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cACCTGAAGTGTTCCACACTCACTTAGCTTATTTTTTAAATGAAATTGTACCGGTCGCTCAAGAAGTCGATATTAAAATGGCGATTCACCCTGATGATCCACCACGTCCAATTTTAGGTTTACCACGTATTGTATCCACCATTGAAGATATGCAATGGTTTGTCGAAACTCAACCATTACCGGCTAATGGCTTTACAATGTGTACCGGTTCTTATgggg > 1:304380/1‑219 (MQ=255) ccTGAAGTGTTCCACACTCACTTAGCTTATTTTTTAAATGAAATTGTACCGGTCGCTCAAGAAGTCGATATTAAAATGGCGATTCACCCTGATGATCCACCACGTCCAATTTTAGGTTTACCACGTATTGTATCCACCATTGAAGATATGCAATGGTTTGTCGAAACTCAACCATTACCGGCTAATGGc > 1:536810/1‑189 (MQ=255) aaGTGTTCCACACTCACTTAGCTTATTTTTTAAATGAAATTGTACCGGTCGCTCAAGAAGTCGATATTAAAATGGCGATTCACCCTGATGATCCACCACGTCCAATTTTAGGTTTACCACGTATTg < 1:333959/126‑1 (MQ=255) gtTCCACACTCACTTAGCTTATTTTTTAAATGAAATTGTACCGGTCGCTCAAGAAGTCGATATTAAAATGGCGATTCACCCTGATGATCCACCACGTCCAATTTTAGGTTTACCACGTATTGTATccacc > 1:789650/1‑130 (MQ=255) gtTCCACACTCACTTAGCTTATTTTTTAAATGAAATTGTACCGGTCGCTCAAGAAGTCGATATTAAAATGGCGATTCACCCTGATGATCCACCACGTCCAATTTTAGGTTTACCACGTATTGTATCCACCATTGAAGATATGCAATGGTTTGTCGAAACTCAACCATTACCGGCTAATGGCTTTACaa > 1:722347/1‑188 (MQ=255) gtTCCACACTCACTTAGCTTATTTTTTAAATGAAATTGTACCGGTCGCTCAAGAAGTCGATATTAAAATGGCGATTCACCCTGATGATCCACCACGTCCAATTTTAGGTTTACCACGTATTGTATCCACCATTGAAGATATGCAATGGTTTGTCGAAACTCAACCATTACCGGCTAATGGCTTTACAATGTGTACCGGTTCTTATGGGGTGCGTTCTGATAATGAt < 1:409757/226‑1 (MQ=255) aaaTTGTACCGGTCGCTCAAGAAGTCGATATTAAAATGGCGATTCACCCTGATGATCCACCACGTCCAATTTTAGGTTTACCACGTATTGTATCCACCATTGAAGATATGCAATGGTTTGTCGAAACTCAACCATTACCGGCTAATGGCTTTACAAtgt > 1:368916/1‑159 (MQ=255) aTTGTACCGGTCGCTCAAGAAGTCGATATTAAAATGGCGATTCACCCTGATGATCCACCACGTCCAATTTTAGGTTTACCACGTATTg < 1:429792/88‑1 (MQ=255) tCGCTCAAGAAGTCGATATTAAAATGGCGATTCACCCTGATGATCCACCACGTCCAATTTTAGGTTTACCACGTATTGTATCCACCATTGAAGATATGCAATGGTTTGTCGAAACCCAACCATTACCGGCTAATGGCTTTACAATGTGTACCGGTTCTTATGGGGTGCGTTCTGATAATGATTTAGTGAAAATGACGGAACAATTTTCCGACCGAATTTATTTCGCACACTTACGTTCGACTCAACGTGaa < 1:90018/251‑1 (MQ=255) cGCTCAAGAAGTCGATATTAAAATGGCGATTCACCCTGATGATCCACCACGTCCAATTTTAGGTTTACCACGTATTGTATCCACCATTGAAGATATGCAATGGTTTGTCGAAACTCAACCATTACCGGCTAATGGCTTTACAATGTGTACCGGTTCTTATGGGGTGCGTTCTGATAATGATTTAGTGAAAATGACGGAACAA‑TTTCCGACCGAATTTATTTCGCACACTTACGTTCGACTCAACGTGAAGa < 1:22292/251‑1 (MQ=255) | GTGCAGAACAAACCTATAACAAAGACGAAATAGCCGCAGCAAAAGCCTATTACGAAAAAATGAGTGATCAAGATATTCAACAGCTTACTCGTAATATTATTGCAGGCTTACCGGGGGCAGAAGAAGGCTATACCTTAGATGAATTTCAAGGTCAGTTAGATCGCTATAAAGATATTTCACCTGAAGTGTTCCACACTCACTTAGCTTATTTTTTAAATGAAATTGTACCGGTCGCTCAAGAAGTCTATATTAAAATGGCGATTCACCCTGATGATCCACCACGTCCAATTTTAGGTTTACCACGTATTGTATCCACCATTGAAGATATGCAATGGTTTGTCGAAACTCAACCATTACCGGCTAATGGCTTTACAATGTGTACCGGTTCTTATGGGGTGCGTTCTGATAATGATTTAGTGAAAATGACGGAACAATTTTCCGACCGAATTTATTTCGCACACTTACGTTCGACTCAACGTGAAGA > 1/1275499‑1275982 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |