| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,160,838 | T→C | T126A (ACC→GCC) | unknown ← | Putative DNA‑binding protein in cluster with Type I restriction‑modification system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,160,838 | 0 | T | C | 100.0% | 211.2 / NA | 74 | T126A (ACC→GCC) | unknown | Putative DNA‑binding protein in cluster with Type I restriction‑modification system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (30/44); total (30/44) | |||||||||||
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GCAAACTTTCCGCCACAAGCAATGCTAATGCCACTAAAGTATTGTCATTAATCAATTGTTCTACCGGCCTTGCCAATAAGTGTTGATTCAACCGCAAATACCATAAAAACAGGAAAGATCCCGTGCGTTTATTGCCATCGGTCAACGGATGATTTTTGATAATAAAATACAATAAATTCGCCGCTCGGCTGGCAACATTCGGATAAAAAAGCGTGTCACCGAATCCTTGTTCAATCGTGGTAATGGCAGAGGCTAAACCGGAATTTCGTTGTTGTCCAAACAACGCCGTCGCTTCCCCTTTTTCCACTAACGCCTGTTTTAATTGAGAAATTGCCTGTAATACGTCATCTAACACCAACAGAACCATATTATTTTGCTTATGCTGATTAGCCGTTAGACTTTGCTCATCGTAAGCCTGTAACAAACTCCAACTCCTAGCATAATCCTGCACAACAGACAATACGGCTTTGCCTTCGTC > 1/1160598‑1161075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |