| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,197,858 | T→G | intergenic (‑21/+95) | unknown ← / ← unknown | Cell division‑associated, ATP‑dependent zinc metalloprotease FtsH/23S rRNA (uridine(2552)‑2'‑O)‑methyltransferase (EC 2.1.1.166) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,197,858 | 0 | T | G | 100.0% | 99.8 / NA | 37 | intergenic (‑21/+95) | unknown/unknown | Cell division‑associated, ATP‑dependent zinc metalloprotease FtsH/23S rRNA (uridine(2552)‑2'‑O)‑methyltransferase (EC 2.1.1.166) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (17/20); total (17/20) | |||||||||||
ATCTTTGTCTTCCAATGGAATAACTGTTGTATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCTTATTTATAAGTTAACAACGTGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCGCTTGCAACAATATAAACTTCCCGAGATCGGTCTCGGGAGGCTTCAGGTTTACGAACTTTGACTACACTAAACAGAGAACGGATCTCTTTTAAGT > 1/1197613‑1198062 | aTCTTTGTCTTCCAATGGAATAACTGTTGTATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCgtatt < 1:369670/250‑1 (MQ=255) tGTCTTCCAATGGAATAACTGTTGTATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAg < 1:146378/251‑1 (MQ=255) ccAATGGAATAACTGTTGTATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTaaca > 1:801514/1‑251 (MQ=255) ggAATAACTGTTGTATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTaacaacatg > 1:279331/1‑248 (MQ=255) gAATAACTGTTGTATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGACTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTaacaacatg < 1:453412/250‑4 (MQ=255) cTGTTGTATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAg > 1:776768/1‑233 (MQ=255) gttgtATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAgg > 1:169931/1‑250 (MQ=255) gttgtATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGt > 1:321059/1‑251 (MQ=255) gtATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCgtatttat > 1:768478/1‑225 (MQ=255) gtATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTa > 1:41718/1‑250 (MQ=255) atTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTaacaacat > 1:15540/1‑232 (MQ=255) atTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACtata < 1:582050/251‑1 (MQ=255) tAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAATTTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATAttt < 1:26601/251‑1 (MQ=255) tGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTAtc < 1:477553/251‑1 (MQ=255) gACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAgg > 1:872061/1‑221 (MQ=255) tCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAAt < 1:17795/251‑1 (MQ=255) aaTTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGt < 1:683583/200‑1 (MQ=255) aaTTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTAtc > 1:422060/1‑213 (MQ=255) aaTTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTgg < 1:387546/251‑1 (MQ=255) aGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACAtgttgt > 1:103624/1‑190 (MQ=255) aGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAgg < 1:858452/194‑1 (MQ=255) tGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTTCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTatcaaatc < 1:435483/227‑1 (MQ=255) aCCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGAtt < 1:36761/251‑1 (MQ=255) gATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCgtatttat > 1:381579/1‑158 (MQ=255) aaCATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCg < 1:461357/251‑1 (MQ=255) cATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAgg < 1:23211/168‑1 (MQ=255) gTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCGCTTGCAACAATATaaa > 1:548284/1‑251 (MQ=255) ttATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTtata > 1:332595/1‑120 (MQ=255) cgccgGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCGCTTGCAACAATATAAACTTCCCGAGATCGGTCTCGGGa < 1:249499/251‑1 (MQ=255) gccgGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCGCTTGCAACAATATAAACTTCCCGAGATCGGTCTCGGGAg > 1:92344/1‑251 (MQ=255) gTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCGCTTGCAACAATATAAACTTCCCGAGATCGGtct < 1:184127/235‑1 (MQ=255) gTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCGCTTGCAACAATATAAACTTCCCGAGATCGGTCTCGGGAGGCTTCAGGtt > 1:35935/1‑251 (MQ=255) catcatGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCGCTTGCAACAATATAAACTTCCCGAGATCGGTCTCGGGAGGCTTCAGGTTTACGAACTTTGACTACACTAAAc < 1:455466/251‑1 (MQ=255) tcatGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCGCTTGCAACAATATAAACTTCCCGAGATCGGTCTCGGGAGGCTTCAGGTTTACGAACTTTGACTACACTAAAc < 1:659639/249‑1 (MQ=255) ggCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTatat > 1:93219/1‑95 (MQ=255) ggCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTtata < 1:190884/163‑1 (MQ=255) cccAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAAc > 1:110375/1‑154 (MQ=255) aTTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAg < 1:676196/48‑1 (MQ=255) gTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCGCTTGCAACAATATAAACTTCCCGAGATCGGTCTCGGGAGGCTTCAGGTTTACGAACTTTGACTACACTAAAc > 1:585356/1‑200 (MQ=255) gTTCAAGGCATTACCTCGTATTTATAAGTTAACAACATGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCGCTTGCAACAATATAAACTTCCCGAGATCGGTCTCGGGAGGCTTCAGGTTTACGAACTTTGACTACACTAAACAGAGAACGGATCTCTTTTAAGt < 1:481209/222‑1 (MQ=255) | ATCTTTGTCTTCCAATGGAATAACTGTTGTATATTTAGTGCCGTCGGTTTTAGTGACTAAAATTTCATTATCTTCAAATTTAGCCTGACGTACCTGATTATTTTCAACATCCGAAATGAATGTCGTATAATCCGTTATCCCTCCGCCGGAAGTGGTATTAAAACTTTGATATGCAGTCATCATGACAATGGCCACAACCACCCAAAGAATTAAATTTTTTACCATATCGTTCAAGGCATTACCTCTTATTTATAAGTTAACAACGTGTTGTAAGGTTACTATATTTATCTCAAAAATTAAAGTTATCAAATCAATTGAGCTTATTGGTAACTTAATTTGATTAGTGTTTATAACCGCTTGCAACAATATAAACTTCCCGAGATCGGTCTCGGGAGGCTTCAGGTTTACGAACTTTGACTACACTAAACAGAGAACGGATCTCTTTTAAGT > 1/1197613‑1198062 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |