| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,201,629 | G→A | V385I (GTT→ATT) | unknown → | Na+/H+ antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,201,629 | 0 | G | A | 98.6% | 187.9 / NA | 71 | V385I (GTT→ATT) | unknown | Na+/H+ antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (30/40); total (30/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTAGTCACCGGTGGTGTAAGTGCGGTGATTATTGCGTCCATTTGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTGTTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCACCAGTGTCGGACACTACTATTCTGTCTTCCACCGGTGCAAAATGCGACCACATGGATCATGTCACTTCCCAATTGC > 1/1201383‑1201875 | ttAGTCACCGGTGGTGTAAGTGCGGTGATTATTGCGTCCATTTGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTAtttt < 1:599841/251‑1 (MQ=255) tggtgTAAGTGCGGTGATTATTGCGTCCATTTGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTa > 1:91622/1‑251 (MQ=255) ggtgTAAGTGCGGTGATTATTGCGTCCATTTGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTAt > 1:470403/1‑251 (MQ=255) gtgtAAGTGCGGTGATTATTGCGTCCATTTGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATg > 1:562093/1‑251 (MQ=255) gtgtAAGTGCGGTGATTATTGCGTCCATTTGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATg > 1:691338/1‑251 (MQ=255) gCGGTGATTATTGCGTCCATTTGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCAtttt > 1:10824/1‑250 (MQ=255) cGGTGATTATTGCGTCCATTTGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCTCTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTCCGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTcc < 1:3635/251‑1 (MQ=255) cATTTGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTAtttt < 1:874846/213‑1 (MQ=255) cATTTGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTggg > 1:297210/1‑251 (MQ=255) tGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAAc < 1:124371/251‑1 (MQ=255) 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ggTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAAc > 1:118004/1‑231 (MQ=255) aaGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTAtgc < 1:793772/242‑1 (MQ=255) gCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATcgc > 1:823537/1‑250 (MQ=255) 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1:856198/1‑251 (MQ=255) gTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCtt > 1:386913/1‑250 (MQ=255) ccTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCAc > 1:270419/1‑187 (MQ=255) ccTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCAcgcg > 1:103105/1‑251 (MQ=255) ccTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCAcgcg > 1:541528/1‑251 (MQ=255) aCTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATg < 1:503772/251‑1 (MQ=255) cTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATgg < 1:661607/251‑1 (MQ=255) 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1:670480/1‑251 (MQ=255) ttttAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTa > 1:431987/1‑251 (MQ=255) tCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATcggcgg < 1:476766/251‑1 (MQ=255) gTTTTTTGCCTGTACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGccc < 1:673772/178‑1 (MQ=255) tcccTGGCCAATCAATACCGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCCCTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTAtgc < 1:707269/165‑1 (MQ=255) 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atcaatAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTccttgcccgcgcccgctt > 1:663493/1‑234 (MQ=255) atcaatAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGGGCCGGAtg > 1:228118/1‑251 (MQ=255) aatAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATgtgg < 1:852669/251‑1 (MQ=255) aatAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATgtgg < 1:542784/251‑1 (MQ=255) atAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCCTGGCCGGGGCCGTTTgtggg > 1:761207/1‑250 (MQ=255) atAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATgtggt < 1:393588/251‑1 (MQ=255) atAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGCATgtggg > 1:829650/1‑250 (MQ=255) tCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGt < 1:870894/251‑1 (MQ=255) cGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTCCCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTc < 1:834016/249‑1 (MQ=255) 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aTCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTccc > 1:210526/1‑131 (MQ=255) tCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCAcg > 1:643721/1‑133 (MQ=255) ccTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCACCAGTGTCGGACACTACTATTCTGTCTTCCACCGGTGCAAAATg < 1:178072/250‑1 (MQ=255) tACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCACCAGTGTCGGACACTACTATTCTGTCTTCCACCGGTGCAAAATGCGAc < 1:300460/251‑1 (MQ=255) cGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTGTTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCACCAGTGTCGGACACTACTATTCTGTCTTCCACCGGTGCAAAATGCGACCACATGGAt < 1:899575/251‑1 (MQ=255) cGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCACCAGTGTCGGACACTACTATTCTGTCTTCCACCGGTGCAAAATGCGACCACATGGAt < 1:505631/251‑1 (MQ=255) tttCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCACCAGTGTCGGACACTACTATTCTGTCTTCCACCGGTGCAAAATGCGACCACATGGATc < 1:729797/250‑1 (MQ=255) ttCTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCACCAGTGTCGGACACTACTATTCTGTCTTCCACCGGTGCAAAATGCGACCACATGGATc < 1:550837/250‑1 (MQ=255) cTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCAcc < 1:69349/192‑1 (MQ=255) cTTACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCACCAGTGTCGGACACTACTATTc < 1:678363/212‑1 (MQ=255) tACCGGCACTGCTCTTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCACCAGTGTCGGACACTACTATTCTGTCTTCCACCGGTGCAAAATGCGACCACATGGATCATGTc < 1:654101/251‑1 (MQ=255) ctctTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTgg < 1:103802/115‑1 (MQ=255) ctTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCCGGCGCCGTATGTGGGGGCCACTGTTCACCAGGGTCGGGCACTACTATTCTGTCTTTCACCCGGGCAAAAAGCGACCACAAGGATCATgg > 1:462830/1‑236 (MQ=255) ctTTATTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCACCAGTGTCGGACACTACTATTCTGTCTTCCACCGGTGCAAAATGCGACCACATGGATCATGTCACTTCCCAATTGc < 1:126908/251‑1 (MQ=255) | TTAGTCACCGGTGGTGTAAGTGCGGTGATTATTGCGTCCATTTGTATTTTATCCGATCGTCTGGTAAGCCTGCATGAATATGTCAAAGCCTGGGTACTGGGCGTGAAATCCATGCTTGGCGCCATTTTAATTCTGTTTTTTGCCTGGACAATCAATAACGTGGTCAGCGATATAAAAACCGGCACTTATTTAGCCTCCTTGGTATCCTACGCCTTACCGCTTGCGTTCTTACCGGCACTGCTCTTTGTTTTAGCCGCCATTATGGCATTTTCCACCGGCACCAGTTGGGGAACCTTCGGAATTATGCTGCCCATCGCCGCGGCCATCGCTTCCCACGCGATGCATGGTTCCGTGGAATTTATGTTACCATGCTTATCGGCGGTCATGGCAGGCGCCGTATGTGGTGACCACTGTTCACCAGTGTCGGACACTACTATTCTGTCTTCCACCGGTGCAAAATGCGACCACATGGATCATGTCACTTCCCAATTGC > 1/1201383‑1201875 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |