| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,284,065 | T→C | N214S (AAT→AGT) | unknown ← | RNA polymerase sigma factor RpoD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,284,065 | 0 | T | C | 99.3% | 409.7 / NA | 144 | N214S (AAT→AGT) | unknown | RNA polymerase sigma factor RpoD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (67/76); total (67/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
TCCACCACAATCCGCTGAATGAAACGTTCCTGACCGCGAACACGTTTCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTTGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACATTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATTAAGTAAGTGATGGCTTCAGGGTAAGCGGCAATGG > 1/1283819‑1284308 | tCCACCACAATCCGCTGAATGAAACGTTCCTGACCGCGAACACGTTTCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGt < 1:758438/250‑1 (MQ=255)tCCACCACAATCCGCTGAATGAAACGTTCCTGACCGCGAACACGTTTCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGt < 1:241510/250‑1 (MQ=255) acaATCCGCTGAATGAAACGTTCCTGACCGCGAACACGTTTCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTtatcact < 1:153720/251‑1 (MQ=255) gTTCCTGACCGCGAACACGTTTCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTtatcac > 1:247310/1‑231 (MQ=255) gTTCCTGACCGCGAACACGTTTCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTtatca > 1:343028/1‑230 (MQ=255) gcgAACACGTTTCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTtatcact < 1:116812/222‑1 (MQ=255) cgAACACGTTTCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGt < 1:140758/250‑1 (MQ=255) tttCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATcttctt > 1:103146/1‑251 (MQ=255) tCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGt > 1:512817/1‑204 (MQ=255) tCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTta > 1:371187/1‑206 (MQ=255) tCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGt < 1:131002/240‑1 (MQ=255) tCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGt < 1:849672/240‑1 (MQ=255) tCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTAtct < 1:81765/245‑1 (MQ=255) tCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCttcttc > 1:643279/1‑250 (MQ=255) tCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCttcttc > 1:410487/1‑250 (MQ=255) tCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGATAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCttcttc > 1:403594/1‑250 (MQ=255) ataataCCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTtcctc < 1:498783/251‑1 (MQ=255) ccACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTTGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCg > 1:732317/1‑249 (MQ=255) cGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTta > 1:501838/1‑195 (MQ=255) cGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTAtct > 1:410571/1‑234 (MQ=255) cGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCttt > 1:174274/1‑250 (MQ=255) cGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCttt > 1:327908/1‑250 (MQ=255) cGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCATGCAATTTCAGGATCAACACTGTtatca > 1:430905/1‑198 (MQ=255) tataGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCAc < 1:715596/251‑1 (MQ=255) agatagCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGt > 1:847908/1‑188 (MQ=255) gatagCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTtatcact < 1:486759/194‑1 (MQ=255) gatagCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTAt > 1:668507/1‑250 (MQ=255) gCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTtatcactatca‑c < 1:471236/195‑1 (MQ=255) gCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAata > 1:872542/1‑251 (MQ=255) cACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAatat < 1:311000/251‑1 (MQ=255) aGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTtatcact > 1:734334/1‑185 (MQ=255) aaTTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCttcttc < 1:492952/251‑1 (MQ=255) gTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCaa < 1:551050/231‑1 (MQ=255) gTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGACTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTta > 1:131447/1‑167 (MQ=255) gTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTaaaa > 1:610999/1‑251 (MQ=255) aCTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAAtc < 1:573175/251‑1 (MQ=255) cGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGc < 1:879032/251‑1 (MQ=255) gAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAAtcttc < 1:610379/246‑1 (MQ=255) gAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGcc < 1:317343/250‑1 (MQ=255) aTTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAAt > 1:572561/1‑251 (MQ=255) gAGTGAAGATGTCGGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAAGTTCAGGATCAACACTGTtatcactctca‑c < 1:549442/156‑1 (MQ=255) aTGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGtct < 1:590480/250‑1 (MQ=255) gTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCgg > 1:78594/1‑251 (MQ=255) tGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGAtt > 1:218552/1‑251 (MQ=255) gATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGt > 1:717100/1‑242 (MQ=255) cacTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTtatcacta > 1:165209/1‑133 (MQ=255) tGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGcac < 1:51419/251‑1 (MQ=255) tGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGcac < 1:288514/251‑1 (MQ=255) ttCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAg < 1:278458/251‑1 (MQ=255) ttCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAg < 1:825826/251‑1 (MQ=255) ttCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAg < 1:197824/251‑1 (MQ=255) aTCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGAt < 1:388832/251‑1 (MQ=255) ttGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACg < 1:580772/251‑1 (MQ=255) tttttCGCCGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAAcc < 1:71784/251‑1 (MQ=255) ccGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAAtt > 1:891253/1‑251 (MQ=255) ccGTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAAtt < 1:704193/251‑1 (MQ=255) gTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGcac > 1:326889/1‑224 (MQ=255) gTACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTaa > 1:509292/1‑251 (MQ=255) tACGACCATGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAg < 1:668747/251‑1 (MQ=255) aTGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGCTGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCAGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTa > 1:309404/1‑251 (MQ=255) aTGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTtatcactatc > 1:149032/1‑96 (MQ=255) aTGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGAt < 1:572592/224‑1 (MQ=255) tGTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAg < 1:624548/196‑1 (MQ=255) gTTTGGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTAtcttc > 1:298034/1‑127 (MQ=255) ttggCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCg < 1:772418/248‑1 (MQ=255) tggCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTAtct > 1:108991/3‑122 (MQ=255) ggCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCGATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAg < 1:862412/214‑1 (MQ=255) ggCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTa > 1:179875/2‑251 (MQ=255) aaTGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTacac < 1:337198/251‑1 (MQ=255) aaTGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTacac < 1:494177/251‑1 (MQ=255) ctctAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGAt < 1:77838/209‑1 (MQ=255) ctctAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCAt > 1:634731/1‑251 (MQ=255) ctctAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCAt > 1:22950/1‑251 (MQ=255) ctAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCC‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCAttt < 1:9080/251‑1 (MQ=255) gTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGt > 1:542780/1‑188 (MQ=255) gTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTa > 1:139643/1‑250 (MQ=255) cTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTg > 1:812866/1‑76 (MQ=255) cTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAg > 1:899779/1‑220 (MQ=255) aTGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCat < 1:4659/251‑1 (MQ=255) tgctgcTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGaa > 1:876254/1‑138 (MQ=255) ctgctTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTAc < 1:196549/237‑1 (MQ=255) gctTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCATTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCa > 1:706387/1‑251 (MQ=255) gctTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTc > 1:26182/1‑250 (MQ=255) gctTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCa > 1:861592/1‑251 (MQ=255) taattGCGGTAAATTTTTCCCGTGCATTTTCAGGTTCACCCTTTTTACCAC‑ATCACCTTTCTCCCCTCCTCCCCCCTCCGTTTTCTTCTCCCCCCTCGTTTCCAC‑AACAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATta < 1:592808/247‑1 (MQ=255) aaGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATta < 1:554963/251‑1 (MQ=255) aaGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATta < 1:680166/251‑1 (MQ=255) gTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAata < 1:585170/110‑1 (MQ=255) gCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTtatca > 1:77873/1‑45 (MQ=255) tAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATTAAGTAAGTg < 1:759372/251‑1 (MQ=255) aaTTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAAt < 1:466409/226‑1 (MQ=255) aaTTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATtaagtaag < 1:888063/247‑1 (MQ=255) gTGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCTCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCatat < 1:451069/221‑1 (MQ=255) tGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATTAAGTAAGTGATGGCTTCAGGGt < 1:226412/251‑1 (MQ=255) tGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATTAAGTAAGTGATGGCTTCAGGGt < 1:687258/251‑1 (MQ=255) tGCAATTTCAGGATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATTAAGTAAGTGATGGCTTCAGGGt < 1:434377/251‑1 (MQ=255) gATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATtaagtaag < 1:148792/225‑1 (MQ=255) gATCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATTAAGTAAGTGATGGCTTCAGGGTAAGCGGCAATg > 1:261347/1‑251 (MQ=255) aTCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATTAAGTAAGTGATGGCTTCAGGGTAAGCGGCAATgg < 1:295448/251‑1 (MQ=255) tCAACACTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATTAAGTAAGTGATGGCTTCAGGGTAAGCGGCAATgg > 1:167042/1‑250 (MQ=255) | TCCACCACAATCCGCTGAATGAAACGTTCCTGACCGCGAACACGTTTCATAATACCACGTATAGATAGCACTAGCATATCGAATTGTTTTGGTACTAAGCGGAATTGAGTGAAGATGTCTGATAACACTTGAATTTCATCTTTTGCTTTTTTCGCCGTACGACCATGTTTTGCAATGCTCTCTAAGGTCTTTTGATGTTGCTGCTTAAGTGCGGTAAATTTTTCCCGTGCAATTTCAGGATCAACATTGTTATCACTATCA‑CTGTCATCGCTACTTCCCCCTTCGTTATCTTCTTCCTCCTCGCTTTCACTATCAATATCGCCACCTTCTTCGGAATTAAAATCTTCTGCCAATTCTTCAGTCTCGGATTCGGTTAGCACATTAGGATCAACGAAACCGGTAATTAAGTCGGCTAAGCGTACACCGCCATTTTCTACCAAATCATATTGCTCAATTAAGTAAGTGATGGCTTCAGGGTAAGCGGCAATGG > 1/1283819‑1284308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |