| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,228,312 | G→T | intergenic (+620/‑131) | unknown → / → unknown | UDP‑N‑acetylglucosamine 1‑carboxyvinyltransferase (EC 2.5.1.7)/Putative secretion ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,228,312 | 0 | G | T | 100.0% | 112.3 / NA | 43 | intergenic (+620/‑131) | unknown/unknown | UDP‑N‑acetylglucosamine 1‑carboxyvinyltransferase (EC 2.5.1.7)/Putative secretion ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (25/18); total (25/18) | |||||||||||
ATTTACAGGTGTTACTTTAGAGATATGGTCTAAGGTTAAATTTAAGAAAGGAAAGTCAGAAAGTCAGAACAAATCAGCTTATATGAAATCTTAAAACATATGTCGGAAGTTAAAATTAAGGTATTTTCACTCTCTACACTAATTGAGTTAGTTGGACTATTAATGCTGGTAGGAACAAAACTCGTAATGGATCATGTAATGAGCTCGAAAAATAAATCATTACTCTTTATAATTTGCTTGGGGCTTCGCTTATTCACATTTTTTCACTTCATCAGTCAGTATGCTAAAGGCATGGATTTCTTTGAAAGTGGATTATTTAATTAATTTTCAATAGACTGCAAGTTTCTTTTTCCACCTATTAAAGTTACAAAATTAAACATGCTATTTTCTGGAATTCATGCCTCTATTGCGGCTTTAGAACAAATACTAATTTTATGGGTTGGTGAAACCCTAGTAATTGAAAATACAATGACATTGGGTATGTAT > 1/1228065‑1228550 | aTTTACAGGTGTTACTTTAGAGATATGGTCTGAGGTTAAATTTAAGAAAGGAAAGTCAGAAAGTCAGAACAAATCAGCTTATATGAAATCTTAAAACATATGTCGGAAGTTAAAATTAAGGTATTTTCACTCTCTACACTAATTGAGTTAGTTGGACTATTAATGCTGGTAGGAACAAAACTCGCAATGGATCATGTAATGAGCTCGAAAAATAAATCATTACTCTTTATAATTTGCTTGGGGCTTCTCtt > 1:772728/1‑251 (MQ=255) 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1:297713/1‑224 (MQ=255) ttATAATTTGCTTGGGGCTTCTCTTATTCACATTTTTTCACTTCATCAGTCAGTATGCTAAAGGCATGGATTTCTTTGAAAGTGGATTATTTAATTAATTTTCAATAGACTGCAAGTTTCTTTTTCCACCTATTAAAGTTACAAAATTAAACATGCTATTTTCTGGAATTCATGCCTCTATTGCGGCTTTAGAACAAATACTAATTTTATGGGTTGGTGAAACCCTAGTAATTGAAAATACAATGACATTg > 1:226502/1‑251 (MQ=255) ataATTTGCTTGGGGCTTCTCTTATTCACATTTTTTCACTTCATCAGTCAGTATGCTaa < 1:115149/59‑1 (MQ=255) aaTTTGCTTGGGGCTTCTCTTATTCACATTTTTTCACTTCATCAGTCAGTATGCTAAAGGCATGGATTTCTTTGAAAGTGGATTATTTAATTAATTTTCAATAGACTGCAAGTTTCTTTTTCCACCTATTAAAGTTACAAAATTAAACATGCTATTTTCTGGAATTCATGCCTCTATTGCGGCTTTAGAACAAATACTAATTTTATGGGTTGGTGAAACCCTAGTATTTGAAAATACAATGACATTGGgta < 1:133731/251‑1 (MQ=255) tGCTTGGGGCTTCTCTTATTCACATTTTTTCACTTCATCAGTCAGTATGCTAAAGGCATGGATTTCTTTGAAAGTGGATTATTTAATTAATTTTCAATAGACTGCAAGTTTCTTTTTCCACCTATTAAAGTTACAAAATTAAACATGCTATTTTCTGGAATTCATGCCTCTATTGCGGCTTTAGAACAAATACTAATTTTATGGGTTGGTGAAACCCTAGTAATTGAAAATACAATGACATTGGgtatgta < 1:253184/251‑1 (MQ=255) gCTTGGGGCTTCTCTTATTCACATTTTTTCACTTCATCAGTCAGTATGCTAAAGGCATGGATTTCTTTGAAAGTGGATTATTTAATTAATTTTCAATAGACTGCAAGTTTCTTTTTCCAc > 1:402825/1‑120 (MQ=255) cTTGGGGCTTCTCTTATTCACATTTTTTCACTTCATCAGTCAGTATGCTAAAGGCATGGATTTCTTTGAAAGTGGATTATTTAATTAATTTTCAATAGACTGCAAGTTTCTTTTTCCACCTATTAAAGTTACAAAATTAAACATGCTATTTTCTGGAATTCATGCCTCTATTGCGGCTTTAGAACAAATACTAATTTTATGGGTTGGTGAAACCCTAGTAATTGAAAATACAATGACATTGGgtatgtat < 1:565155/250‑1 (MQ=255) gggCTTCTCTTATTCACATTTTTTCACTTCATCAGTCAGTATGCTAAAGGCATGGATTTCTTTGAAAGTGGATTATTTAATTAATTTTCAATAGACTGCAAGTTTCTTTTTCCACCTATTAAAGTTACAAAATTAAACATGCTATTTTCTGGAATTCATGCCTCTATTGCGGCTTTAGAACAAATACTAATTTTATGGGTTGGTGAAACCCTAGTa < 1:8244/216‑1 (MQ=255) | ATTTACAGGTGTTACTTTAGAGATATGGTCTAAGGTTAAATTTAAGAAAGGAAAGTCAGAAAGTCAGAACAAATCAGCTTATATGAAATCTTAAAACATATGTCGGAAGTTAAAATTAAGGTATTTTCACTCTCTACACTAATTGAGTTAGTTGGACTATTAATGCTGGTAGGAACAAAACTCGTAATGGATCATGTAATGAGCTCGAAAAATAAATCATTACTCTTTATAATTTGCTTGGGGCTTCGCTTATTCACATTTTTTCACTTCATCAGTCAGTATGCTAAAGGCATGGATTTCTTTGAAAGTGGATTATTTAATTAATTTTCAATAGACTGCAAGTTTCTTTTTCCACCTATTAAAGTTACAAAATTAAACATGCTATTTTCTGGAATTCATGCCTCTATTGCGGCTTTAGAACAAATACTAATTTTATGGGTTGGTGAAACCCTAGTAATTGAAAATACAATGACATTGGGTATGTAT > 1/1228065‑1228550 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |