| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,188,679 | T→G | V474V (GTA→GTC) | unknown ← | Phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,188,679 | 0 | T | G | 100.0% | 108.9 / NA | 41 | V474V (GTA→GTC) | unknown | Phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (23/18); total (23/18) | |||||||||||
TTCATCACCTAATACATCAGGTAAATCTGTAGGAAGAGATAACCGAGCATTCAGATATTTATGTTTTGGCTCAAGTAAATCCCACGCATTATTTATACACATCAATAAATTAATTTTCTGTAATGTATTTGTGGTTTGGCGGGAAAAATGGCGCAGTCTTTTCACCACCAGCGCCGTACGCTCCACTAAATTTTCTATTTTCTCTAAATAGTTATTCGCAGAAAAAACATCATTATTTTTTACCGCTCTTTTTGTACTGAAAATATACGCATTCATTGCATTTAGCGGTTGTGTGATTTCATGGCTAATAGATGTCAAAGTTTGTCCTACTACCGCTAATTTTGCCGCTTGAATTAGTTCTTGTTGTGTATTGATAAGTTTTTCCTGGATTGCAATACGTTCACTAATTTCATTTAATAAAATTTGATTTCTTCTTTCTAATTCTTCATTTTTTGTGTTAACTTCAAATAAAAATAA > 1/1188439‑1188915 | ttCATCACCTAATACATCAGGTAAATCTGTAGGAAGAGATAACCGAGCATTCAGATATTTATGTTTTGGCTCAAGTAAATCCCACGCATTATTTATACACATCAATAAATTAATTTTCTGTAATGTATTTGTGGTTTGGCGGGAAAAATGGCGCAGTCTTTTCACCACCAGCGCCGTACGCTCCACTAAATTTTCTATTTTCTCTAAATAGTTATTCGCAGAAAAAACATCATTATTTTTGACCGCTCttt > 1:493847/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |