| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,159,377 | C→A | intergenic (‑229/‑129) | unknown ← / → unknown | GTP 3',8‑cyclase (EC 4.1.99.22)/FIG002813: LPPG:FO 2‑phospho‑L‑lactate transferase like, CofD‑like |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,159,377 | 0 | C | A | 100.0% | 16.7 / NA | 8 | intergenic (‑229/‑129) | unknown/unknown | GTP 3',8‑cyclase (EC 4.1.99.22)/FIG002813: LPPG:FO 2‑phospho‑L‑lactate transferase like, CofD‑like |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (1/7); total (1/7) | |||||||||||
GAATGGTTTGCATTTGACACCTTTCTAAAAACGGAGAGGATAAATCGTTTCCAACGTATCCCTGAATAATACGAACTGCGTATTATTGGCATTACCACCCTATTTTGAGACCAAAACGTAGGTTAAGTAAGCTCGGAGTTATATGCGTTAAATTAAGTTTTTCGTATTGTAAAAGATTAAATTCGGCAATTGCAATCAATTAATTTGATCTAGATTATAAAATAACAAAATTCTTTAAAATCAATTATATAATAAATTACATAACGATAAAAAATAACAATAAAAGGTATTTATCTACCTCATAATAATTATAAACTTACGATTTAAAATCATCGTTACTATTGCCGAAAACAAAATAAAGGAAAATAAAATGGCGGACTTTAACGGCTATCAACAACACGAAAATCTGAGCAAAATAAAAAAAATCGTGGCGATTGGCGGAGGACACGGATTAGGTCGGGTCATGTC > 1/1159136‑1159603 | gAATGGTTTGCATTTGACACCTTTCTAAAAACGGAGAGGATAAATCGTTTCCAACGTATCCCTGAATAATACGAACTGCGTATTATTGGCATTACCACCCTATTTTGAGACCAAAACGTAGGTTAAGTAAGCTCGGAGTTATATGCGTTAAATTAAGTTTTTCGTATTGTAAAAGATTAAATTCGGCAATTGCAATCAATTAATTTGATCTAGATTATAAAATAACAAAATTCTTTAAAATAAATtatata > 1:159962/1‑251 (MQ=255) tCGTTTCCAACGTATCCCTGAATAATACGAACTGCGTATTATTGGCATTACCACCCTATTTTGGGACCAAAACGTAGGTTAAGTAAGCTCGGAGTTATATGCGTTAAATTAAGTTTTTCGTATTGTAAAAGATTAAATTCGGCAATTGCAATCAATTAATTTGATCTAGATTATAAAATAACAAAATTCTTTAAAATAAATTATATAATAAATTACATAACGATAAAAAATAACAATAAAAGGTATTTATc < 1:84811/251‑1 (MQ=255) cTGCGTATTATTGGCATTACCACCCTATTTTGAGACCAAAACGTAGGTTAAGTAAGCTCGGAGTTATATGCGTTAAATTAAGTTTTTCGTATTGTAAAAGATTAAATTCGGCAATTGCAATCAATTAATTTGATCTAGATTATAAAATAACAAAATTCTTTAAAATAAATTATAtaataa < 1:775431/180‑1 (MQ=255) tattatTGGCATTACCACCCTATTTTGAGACCAAAACGTAGGTTAAGTAAGCTCGGAGTTATATGCGTTAAATTAAGTTTTTCGTATTGTAAAAGATTAAATTCGGCAATTGCAATCAATTAATTTGATCTAGATTATAAAATAACAAAATTCTTTAAAATAAATTATATAATAAATTACATAACGATAAAAAATAACAATAAAAGGTATTTATCTACCTCATAATAATTATAAACTTACGATTTAAAatc < 1:319026/251‑1 (MQ=255) agtaagCTCGGAGTTATATGCGTTAAATTAAGTTTTTCGTATTGTAAAAGATTAAATTCGGCAATTGCAATCAATTAATTTGATCTAGATTATAAAATAACAAAATTCTTTAAAATAAATTATATAATAAATTACATAACGATAAAAAATAACAATAAAAGGTATTTATCTACCTCATAATAATTATAAACTTACGATTTAAAATCATCGTTACTATTGCCg < 1:791676/222‑1 (MQ=255) gAGTTATATGCGTTAAATTAAGTTTTTCGTATTGTAAAAGATTAAATTCGGCAATTGCAATCAATTAATTTGATCTAGATTATAAAATAACAAAATTCTTTAAAATAAATTATATAATAAATTACATAACGATaaaaa < 1:254719/138‑1 (MQ=255) aGATTAAATTCGGCAATTGCAATCAATTAATTTGATCTAGATTATAAAATAACAAAATTCTTTAAAATAAATTATATAATAAATTACATAAc < 1:671463/92‑1 (MQ=255) taAAATAACAAAATTCTTTAAAATAAATTATATAATAAATTACATAACGATAAAAAATAACAATAAAAGGTATTTATCTACCTCATAATAATTATAAACTTACGATTTAAAATCATCGTTACTATTGCCGAAAACAAAATAAAGGAAAATAAAATGGCGGACTTTAACGGCTATCAACAACACGAAAATCTGAGCAAAATAAAAAAAATCGTGGCGATTGGCGGAGGACACGGATTAGGTCGGGTCATGTc < 1:901384/251‑1 (MQ=255) | GAATGGTTTGCATTTGACACCTTTCTAAAAACGGAGAGGATAAATCGTTTCCAACGTATCCCTGAATAATACGAACTGCGTATTATTGGCATTACCACCCTATTTTGAGACCAAAACGTAGGTTAAGTAAGCTCGGAGTTATATGCGTTAAATTAAGTTTTTCGTATTGTAAAAGATTAAATTCGGCAATTGCAATCAATTAATTTGATCTAGATTATAAAATAACAAAATTCTTTAAAATCAATTATATAATAAATTACATAACGATAAAAAATAACAATAAAAGGTATTTATCTACCTCATAATAATTATAAACTTACGATTTAAAATCATCGTTACTATTGCCGAAAACAAAATAAAGGAAAATAAAATGGCGGACTTTAACGGCTATCAACAACACGAAAATCTGAGCAAAATAAAAAAAATCGTGGCGATTGGCGGAGGACACGGATTAGGTCGGGTCATGTC > 1/1159136‑1159603 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |