| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 159,846 | A→T | intergenic (+104/‑13) | unknown → / → unknown | Uncharacterized membrane protein YoaT/Uncharacterized protein STM3906 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 159,846 | 0 | A | T | 100.0% | 137.7 / NA | 52 | intergenic (+104/‑13) | unknown/unknown | Uncharacterized membrane protein YoaT/Uncharacterized protein STM3906 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (26/26); total (26/26) | |||||||||||
GCGTTACCCCAATCAAATCGGCGCGTGGTCGTTAGTGCATGCCAGCAAGTGGAGTGCCTGGGCGTTGTTGGTGGTAATGACATTCACCATCGTGGCGAACCTCAAACACATTAAACAAACGATTCGGGTGTCGAGGGATTAGGTGGAAAAAGTGCGGTCAAAAAACACAATGAATTTTAACCGCACTTTGACATATTAAACGACGCGCCGAGTGAACATTGGCATTATGATTTATTTTGGTATAAAATTTTATACATTATGAGTAGGCAACAAATAGAACGGAAACCAATTCATTGGATTGGCTCTAGCTTAGAGGATGTTAAGGCGTTTCCGGATAATATAAAACGGGAATTAGGTTTCGATCTTGACCTCGTACAACAGGGGTTATCGCCTCGGGATTTTAAGGCAATGCAGAACCTGGGTTCCGGTGTAATGGAAATTCGAGTGAGGGATATTTCAGGGGCATATCGTTTGGTTTACATTGCCAAAT > 1/159601‑160090 | gCGTTACCCCAATCAAATCGGCGCGTGGTCGTTAGTGCATGCCAGCAAGTGGAGTGCCTGGGCGTTGTTGGTGGTAATGACATTCACCATCGTGGCGAACCTCAAACACATTAAACAAACGATTCGGGTGTCGAGGGATTAGGTGGAAAAAGTGCGGTCAAAAAACACAATGAATTTTAACCGCACTTTGACATATTAAACGACGCGCCGAGTGAACATTGGCATTATGATTTATTTTGGTATAATAtttt > 1:745208/1‑251 (MQ=255)gCGTTACCCCAATCAAATCGGCGCGTGGTCGTTAGTGCATGCCAGCAAGTGGAGTGCCTGGGCGTTGTTGGTGGTAATGACATTCACCATCGTGGCGAACCTCAAACACATTAAACAAACGATTCGGGTGTCGAGGGATTAGGTGGAAAAAGTGCGGTCAAAAAACACAATGAATTTTAACCGCACTTTGACATATTAAACGACGCGCCGAGTGAACATTGGCATTATGATTTATTTTGGTATAATAtttt > 1:20714/1‑251 (MQ=255) tACCCCAATCAAATCGGCGCGTGGTCGTTAGTGCATGCCAGCAAGTGGAGTGCCTGGGCGTTGTTGGTGGTAATGACATTCACCATCGTGGCGAACCTCAAACACATTAAACAAACGATTCGGGTGTCGAGGGATTAGGTGGAAAAAGTGCGGTCAAAAAACACAATGAATTTTAACCGCACTTTGACATATTAAACGACGCGCCGAGTGAACATTGGCATTATGATTTATCTTGGTATAATATTTTATAc < 1:607180/251‑1 (MQ=255) aaTCAAATCGGCGCGTGGTCGTTAGTGCATGCCAGCAAGTGGAGTGCCTGGGCGTTGTTGGTGGTAATGACATTCACCATCGTGGCGAACCTCAAACACATTAAACAAACGATTCGGGTGTCGAGGGATTAGGTGGAAAAAGTGCGGTCAAAAAACACAATGAATTTTAACCGCACTTTGACATATTAAACGACGCGCCGAGTGAACATTGGCATTATGATTTATTTTGGTATAATATTTTATACATTATg > 1:599645/1‑251 (MQ=255) 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1:526186/1‑174 (MQ=255) ggTGGAAAAAGTGCGGTCAAAAAACACAATGAATTTTAACCGCACTTTGACATATTAAACGACGCGCCGAGTGAACATTGGCATTATGATTTATTTTGGTATAATATTTTATACATTATGAGTAGGCAACAAATAGAACGGAAACCAATTCATTGGATTGGCTCTAGCTTAGAGGATGTTAAGGCGTTTCCGGATAATATAAAACGGGAATTAGGTTTCGATCTTGACCTCGTACAACAGGGGTTATCGc > 1:598585/1‑250 (MQ=255) tGGAAAAAGTGCGGTCAAAAAACACAATGAATTTTAACCGCACTTTGACATATTAAACGACGCGCCGAGTGAACATTGGCATTATGATTTATTTTGGTATAATATTTTATACATTATGAGTAGGCAACAAATAGAACGGAAACCAATTCATTGGATTGGCTCTAGCTTAGAGGATGTTAAGGCGTTTCCGGATAATATAAAACGGGAATTAGGTTTCGATCTTGACCTCGTACAACAGGGGTTATCGCCt > 1:869464/1‑250 (MQ=255) cGGTCAAAAAACACAATGAATTTTAACCGCACTTTGACATATTAAACGACGCGCCGAGTGAACATTGGCATTATGATTTATTTTGGTATAATATTTTATACATTATGAGTAGGCAACAAATAGAACGGAAACCAATTCATTGGATTGGCTCTAGCTTAGAGGATGTTAAGGCGTTTCCGGATAATATAAAACGGGAATTAGGTTTCGATCTTGACCTCGTACAACAGGGGTTATCGCCTCGGGATTTTAAg < 1:484538/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |