| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,271,038 | G→A | L32L (TTG→TTA) | unknown → | TRAP‑type C4‑dicarboxylate transport system, small permease component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,271,038 | 0 | G | A | 100.0% | 159.1 / NA | 59 | L32L (TTG→TTA) | unknown | TRAP‑type C4‑dicarboxylate transport system, small permease component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (31/28); total (31/28) | |||||||||||
ACCCAAAAAAATCAAGTGGTCAATCCAATTATTTGTAATTGGTGAGCCAGATCACACTTTTAAACAAAAAAACTTGCAGAAAAGAAATTTTAAAGCATAATTGGTTTACCAATTTAAATTTAACGGCAAAAAGGAGTCGTAATGAACAAGTTCATATCTGTCATAAATTGGGCCTTATCAACACTCTGTGTTGCATTAAGTTCATTTTTAGTTATCTGTGTAGTTTGGCAAGTCTTGTCTCGCTATATTCTTAACACACCAAGTACTTACACTGATGAGATCGCGCGCTTTCTCTTTATTTGGGTAGGATTAATGGGGGCCGCCTATGCATTAGGTCGGAAGAAACACCTTGCCATTGATCTTTTAGTCAACAAATTTGAAAATTCTCCAATTAATCAAAATCGCTTACAACTTATCATTAACCTTATCAGTGTCTCATTTGCAGCCGTTATTATGTGCTATGGTGGATTTAAACTCGTTAT > 1/1270802‑1271283 | aCCCAAAAAAATCAAGTGGTCAATCCAATTATTTGTAATTGGTGAGCCAGATCACACTTTTAAACAAAAAAACTTGCAGAAAAGAAATTTTAAAGCATAATTGGTTTACCAATTTAAATTTAACGGCAAAAAGGAGTCGTAATGAACAAGTTCATATCTGTCATAAATTGGGCCTTATCAACGCTCTGTGTTGCATTAAGTTCATTTTTAGTTATCTGTGTAGTTTGGCAAGTCTTATCTCGCTATATTc < 1:314758/250‑1 (MQ=255)aCCCAAAAAAATCAAGTGGTCAATCCAATTATTTGTAATTGGTGAGCCAGATCACACTTTTAAACAAAAAAACTTGCAGAAAAGAAATTTTAAAGCATAATTGGTTTACCAATTTAAATTTAACGGCAAAAAGGAGTCGTAATGAACAAGTTCATATCTGTCATAAATTGGGCCTTATCAACACTCTGTGTTGCATTAAGTTCATTTTTAGTTATCTGTGTAGTTTGGCAAGTCTTATCTCGCTATATTc < 1:340576/250‑1 (MQ=255)aCCCAAAAAAATCAAGTGGTCAATCCAATTATTTGTAATTGGTGAGCCAGATCACACTTTTAAACAAAAAAACTTGCAGAAAAGAAATTTTAAAGCATAATTGGTTTACCAATTTAAATTTAACGGCAAAAAGGAGTCGTAATGAACAAGTTCATATCTGTCATAAATTGGGCCTTATCAACACTCTGTGTTGCATTAAGTTCATTTTTAGTTATCTGTGTAGTTTGGCAAGTCTTATCTCGCTATATTc < 1:662649/250‑1 (MQ=255) cccAAAAAAATCAAGTGGTCAATCCAATTATTTGTAATTGGTGAGCCAGATCACACTTTTAAACAAAAAAACTTGCAGAAAAGAAATTTTAAAGCATAATTGGTTTACCAATTTAAATTTAACGGCAAAAAGGAGTCGTAATGAACAAGTTCATATCTGTCATAAATTGGGCCTTATCAACACTCTGTGTTGCATTAAGTTCATTTTTAGTTATCTGTGTAGTTTGGCAAGTCTTATCTCGCTATATTCtt > 1:117614/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |