| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,140,862 | T→G | L11F (TTA→TTC) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,140,862 | 0 | T | G | 100.0% | 153.9 / NA | 54 | L11F (TTA→TTC) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (30/24); total (30/24) | |||||||||||
TAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAACACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCGTTTCGACAATTAGAATTTGCCATCAGCGGTTCGGCTTTTTTCTCACATTCTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCCACACTTTTAACTTCTTCTGAACAAGCACTTAAAGTTAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCGTATTAATTGAATATAACGCCCTTAACGTTTGAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTCGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTTACATCGTTTGATTT > 1/1140616‑1141102 | tAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAata > 1:26331/1‑251 (MQ=255) aaTAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATataaat < 1:434107/250‑1 (MQ=255) aaTAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATataaat < 1:802634/250‑1 (MQ=255) ctcAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCa > 1:288558/1‑251 (MQ=255) ctcATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATataaat < 1:160224/219‑1 (MQ=255) ctcATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGc < 1:225026/224‑1 (MQ=255) cATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATataaat > 1:304672/1‑217 (MQ=255) cATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATataaat > 1:328825/1‑217 (MQ=255) aaTGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCatat > 1:649048/1‑251 (MQ=255) aTGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATataaat > 1:198681/1‑213 (MQ=255) aTGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATataaat > 1:325351/1‑213 (MQ=255) aTGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATAtt > 1:349590/1‑251 (MQ=255) aTAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTag < 1:384385/250‑2 (MQ=255) aaCCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTg < 1:524314/251‑1 (MQ=255) aCCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGa > 1:326000/1‑251 (MQ=255) aaTTAGTAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAatat < 1:47796/251‑1 (MQ=255) aaTTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAatat < 1:584480/251‑1 (MQ=255) aaaaaTTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGc < 1:229055/250‑1 (MQ=255) cacCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACg < 1:505105/249‑1 (MQ=255) cacCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGtt > 1:512594/1‑251 (MQ=255) ttCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATataaat > 1:223406/1‑177 (MQ=255) gTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACg > 1:800828/1‑250 (MQ=255) gAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTagtt < 1:324995/209‑4 (MQ=255) tgcttgTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGc > 1:743181/1‑213 (MQ=255) gCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACg < 1:737249/214‑1 (MQ=255) tggagtttgccattaatggctccgCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTc < 1:6414/228‑1 (MQ=255) ccattaatggctccgCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCg > 1:717084/15‑251 (MQ=255) attaatggctccgCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTg > 1:397596/13‑251 (MQ=255) ctccgCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAAt < 1:562322/247‑1 (MQ=255) tttGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGc < 1:440719/251‑1 (MQ=255) cGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCg < 1:797689/189‑1 (MQ=255) cGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACg < 1:71402/251‑1 (MQ=255) tATGTTCTTTGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTc < 1:513579/251‑1 (MQ=255) ttGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCAt < 1:642599/251‑1 (MQ=255) ttGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCAt > 1:671280/1‑251 (MQ=255) ttGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTAAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCAt > 1:789229/1‑251 (MQ=255) gTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGt < 1:887528/189‑1 (MQ=255) gTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCAttt > 1:794007/1‑251 (MQ=255) actctacgcTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATg > 1:707196/9‑220 (MQ=255) acgcTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAat > 1:862852/4‑91 (MQ=255) cTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACg > 1:664226/1‑103 (MQ=255) cTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTgaga < 1:36908/120‑1 (MQ=255) cttctGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGt > 1:810910/1‑155 (MQ=255) cttctGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTtg > 1:196661/1‑191 (MQ=255) cttctGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTc < 1:867596/218‑1 (MQ=255) cttctGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGctttctttgac < 1:751658/251‑4 (MQ=255) tctGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTGACAt > 1:231767/1‑251 (MQ=255) gAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTGACATctt > 1:742822/1‑249 (MQ=255) cACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACg > 1:444707/1‑81 (MQ=255) cACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCAc > 1:489380/1‑203 (MQ=255) cACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTGACATcttgagattt > 1:403913/1‑242 (MQ=255) cACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTGACATcttgagatt < 1:121813/250‑9 (MQ=255) cACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTGACATcttgag > 1:256274/1‑242 (MQ=255) cTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTc > 1:34677/1‑222 (MQ=255) | TAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAACACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCGTTTCGACAATTAGAATTTGCCATCAGCGGTTCGGCTTTTTTCTCACATTCTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCCACACTTTTAACTTCTTCTGAACAAGCACTTAAAGTTAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCGTATTAATTGAATATAACGCCCTTAACGTTTGAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTCGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTTTTTAAGTCCTGGCTTTCTTTTACATCGTTTGATTT > 1/1140616‑1141102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |