| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,259,446 | A→G | N273D (AAC→GAC) | unknown → | HflC protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,259,446 | 0 | A | G | 100.0% | 229.0 / NA | 82 | N273D (AAC→GAC) | unknown | HflC protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (35/47); total (35/47) | |||||||||||
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cTGAATTTTACAGCTTCATTCGTAGCCTGAAAGCCTATGAAAGCAGCTTCGCCGACTCGGACAATTTGTTGATTTTAAAACCGGACAGTGACTTCTTCCGTTTTATGCAATCACCAAGTAAATAATTGATTAAACATGAAAAGGGTATCTTCAGATGCCTTTTTTATTGCCGCCAAAATTACTTGGTATACCAGAAAATTAATTGGTAAAAAGTGGGTTAAGACCTTATAGTACGAGGCATTAACCCACtt < 1:354510/251‑1 (MQ=255) gAATTTTACAGCTTCATTCGTAGCCTGAAAGCCTATGAAAGCAGCTTCGCCGACTCGGACAATTTGTTGATTTTAAAAc < 1:778981/79‑1 (MQ=255) gAATTTTACAGCTTCATTCGTAGCCTGAAAGCCTATGAAAGCAGCTTCGCCGACTCGGACAATTTGTTGATTTTAAAACCGGACAGTGACTTCTTCCGTTTTATGCAATCACCAAGTAAATAATTGATTAAACATGAAAAGGGTATCTTCAGATGCCTTTTTTATTGCCGCCAAAATTACTTGGTATACCAGAAAATTAATTGGTAAAAAGTGGGTTAAGACCTTATAGTACGAGGCATTAACCCACTTTa > 1:215648/1‑251 (MQ=255) cagttACAGCTTCATTCGTAGCCTGAAAGCCTATGAAAGCAGCTTCGCCGACTCGGACAATTTGTTGATTTTAAAACCGGACAGTGACTTCTTCCGTTTTATGCAATCACCAAGTAAATAATTGATTAAACATGAAAAGGGTATCTTCAGATGCCTTTTTTATTGCCGCCAAAATTACTTGGTATACCAGAAAATTAATTGGTAAAAAGTGGGTTAAGAc > 1:634327/4‑220 (MQ=255) 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cTTCATTCGTAGCCTGAAAGCCTATGAAAGCAGCTTCGCCGACTCGGACAATTTGTTGATTTTAAAACCGGACAGTGACTTCTTCCGTTTTATGCAATCACCAAGTAAATAATTGATTAAACATGAAAAGGGTATCTTCAGATGCCTTTTTTATTGCCGCCAAAATTACTTGGTATACCAGAAAATTAATTGGTAAAAAGTGGGTTAAGACCTTATAGTACGAGGCATTAACCCACTTTATGCCTCAAAac < 1:95767/251‑1 (MQ=255) tAGCCTGAAAGCCTATGAAAGCAGCTTCGCCGACTCGGACAATTTGTTGATTTTAAAACCGGACAGTGACTTCTTCCGTTTTATGCAATCACCAAGTAAATAATTGATTAAACATGAAAAGGGTATCTTCAGATGCCTTTTTTATTGCCGCCAAAATTACTTGGTATACCAGAAAATTAATTGGTAAAAAGTGGGTTAAGACCTTATAGTACGAGGCATTAACCCACTTTATGCCTCAAAACACCCCCaaa < 1:352288/251‑1 (MQ=255) gCCTGAAAGCCTATGAAAGCAGCTTCGCCGACTCGGACAATTTGTTGATTTTAAAACCGGACAGTGACTTCTTCCGTTTTATGCAATCACCAAGTAAATAATTGATTAAACATGAAAAGGGTATCTTCAGATGCCTTTTTTATTGCCGCCAAAATTACTTGGTATACCAGAAAATTAATTGGTAAAAAGTGGGTTAAGACCTTATAGTACGAGGCATTAAcc < 1:658847/222‑1 (MQ=255) gCCTATGAAAGCAGCTTCGCCGACTCGGACAATTTGTTGATTTTAAAACCGGACAGTGACTTCTTCCGTTTTATGCAATCACCAAGTAAATAATTGATTAAACATGAAAAGGGTATCTTCAGATGCCTTTTTTATTGCCGCCAAAATTACTTGGTATACCAGAAAATTAATTGGTAAAAAGTGGGTTAAGACCTTATAGTACGAGGCATTAACCCACTTTATGCCTCAAAACACCCCCAAATTCCCACCg > 1:731901/1‑250 (MQ=255) tATGAAAGCAGCTTCGCCGACTCGGACAATTTGTTGATTTTAAAACCGGACAGTGACTTCTTCCGTTTTATGCAATCACCAAGTAAATAATTGATTAAACATGAAAAGGGTATCTTCAGATGCCTTTTTTATTGCCGCCAAAATTACTTGGTATACCAg > 1:218230/1‑159 (MQ=255) tATGAAAGCAGCTTCGCCGACTCGGACAATTTGTTGATTTTAAAACCGGACAGTGACTTCTTCCGTTTTATGCAATCACCAAGTAAATAATTGATTAAACATGAAAAGGGTATCTTCAGATGCCTTTTTTATTGCCGCCAAAATTACTTGGTATACCAGAAAATTAATTGGTAAAAAGTGGGTTAAGACCTTATAGTACGAGGCATTAACCCACttt < 1:110282/217‑1 (MQ=255) gAAAGCAGCTTCGCCGACTCGGACAATTTGTTGATTTTAAAACCGGACAGTGACTTCTTCCGTTTTATGCAATCACCAAGTAAATAATTGATTAAACATGAAAAg > 1:753471/1‑105 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |