAACGGACGCGCACCCACGCGTTGGGTCGGCGAATCGGCGGTAACCAGTTCGGGATGTTGTTGTTCCAACGCTTTAAGCTGATGAAACAGGCGATCATACTCGCTGTCGGGAATCTGCGGATCGTCTAAAACGTGGTATTGATATTCGTGGTGGCGTAAGGTTTTTCTAAGGTCGTCGATTTGTTGTTGAATTGAAGTTGTCATTGTTATTCCGTAAAAATACCGAAAAAAATGACCGCACTTTGAGGTGCTCGGTGAGCGAAAAGTGCGGTCGTTTTTGAAAACGTTTTAAGCCGCCGTTATCATTAAGCCACTTTGGCTAAATATTCCTGTTCGGCATGGTCGTTGAAAATTTCCTGTTTGTCGGTCAACACAAAACCGCCTAATTCGTCCGCCAAATTGCGTGCAGCGCGAATCATAGTTTTTAAGTTGACGGTGT > 1/1290836‑1291322 | aTCCAAGGACAGCATGGGAATTTCATGGCGAATTTGTGCAAATTCGGACAACGGACGCGCACCCACGCGTTGGGTCGGCGAATCGGCGGTAACCAGTTCGGGATGTTGTTGTTCCAACGCTTTAAGCTGATGAAACAGGCGATCATACTCGCTGTCGGGAATCTGCGGATCGTCTAAAACGTGGTATTGATATTCGTGGTGGCGTAAGGTTTTTCTAAGGTCGTCGATTTGTTGTTGAATTGAGGTTGTCa > 1:798008/1‑251 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tttCTAAGGTCGTCGATTTGTTGTTGAATTGAGGTTGTCATTGTTATTCCGTAAAAATACCGAAAAAAATGACCGCACTTTGAGGTGCTCGGTGAGCGAAAAGTGCGGTCGTTTTTGAAAACGTTTTAAGCCGCCGTTATCATTAAGCCACTTTGGCTAAATATTCCTGTTCGGCATGGTCGTTGAAAATTTCCTGTTTGTCGGTCAACACAAAACCGCCTAATTCGTCCGCCAAATTGCGTGCAGCGCGa > 1:465049/1‑251 (MQ=255) ttCTAAGGTCGTCGATTTGTTGTTGAATTGAGGTTGTCATTGTTATTCCGTAAAAATACCGAAAAAAATGACCGCACTTTGAGGTGCTCGGTGAGCGAAAAGTGCGGTCGTTTTTGAAAACGTTTTAAGCCGCCGTTATCAtt > 1:100847/1‑143 (MQ=255) ttCTAAGGTCGTCGATTTGTTGTTGAATTGAGGTTGTCATTGTTATTCCGTAAAAATACCGAAAAAAATGACCGCACTTTGAGGTGCTCGGTGAGCGAAAAGTGCGGTCGTTTTTGAAAACGTTTTAAGCCGCCGTTATCATTAAGCCACTTTGGCTAAATATTcc < 1:801754/166‑1 (MQ=255) ttCTAAGGTCGTCGATTTGTTGTTGAATTGAGGTTGTCATTGTTATTCCGTAAAAATACCGAAAAAAATGACCGCACTTTGAGGTGCTCGGTGAGCGAAAAGTGCGGTCGTTTTTGAAAACGTTTTAAGCCGCCGTTATCATTAAGCCACTTTGGCTAAATATTCCTGTTCGGCATGGTCGTTGAAAATTTCCTGTTTGTCGGTCAACACAAAACCGCCTAATTCGTCCGCCAAATTGCGTGCAGCGCGaa > 1:108106/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |