| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,141,415 | T→G | T75T (ACA→ACC) | unknown ← | Minor pilin of type IV secretion complex, VirB5 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,141,415 | 0 | T | G | 100.0% | 220.7 / NA | 77 | T75T (ACA→ACC) | unknown | Minor pilin of type IV secretion complex, VirB5 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (40/37); total (40/37) | |||||||||||
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tataaaCTATGCGCTTCACCAATAAAGGCTTGTACATCACGAATTCCGGTCTGTGAGGCTAATTGGTCGGCATACGCCTTGAGTTCGTTTTTGTAATGAGATACGGTTTCTGTCCATTGTTTTGCTTCTTTTGCCCACTGTTGAACAGTTTGTAACATACTGATTTGCCGTTGACCTGCAGCAGCACCATCAACTACCGGAATACCGCTAGCTTGAACTAATGCCGGTATAGACAAGACAGCAATTAAAGt > 1:735545/4‑251 (MQ=255) ataaaCTATGCGCTTCACCAATAAAGGCTTGTACATCACGAATTCCGGTCTGTGAGGCTAATTGGTCGGCATACGCCTTGAGTTCGTTTTTGTAATGAGATACGGTTTCTGTCCATTGTTTTGCTTCTTTTGCCCACTGTTGAACAGTTTgtaac > 1:783842/3‑151 (MQ=255) aaaCTATGCGCTTCACCAATAAAGGCTTGTACATCACGAATTCCGGTCTGTGAGGCTAATTGGTCGGCATACGCCTTGAGTTCGTTTTTGTAATGAGATACGGTTTCTGTCCATTGTTTTGCTTCTTTTGCCCACTGTTGAACAGTTTgtaacatac > 1:463491/1‑149 (MQ=255) aCTATGCGCTTCACCAATAAAGGCTTGTACATCACGAATTCCGGTCTGTGAGGCTAATTGGTCGGCATACGCCTTGAGTTCGTTTTTGTAATGAGATACGGTTTCTGTCCATTGTTTTGCTTCTTTTGCCCACTGTTGAACAGTTTgtaacatac < 1:305237/155‑9 (MQ=255) 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cACGAATTCCGGTCTGTGAGGCTAATTGGTCGGCATACGCCTTGAGTTCGTTTTTGTAATGAGATACGGTTTCTGTCCATTGTTTTGCTTCTTTTGCCCACTGTTGAACAGTTTGTAACATACTGATTTGCCGTTGACCTGCAGCAGCACCATCAACTACCGGAATACCGCTAGCTTGAACTAATGCCGGTATAGACAAGACAGCAATTAAAGTGAGTTTTTTAAAGATTTTCATTACGTTCTCCTTATac < 1:725014/251‑1 (MQ=255) cACGAATTCCGGTCTGTGAGGCTAATTGGTCGGCATACGCCTTGAGTTCGTTTTTGTAATGAGATACGGTTTCTGTCCATTGTTTTGCTTCTTTTGCCCACTGTTGAACAGTTTGTAACATACTGATTTGCCGTTGACCTGCAGCAGCACCATCAACTACCGGAATACCGCTAGCTTGAACTAATGCCGGTATAGACAAGACAGCAATTAAAGTGAGTTTTTTAAAGATTTTCATTACGTTCTCCTTATac < 1:691574/251‑1 (MQ=255) cACGAATTCCGGTCTGTGAGGCTAATTGGTCGGCATACGCCTTGAGTTCGTTTTTGTAATGAGATACGGTTTCTGTCCATTGTTTTGCTTCTTTTGCCCACTGTTGAACAGTTTGTAACATACTGATTTGCCGTTGACCTGCAGCAGCACCATCAACTACCGGAATACCGCTAGCTTGAACTAATGCCGGTATAGACAAGACAGCAATTAAAGTGAGTTTTTTAAAGATTTTCATTACGTTCTCCTTATac < 1:294045/251‑1 (MQ=255) 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aTTCCGGTCTGTGAGGCTAATTGGTCGGCATACGCCTTGAGTTCGTTTTTGTAATGAGATACGGTTTCTGTCCATTGTTTTGCTTCTTTTGCCCACTGTTGAACAGTTTGTAACATACTGATTTGCCGTTGACCTGCAGCAGCACCATCAACTACCGGAATACCGCTAGCTTGAACTAATGCCGGTATAGACAAGACAGCAATTAAAGTGAGTTTTTTAAAGATTTTCATTACGTTCTCCTTATACACaa > 1:342920/1‑250 (MQ=255) aTTCCGGTCTGTGAGGCTAATTGGTCGGCATACGCCTTGAGTTCGTTTTTGTAATGAGATACGGTTTCTGTCCATTGTTTTGCTTCTTTTGCCCACTGTTGAACAGTTTGTAACATACTGATTTGCCGTTGACCTGCAGCAGCACCATCAACTACCGGAATACCGCTAGCTTGAACTAATGCCGGTATAGACAAGACAGCAATTAAAGTGAGTTTTTTAAAGATTTTCATTACGTTCTCCTTATACACAAc < 1:799367/251‑1 (MQ=255) | AGCTCATACTTTCCACGGTGGAAACAATATTTGCTTCACAGGAAGTAATTTCACCTTGACGTAAATTCTTACAACGGTCAAAAAGGTTGTATTTTTCAAACAGGCTTTTAGCATTCGCGCTTAATGCGTTTTTCCCACCGGAAACTAAATCGATTACCGGGGTAAACTCCGATTTTAAGCCATTTATTTCACCATACAAACTATGCGCTTCACCAATAAAGGCTTGTACATCACGAATTCCTGTCTGTGAGGCTAATTGGTCGGCATACGCTTTCAGCTCATTTTTATAATGCGAAACTGTATCCGTCCACTGTTTAGCCTCTTTTGCCCATTGTTGCACCGTTTGAAGCATGCTCATTTGACGTTGACCGGCAGCTGCGGCATCAACAACCGGAATACCGCTGGCTTGTACCAATACCGGCATAGATAAAACAGCAATTAAAGTGAGTTTTTTAAACATTTTCATCACGTTCTCCTTATACACAAC > 1/1141174‑1141660 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |