| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,151,540 | G→A | E473K (GAA→AAA) | unknown → | Autoinducer 2 (AI‑2) kinase LsrK (EC 2.7.1.‑) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,151,540 | 0 | G | A | 90.3% | 134.7 / ‑4.4 | 62 | E473K (GAA→AAA) | unknown | Autoinducer 2 (AI‑2) kinase LsrK (EC 2.7.1.‑) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/0); new base A (29/27); total (35/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.12e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GAAGAAAATGCTGCTATCGTTTCTTCCTGCAATTTGGATCAGGTGCAAAAATTCTCAGGAGTTAAATTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATTCGACCTTAGCCGAGGTGGGGGAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATACTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTGGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAACGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCC > 1/1151297‑1151777 | gaagaaAATGCTGCTATCGTTTCTTCCTGCAATTTGGATCAGGTGCAAAAATTCTCAGGAGTTAAATTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAAc < 1:751800/250‑1 (MQ=255) ttcttcCTGCAATTTGGATCAGGTGCAAAAATTCTCAGGAGTTAAATTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAAtt < 1:482650/240‑1 (MQ=255) aTTTGGATCAGGTGCAAAAATTCTCAGGAGTTAAATTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAAt < 1:363283/251‑1 (MQ=255) aTTTGGATCAGGTGCAAAAATTCTCAGGAGTTAAATTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAAATGGGTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAAt > 1:598396/1‑251 (MQ=255) gTGCAAAAATTCTCAGGAGTTAAATTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGGAAAAACTGGTTAAATTTTAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTa > 1:872627/1‑251 (MQ=255) gTGCAAAAATTCTCAGGAGTTAAATTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTa > 1:439114/1‑251 (MQ=255) cAAAAATTCTCAGGAGTTAAATTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGc < 1:870574/251‑1 (MQ=255) aTTCTCAGGAGTTAAATTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTtat > 1:584872/1‑251 (MQ=255) tctcAGGAGTTAAATTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGGCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATAc < 1:442103/251‑1 (MQ=255) aaaTTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACaa < 1:859423/251‑1 (MQ=255) aTTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAg > 1:774717/1‑251 (MQ=255) aaCCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGcac < 1:348556/251‑1 (MQ=255) ccATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGcac < 1:423088/246‑1 (MQ=255) ccATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATgg < 1:195019/251‑1 (MQ=255) aTTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGc < 1:824343/251‑1 (MQ=255) gTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAAtt < 1:158142/182‑1 (MQ=255) gTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAAcc < 1:407676/200‑1 (MQ=255) cTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATa < 1:864446/251‑1 (MQ=255) gtttAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGGAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAAAAAt > 1:871066/4‑251 (MQ=255) gTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCTCAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAAt > 1:216211/1‑251 (MQ=255) tCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGGAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCa > 1:400175/1‑209 (MQ=255) ggCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATAc < 1:728920/201‑1 (MQ=255) gCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAAc < 1:245507/249‑1 (MQ=255) cAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGGAAAAACTGGGTAAATTTGAACGGCAACATCAAACGAATTCCGATAACTAAGGTTTTTACCAAGCTCAAAAAGCAAAATGGGCAGAAATTTATAAAAAACAATTACAACTgg > 1:78209/1‑251 (MQ=255) gAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGGAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAAAAATTACAACTGGTTGATAGCg > 1:201116/1‑251 (MQ=255) aGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATgg < 1:198405/210‑1 (MQ=255) gATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATGACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTg > 1:429467/1‑235 (MQ=255) 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gATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGGTGATAGCGGATTAACTACTTCttt > 1:99631/1‑251 (MQ=255) gATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAGTTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGc < 1:357319/250‑1 (MQ=255) gATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTTAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATTCCCAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCa > 1:23436/1‑251 (MQ=255) gATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATAc > 1:90446/1‑164 (MQ=255) aCGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGcac < 1:346797/175‑1 (MQ=255) aCGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTtat > 1:677111/1‑192 (MQ=255) aCGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAAATGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAAAGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAgg > 1:599234/1‑251 (MQ=255) aCATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAg < 1:712643/251‑1 (MQ=255) cATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATAc > 1:91793/1‑151 (MQ=255) tGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATaa > 1:678313/1‑251 (MQ=255) gcgcTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCCACATCAACCGAATCCCGATAACTATGc > 1:823838/1‑119 (MQ=255) gcgcTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAAc < 1:652220/100‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGc > 1:820824/1‑119 (MQ=255) 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< 1:292046/250‑1 (MQ=255) gCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTaaaa > 1:194914/1‑251 (MQ=255) gCATTTATCCGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAACTCACAAAGCACAAAGTGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTATGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTaaaa > 1:551592/1‑251 (MQ=255) tatccGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAacta > 1:125405/5‑154 (MQ=255) tatccGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACAt > 1:33208/5‑251 (MQ=255) atccGACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACAt > 1:113542/4‑250 (MQ=255) gACCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTtgtag > 1:410807/1‑158 (MQ=255) aCCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGc > 1:609791/1‑83 (MQ=255) aCCTTAGCCGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTaa > 1:538333/1‑251 (MQ=255) ccGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAAccc < 1:303988/249‑1 (MQ=255) ccGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAAccc < 1:822620/249‑1 (MQ=255) ccGAGGCGGGGAAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATATTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTAGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAATGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAAccc < 1:548765/249‑1 (MQ=255) | GAAGAAAATGCTGCTATCGTTTCTTCCTGCAATTTGGATCAGGTGCAAAAATTCTCAGGAGTTAAATTAACCTCCATTGTCTTTGCCGGCGGCGGGTCTAAAGGCAAATTATGGAGCCAGATCTTAGCCGATGTCACCGGATTAACGGTAAACATTCCGATTGTCAAAGAAGCTACAGCGCTGGGTTGTGCCATTGCCGCAGGCGTCGGAGTCGGCATTTATTCGACCTTAGCCGAGGTGGGGGAAAAACTGGTTAAATTTGAACGGCAACATCAACCGAATCCCGATAACTATGCTTTATACCAAGCTCACAAAGCACAATGGGCAGATACTTATAAAAAACAATTACAACTGGTTGATAGCGGATTAACTACTTCTTTGTGGAAGGCACCAGGGTTGTAGCGAACGATAAAAAAATCGTAGGGGGGACAACTCTCTACGATTTTTTGTTGATATACCGTAAAAAACATCGGTAAAACCC > 1/1151297‑1151777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |