| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,140,826 | C→T | V23V (GTG→GTA) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,140,826 | 0 | C | T | 100.0% | 182.3 / NA | 64 | V23V (GTG→GTA) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (29/35); total (29/35) | |||||||||||
TTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCCAATAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAACACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCGTTTCGACAATTAGAATTTGCCATCAGCGGTTCGGCTTTTTTCTCACATTCTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCCACACTTTTAACTTCTTCTGAACAAGCACTTAAAGTTAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCGTATTAATTGAATATAACGCCCTTAACGTTTGAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTCGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTT > 1/1140584‑1141067 | ctGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAATTGGAGTTTGCCATTAATGGCTCCGCTTTTTTCTCACATTTTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCTACGCtttt > 1:429156/2‑251 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ttGTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTAAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCAt > 1:789229/1‑251 (MQ=255) gTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGt < 1:887528/189‑1 (MQ=255) gTAATACTCTACGCTTTTAACCTCTTCTGAACAGGCACTTAAAGTGAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCATATTAGTTGAATATAACGCCCTTAACGTTTAAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTAGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCAttt > 1:794007/1‑251 (MQ=255) | TTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCCAATAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAACACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCGTTTCGACAATTAGAATTTGCCATCAGCGGTTCGGCTTTTTTCTCACATTCTTCTAACATTTTTTGACGTTCAGTCGTATGTTCTTTGTAATACTCCACACTTTTAACTTCTTCTGAACAAGCACTTAAAGTTAATATAAATAATGCGATAAAAAGTTTTTTCATCTTTTACTCCGTATTAATTGAATATAACGCCCTTAACGTTTGAGCGACGTTGAGACGCTAACTGTTTTTGTTGCTCATTCATTAAGCGTCGGTATTCCGTTTGCCGTGCGTTGAATAAATCCAACTGGACTTTTTGTGATTGCAATGCGGCCAACTGCACGTCCATTGCATTT > 1/1140584‑1141067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |