| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,150,382 | A→C | S87R (AGT→CGT) | unknown → | Autoinducer 2 (AI‑2) kinase LsrK (EC 2.7.1.‑) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,150,382 | 0 | A | C | 100.0% | 264.1 / NA | 91 | S87R (AGT→CGT) | unknown | Autoinducer 2 (AI‑2) kinase LsrK (EC 2.7.1.‑) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (41/50); total (41/50) | |||||||||||
CTGTTTACCTGATGGCATTAGATGCCGGCACAGGAAGTGTTCGGGCGGTTATTTTTGATTTAGACGGTAATCAAATCGCCGCCGCTCAACGGGAATGGACGCACTTATCCGATCCCGATATTCCCGGTTCAATGGAATTTGATTTAGCCAATAATTGGCAGTTAACCTGCGATTGTATTCGTCAAGTATTGAATAAATCTCAAGTTCAGCCACAGCAAATTGCCGCCATTTCCACCTGTTCCATGAGTGAAGGAATCGTACTTTACGATGAGCATAAAACACCGATTTGGGCGTGTGGTAACGTAGATGCCCGTGCGGTGGAAGAAGTCAAAGAGCTAAAAACGCTACATAACTATACGTTTGAACAACAGCTGTATTCCGTCTCCGGTCAAACGTTGGCACTGAGCGCCGTTCCCCGCCTACTATGGCTGGCACATCATCGCCCCGATATTTATCGCCACACTAAAGCCATTTCCATGATCAGCGAT > 1/1150137‑1150624 | cTGTTTACCTGATGGCATTAGATGCCGGCACAGGAAGTGTTCGGGCGGTTATTTTTGATTTAGACGGTAATCAAATCGCCGCCGCTCAACGGGAATGGACGCACTTATCCGATCCCGATATTCCCGGTTCAATGGAATTTGATTTAGCCAATAATTGGCAGTTAACCTGCGATTGTATTCGTCAAGTATTGAATAAATCTCAAGTTCAGCCACAGCAAATTGCCGCCATTTCCACCTGTTCCATGCGTGaa > 1:394611/1‑251 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |