| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,158,600 | A→G | S183S (TCT→TCC) | unknown ← | GTP 3',8‑cyclase (EC 4.1.99.22) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,158,600 | 0 | A | G | 100.0% | 169.2 / NA | 62 | S183S (TCT→TCC) | unknown | GTP 3',8‑cyclase (EC 4.1.99.22) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (32/30); total (32/30) | |||||||||||
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1:606771/1‑226 (MQ=255) tCTTTAATCCACGCCAGAAAACCGGAAAAATCCTTGTCATTTAAGTCTTTCATCAGCACGGAATTTACTTTGATTTTTTGATAGCCGCATTCAAAAGCGCGATCAATGCCACGCATAATGTCATCAAATTTATCTACGCCGGTAATCCGTTGGAACATTCTGACATCCAAGCTGTCAACACTTACATTAATGGATGTAATGCCGGCATTTTTCCAGTGCTCAACGTCTTTTAATAAACGAAATCCATtggt > 1:711313/1‑251 (MQ=255) tCTTTAATCCACGCCAGAAAACCGGAAAAATCCTTGTCATTTAAGTCTTTCATCAGCACGGAATTTACTTTGATTTTTTGATAGCCGCATTCAAAAGCGCGATCAATGCCACGCATAATGTCATCAAATTTATCTACGCCGGTAATCCGTTGGAACATTCTGACATCCAAGCTGTCAACACTTACATTAATGGATGTAATGCCGGCATTTTTCCAGTGCTCAACGTCTTTTAATAAACGAAATCCATtggt > 1:338485/1‑251 (MQ=255) tCTTTAATCCACGCCAGAAAACCGGAAAAATCCTTGTCATTTAAGTCTTTCATCAGCACGGAATTTACTTTGATTTTTTGATAGCCGCATTCAAAAGCGCGATCAATGCCACGCATAATGTCATCAAATTTATCTACGCCGGTAATCCGTTGGAACATTCTGACATCCAAGCTGTCAACACTTACATTAATGGATGTAATGCCGGCATTTTTCCAGTGCTCAACGTCTTTTAATAAACGAAATCCATtggt > 1:38718/1‑251 (MQ=255) cTTTAATCCACGCCAGAAAACCGGAAAAATCCTTGTCATTTAAGTCTTTCATCAGCACGGAATTTACTTTGATTTTTTGATAGCCGCATTCAAAAGCGCGATCAATGCCACGCATAATGTCATCAAATTTATCTACGCCGGTAATCCGTTGGAACATTCTGACATCCAAGCTGTCAacac < 1:805791/180‑1 (MQ=255) cTTTAATCCACGCCAGAAAACCGGAAAAATCCTTGTCATTTAAGTCTTTCATCAGCACGGAATTTACTTTGATTTTTTGATAGCCGCATTCAAAAGCGCGATCAATGCCACGCATAATGTCATCAAATTTATCTACGCCGGTAATCCGTTGGAACATTCTGACATCCAAGCTGTCAACACTTACATTAATGGATGTAATGCCGGCATTTTTCCAGTGCTCAACGTCTTTTAATAAACGAAATCCATtggtg > 1:656990/1‑251 (MQ=255) cACGCCAGAAAACCGGAAAAATCCTTGTCATTTAAGTCTTTCATCAGCACGGAATTTACTTTGATTTTTTGATAGCCGCATTCAAAAGCGCGATCAATGCCACGCATAATGTCATCAAATTTATCTACGCCGGTAATCCGTTGGAACATTCTGACATCCAAGCTGTCAACACTTACATTAATGGATGTAATGCCGGCATTTTTCCAGTGCTCAACGTCTTTTAATAAACGAAATCCATTGGTGGTTAAGGc < 1:225169/251‑1 (MQ=255) ccagaaaaccggaaaaATCCTTGTCATTTAAGTCTTTCATCAGCACGGAATTTACTTTGATTTTTTGATAGCCGCATTCAAAAGCGCGATCAATGCCACGCATAATGTCATCAAATTTATCTACGCCGGTAATCCGTTGGAACATTCTGACATCCAAGCTGTCAACACTTACATTAATg > 1:697329/1‑179 (MQ=255) aaccggaaaaATCCTTGTCATTTAAGTCTTTCATCAGCACGGAATTTACTTTGATTTTTTGATAGCCGCATTCAAAAGCGCGATCAATGCCACGCATAATGTCATCAAATTTATCTACGCCGGTAATCCGTTGGAACATTCTGACATCCAAGCTGTCAACACTTACATTAATGGATGTAATGCCGGCATTTTTCCAGTGCTCAACGTCTTTTAATAAACGAAATCCATTGGTGGTTAAGGCAATTTGTTTa < 1:77332/251‑1 (MQ=255) | AAATTTTTCTCATAAGGCATGATTAAGCCAATTTCGCCTACGTAATCCGGATGGCGAAACACTTTTGCTGGACCATCAGAGCGATTTTTCATCTGCAGCTGCCAACCTGAACGCAGTAATTTTTGTTCCAGTACCTGCCCGGATAAATGATGTCTTTGGAAGAAAGCATTCATCTCGCCGGTTTGCATTAATTCGATAAAACGCATCTGAATGGGCTTATCTTTAATCCACGCCAGAAAACCAGAAAAATCCTTGTCATTTAAGTCTTTCATCAGCACGGAATTTACTTTGATTTTTTGATAGCCGCATTCAAAAGCGCGATCAATGCCACGCATAATGTCATCAAATTTATCTACGCCGGTAATCCGTTGGAACATTCTGACATCCAAGCTGTCAACACTTACGTTAATGGATGTAATGCCGGCATTTTTCCAGTGCTCAACGTCTTTTAATAAACGAAATCCATTGGTGGTTAAGGCAATTTGTTTA > 1/1158358‑1158846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |