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attAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTGACATCTTGAGATTTTGTCATCCGTTTAGCGAGTTTATCAATAGTTTTCAATTTACTATTGACGTTACTTTCAAACGAATCTAAGAAGCTCATACTCTCCACGGTGGAAACAATATTTGCTTCACAAGAAGTGAttt > 1:619408/1‑250 (MQ=255) aGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTGACATCTTGAGATTTTGTCATCCGTTTAGCGAGTTTATCAATAGTTTTCAATTTACTATTGACGTTACTTTCAAACGAATCTAAGAAGCTCATACTCTCCACGGTGGAAACAATATTTGCTTCACAAGAAGTGATTTCAc < 1:794316/249‑1 (MQ=255) gCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTGACATCTTGAGATTTTGTCATCCGTTTAGCGAGTTTATCAATAGTTTTCAATTTACTATTGACGTTACTTTCAAACGAATCTAAGAAGCTCATACTCTCCACGGTGGAAACAATATTTGCTTCACAAGAAGTGATTTCACCtt > 1:772400/1‑251 (MQ=255) gCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTGACATCTTGAGATTTTGTCATCCGTTTAGCGAGTTTATCAATAGTTTTCAATTTACTATTGACGTTACTTTCAAACGAATCTAAGAAGCTCATACTCTCCACGGTGGAAACAATATTTGCTTCACAAGAAGTGATTTCACCtt > 1:18114/1‑251 (MQ=255) | TAGAATTTGCCATCAGCGGTTCGGCTTTTTTCTCACATTCTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCCACACTTTTAACTTCTTCTGAACAAGCACTTAAAGTTAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCGTATTAATTGAATATAACGCCCTTAACGTTTGAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTCGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTTACATCGTTTGATTTCGCCATACGATTAGCTAACTTATCAATTGCTTTAAGTTTGCTATTGACATTACTTTCAAACGAATCTAAGAAGCTCATACTTTCCACGGTGGAAACAATATTTGCTTCACAGGAAGTAATTTCACCTT > 1/1140741‑1141230 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |