| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,151,679 | G→A | W519* (TGG→TAG) | unknown → | Autoinducer 2 (AI‑2) kinase LsrK (EC 2.7.1.‑) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,151,679 | 0 | G | A | 100.0% | 152.1 / NA | 57 | W519* (TGG→TAG) | unknown | Autoinducer 2 (AI‑2) kinase LsrK (EC 2.7.1.‑) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (32/25); total (32/25) | |||||||||||
GATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATTCGACCTTAGCCGAGGTGGGGGAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATACTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTGGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAACGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACTTTTATGCCACCGGTTCCGTTTGCATATACGTCAAGCGGTCGATGTCGGTGATGAAACGGCTGAGATCTTGTTCTTCCGGTTTGTGAATATAAGAAACCTCACCCAGCAGTGGCGCATCGACTTTTTGTTTTAGGGTTTCG > 1/1151436‑1151925 | gATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAGTTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGc < 1:357319/250‑1 (MQ=255)gATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTTAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATTCCCAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCa > 1:23436/1‑251 (MQ=255) aCGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAAATGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAAAGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAgg > 1:599234/1‑251 (MQ=255) aCATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAg < 1:712643/251‑1 (MQ=255) 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1:27116/1‑250 (MQ=255) cAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACTTTTATGCCACCGGTTCCGTTTGCATATACGTCAAGCGGTCGATGTCGGTGATGAAACGGCTGAGATCTTGTTCTTCCGGTTTGTGAATATAAGAAACCTCAcc > 1:630810/1‑250 (MQ=255) cAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACTTTTATGCCACCGGTTCCGTTTGCATATACGTCAAGCGGTCGATGTCGGTGATGAAACGGCTGAGATCTTGTTCTTCCGGTTTGTGAATATAAGAAACCTCAcc > 1:838170/1‑250 (MQ=255) aCTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACTTTTATGCCACCGGTTCCGTTTGCATATACGt < 1:716658/170‑1 (MQ=255) 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1:643981/1‑191 (MQ=255) ttAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACTTTTATGCCACCGGTTCCGTTTGCATATACGTCAAGCGGTCGATGTCGGTGATGAAACGGCTGAGATCTTGTTCTTCCGGTTtgtg > 1:814116/1‑208 (MQ=255) aaCTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACttt > 1:412656/1‑123 (MQ=255) aaCTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACTTTTATGCCACCGGTTCCGTTTGCATATACGTCAAGCGGTCGATGTCGGTGATGAAACGGCTGAGATc > 1:184798/1‑188 (MQ=255) tcttTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAAc < 1:698478/93‑1 (MQ=255) tcttTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACTTTTATGCCACCGGTTCCGTTTGCATATACGTCAAGCGGTCGATGTCGGTGATGAAACGGCTGAGATCTTGTTCTTCCGGTTTGTGAATATAAGAAACCTCACCCAGCAGTGGCGCATCGACTTTTTGTTTTAGGGtt > 1:538981/1‑251 (MQ=255) tcttTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACTTTTATGCCACCGGTTCCGTTTGCATATACGTCAAGCGGTCGATGTCGGTGATGAAACGGCTGAGATCTTGTTCTTCCGGTTTGTGAATATAAGAAACCTCACCCAGCAGTGGCGCATCGACTTTTTGTTTTAGGGtt > 1:6593/1‑251 (MQ=255) tttGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACTTTTATGCCACCGGTTCCGTTTGCATATACGTCAAGCGGTCGATGTCGGTGATGAAACGGCTGAGATCTTGTTCTTCCGGTTTGTGAATATAAGAAACCTCACCCAGCAGTGgcg < 1:212139/226‑1 (MQ=255) ttGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACTTTTATGCCACCGGTTCCGTTTGCATATACGTCAAGCGGTCGATGTCGGTGATGAAACGGCTGAGATCTTGTTCTTCCGGTTTGTGAATATAAGAAACCTCACCCAGCAGTGGCGCATCGACTTTTTGTTTTAGGGTTTCg > 1:687962/1‑251 (MQ=255) | GATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATTCGACCTTAGCCGAGGTGGGGGAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATACTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTGGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAACGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCCACCGCACTTTTATGCCACCGGTTCCGTTTGCATATACGTCAAGCGGTCGATGTCGGTGATGAAACGGCTGAGATCTTGTTCTTCCGGTTTGTGAATATAAGAAACCTCACCCAGCAGTGGCGCATCGACTTTTTGTTTTAGGGTTTCG > 1/1151436‑1151925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |