| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 155,826 | G→A | intergenic (‑240/+59) | unknown ← / ← unknown | Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72)/Transcriptional regulator, MerR family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 155,826 | 0 | G | A | 100.0% | 126.5 / NA | 47 | intergenic (‑240/+59) | unknown/unknown | Type I restriction‑modification system, DNA‑methyltransferase subunit M (EC 2.1.1.72)/Transcriptional regulator, MerR family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (23/24); total (23/24) | |||||||||||
TTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCGTGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCATTTTTTGTAACGCCTGTATTTGGTCGTTTAAGGTTTCAATGTGTTGCGCGGTGAGTTTTTTCACTTCGCGGCTGTTGCGTTGCGGGTTGTCTTGTAAT > 1/155593‑156068 | gattaagccaagcacaatgtgtttgtagttggcggcgtcgagttgctggcggagacggtcggcggaagaccaaagtttttcgtcgaggtcgtttaggaaggcttgttgtgtggctgaattttcaacataatcttggtggcttctggcttctgCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCATGAGAGATTTTTTAAtt > 1:693288‑M2/153‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) gtgCATGTTTAAAAGATAAGCATGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCATTTTTTGTAACGCCTGTATTTGGTCGTTTAAGGTTTCAATGTGTTGCGCGGTGAGTTTTTTCAc < 1:566808/230‑1 (MQ=255) gtgCATGTTTAAAAGATAAGCATGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCATTTTTTGTAACGCCTGTATTTGGTCGTTTAAGGTTTCAATGTGTTGCGCGGTGAGTTTTTTCACTTCGCGGCTGTTGCGTTGCgg > 1:642345/1‑251 (MQ=255) gtgCATGTTTAAAAGATAAGCATGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCATTTTTTGTAACGCCTGTATTTGGTCGTTTAAGGTTTCAATGTGTTGCGCGGTGAGTTTTTTCACTTCGCGGCTGTTGCGTTGCgg > 1:271480/1‑251 (MQ=255) 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aaGATAAGCATGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCATTTTTTGTAACGCCTGTATTTGGTCGTTTAAGGTTTCAATGTGTTGCGCGGTGAGTTTTTTCACTTCGCGGCTGTTGCGTTGCGGGTTGTCTTGTaa < 1:876366/251‑1 (MQ=255) aaGATAAGCATGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCATTTTTTGTAACGCCTGTATTTGGTCGTTTAAGGTTTCAATGTGTTGCGCGCTGaaaccggttttttg < 1:195443/221‑14 (MQ=255) aTAAGCATGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCATTTTTTGTAACGCCTGTATTTGGTCGTTTAAGGTTTCAATGTGTTGCGCGGTGAGTTTTTTCACTTCGCGGCTGTTGCGTTGCGGGTTGTCTTGTAAt < 1:867525/249‑1 (MQ=255) | TTTGTAGTTGGCGGCGTCGAGTTGCTGGCGGAGACGGTCGGCGGAAGACCAAAGTTTTTCGTCGAGGTCGTTTAGGAAGGCTTGTTGTGTGGCTGAATTTTCAACATAATCTTGGTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGGCTTCTGCATAAAATTTGTCCTTTGTAAAGTGAGTAAATAAAAAAATATACCTATTTTATAGGAATTGTGCATGTTTAAAAGATAAGCGTGAGAGATTTTTTAATTATATTTCTACTTAAAATTGCAATGAAAAATCACCGCACTTTTCACTCACTCAAGCCCTCCAAAATCGAGCATTCCGGGCAGTCGTTACCTTGGCAGTTGTCGTGCCAACGTTGCAGTTCGGTGACCATTTTTTGTAACGCCTGTATTTGGTCGTTTAAGGTTTCAATGTGTTGCGCGGTGAGTTTTTTCACTTCGCGGCTGTTGCGTTGCGGGTTGTCTTGTAAT > 1/155593‑156068 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |