| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,153,497 | T→C | I109V (ATT→GTT) | unknown ← | Transcriptional regulator/sugar kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,153,497 | 0 | T | C | 100.0% | 162.7 / NA | 59 | I109V (ATT→GTT) | unknown | Transcriptional regulator/sugar kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (27/32); total (27/32) | |||||||||||
TGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTCTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAATGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCAAAATAATTTCAAACCGATCCTCCATTAACGTGGCACATAAAGCTTGCCAATAAAACGGCGAAACACACAGGGCAATGGCAGGACGTCCGCGGTTGTCGGTATTTCTTGAGGTTTTTTCCATAATCAATCGTTTTTCAATGAGGGAACGGCTCAACGATGTAATGGATGCCGGCGCTAAACCGGAAAGTTTTGATAATTCAATAC > 1/1153254‑1153736 | tGAAATATTCGGCAATTAAAATCGGAATATTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGt < 1:376526/251‑1 (MQ=255) 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atTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCaataa > 1:664393/1‑230 (MQ=255) atTGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGTGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCa > 1:177685/1‑251 (MQ=255) ttGAAATACGGTGTAAACAAGGATTTCAGATCCAAATGGGCGAATTTCGTACATCCCAGTTTAATTAAATAACCATTTTTATCCAATTCACCGCCCACGGTAACGGAAAAGGTTATCGGGCGGGCAAGTGAGCGGGTTTCAGCCAGAAATTGTTTGACGCTTTTTACCAGAAATTTATCCAGACATTTTAAATCATCTTTTTGCAAGGGGAAAACGCTTTGTTCAATAATTACGCCGTCCAATTCACTCaa > 1:98534/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |