| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,283,989 | T→G | A239A (GCA→GCC) | unknown ← | RNA polymerase sigma factor RpoD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,283,989 | 0 | T | G | 100.0% | 376.7 / NA | 130 | A239A (GCA→GCC) | unknown | RNA polymerase sigma factor RpoD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (68/62); total (68/62) | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |