| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,140,499 | C→T | K53K (AAG→AAA) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,140,499 | 0 | C | T | 100.0% | 220.0 / NA | 82 | K53K (AAG→AAA) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (41/41); total (41/41) | |||||||||||
GACATATTTAGATTTATCTAGATCAAAGAGTTGACCAGCAATATCCGATCCTAATTCCAATTGGTCATCCATTAAACCGGCTATACCGTTTCCGGTAAAGCCGGTTAAGCTAGTTTTGAGATCATCAATTATCGCTAAAGAGTTATCCAGATACCCTCCATAATTCATCATAAATGCTACAATGATCATTTTTGTGGCAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATCTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTTACGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGTTAGCAAAATTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCCAATAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAACACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCGTTTCGACAATTAGAA > 1/1140265‑1140745 | ttgtcatccgtcggctgaatggttttgttatcgttcatctctgcctcctatcgttcgtctcttgccacatttggcgaaatggttgtgttataagaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACgg < 1:277751‑M2/142‑1 (MQ=255) gttcatctctgcctcctatcgttcgtctcttgccacatttggcgaaatggttgtgttataagaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATGTTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAgt > 1:90798‑M2/78‑251 (MQ=255) gcctcctatcgttcgtctcttgccacatttggcgaaatggttgtgttataagaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACgg > 1:149953‑M2/68‑209 (MQ=255) gcctcctatcgttcgtctcttgccacatttggcgaaatggttgtgttataagaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCaa > 1:37942‑M2/68‑251 (MQ=255) cctcctatcgttcgtctcttgccacatttggcgaaatggttgtgttataagaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCaat < 1:138048‑M2/185‑1 (MQ=255) cctatcgttcgtctcttgccacatttggcgaaatggttgtgttataagaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCaataat < 1:54768‑M2/188‑1 (MQ=255) cctatcgttcgtctcttgccacatttggcgaaatggttgtgttataagaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCaataat > 1:224522‑M2/64‑251 (MQ=255) catttggcgaaatggttgtgttataagaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCaaa > 1:710751‑M2/43‑251 (MQ=255) ttgtgttataagaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGa < 1:291681‑M2/224‑1 (MQ=255) tgtgttataagaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGAt < 1:649167‑M2/225‑1 (MQ=255) ttataagaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGAc < 1:218607‑M2/229‑1 (MQ=255) gaaaccggcgttttaaCTAGTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTaa > 1:26449‑M2/17‑248 (MQ=255) gTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTc > 1:450193/1‑168 (MQ=255) gTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAgtgtcatgc < 1:836005/178‑6 (MQ=255) gTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTaa < 1:871753/190‑1 (MQ=255) gTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAg < 1:151066/194‑1 (MQ=255) gTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGAt > 1:605751/1‑222 (MQ=255) gTTTTAAGATCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGAc > 1:486337/1‑226 (MQ=255) tttaagaTCATCAATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGa < 1:223851/247‑1 (MQ=255) catcaATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATctagt < 1:484124/230‑5 (MQ=255) atcaATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTg < 1:236837/176‑1 (MQ=255) caATTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATa < 1:383339/251‑1 (MQ=255) aaTTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATAc < 1:561047/251‑1 (MQ=255) aTTATCGATAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATa > 1:775996/1‑249 (MQ=255) tcgatAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAgtgtc < 1:405555/151‑2 (MQ=255) gatAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACgg < 1:569432/116‑1 (MQ=255) atAAAGAGTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAg > 1:868717/2‑251 (MQ=255) gagTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAgtgt < 1:75380/146‑1 (MQ=255) gagTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCaaaac < 1:144544/181‑2 (MQ=255) gagTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATctagtaac > 1:213634/1‑209 (MQ=255) gagTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAAt > 1:687334/1‑249 (MQ=255) gagTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAAACCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCAt < 1:669837/191‑1 (MQ=255) gTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAAt > 1:230326/1‑219 (MQ=255) gTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCa > 1:608627/1‑251 (MQ=255) gTTATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCa > 1:546754/1‑251 (MQ=255) ttATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCAt < 1:724366/251‑1 (MQ=255) tATCTAGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGAt > 1:533840/1‑191 (MQ=255) atctaGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACgg < 1:150265/103‑1 (MQ=255) atctaGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCAt > 1:75221/5‑186 (MQ=255) atctaGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATAc > 1:603979/5‑233 (MQ=255) atctaGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATaa > 1:142177/5‑251 (MQ=255) atctaGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATaa > 1:33248/5‑251 (MQ=255) tctaGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGa < 1:560229/217‑1 (MQ=255) tctaGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAAt > 1:117896/4‑251 (MQ=255) aGATACCCCCCATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAAt > 1:899676/1‑223 (MQ=255) aTACCCCCCATAATTCATCATAAACGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTg < 1:686537/158‑1 (MQ=255) ccccccATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTg > 1:891894/5‑146 (MQ=255) ccccccATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCt < 1:417582/247‑1 (MQ=255) cccccATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAg > 1:882512/4‑231 (MQ=255) ccccATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAAcc > 1:689464/3‑248 (MQ=255) ccATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAgc > 1:432333/1‑153 (MQ=255) ccATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGa < 1:135131/176‑1 (MQ=255) ccATAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAAtt > 1:400285/1‑251 (MQ=255) aTAATTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAg > 1:402433/1‑251 (MQ=255) aTTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAgc < 1:10097/149‑2 (MQ=255) aTTCATCATAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGAc < 1:315764/176‑1 (MQ=255) catcatAAATGCCACAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATctagtaac > 1:797260/1‑183 (MQ=255) cAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACgg > 1:653225/1‑72 (MQ=255) cAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTa < 1:712516/251‑1 (MQ=255) cAATAATCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTa > 1:103477/1‑251 (MQ=255) ataaTCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTAtt > 1:894302/4‑251 (MQ=255) aaTCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTcc > 1:683966/2‑81 (MQ=255) tCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATa < 1:679291/251‑1 (MQ=255) tCATTTTTGTGACAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATa < 1:874965/251‑1 (MQ=255) aaaaTCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATActtg < 1:375826/251‑1 (MQ=255) aaaaTCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATActtg < 1:225970/251‑1 (MQ=255) aaaaTCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATActtg < 1:78949/251‑1 (MQ=255) aTCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATActtgctt > 1:641640/1‑251 (MQ=255) aTCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATActtgc > 1:233181/1‑249 (MQ=255) aTCATAAATCAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAAtt < 1:476538/216‑1 (MQ=255) tCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACg < 1:572285/162‑1 (MQ=255) aaTTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGAt > 1:746554/1‑127 (MQ=255) aaTTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGAt > 1:306409/1‑127 (MQ=255) ttAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGAt > 1:894348/1‑190 (MQ=255) ttAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTa > 1:16334/1‑251 (MQ=255) cTGTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGca < 1:23569/251‑2 (MQ=255) gTTGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGcatt > 1:583683/1‑248 (MQ=255) tGCTGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGt < 1:632170/220‑1 (MQ=255) tGGAGCTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGcattactac < 1:660035/251‑9 (MQ=255) cTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAAttg < 1:112412/251‑2 (MQ=255) cTTCAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAAttg < 1:175638/251‑2 (MQ=255) cAATTTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTCATGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGCTGGCAAAACTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCTAGTAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAGCACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCATTACTACAAttggag < 1:159639/251‑5 (MQ=255) | GACATATTTAGATTTATCTAGATCAAAGAGTTGACCAGCAATATCCGATCCTAATTCCAATTGGTCATCCATTAAACCGGCTATACCGTTTCCGGTAAAGCCGGTTAAGCTAGTTTTGAGATCATCAATTATCGCTAAAGAGTTATCCAGATACCCTCCATAATTCATCATAAATGCTACAATGATCATTTTTGTGGCAAAATCATAAATTAATGCTGTTGCTGGAGCTTCAATCTTGCCAGATATTACGGCAAATCCTTTTCCTAAAAAGTAAATTGTCAGTGTTACGCCAATAATTGTAAAAAGTGAGTTAGCAAAATTGCTACTCATAGATTGACTAACTGAATCCAATAACTGAATAACGAAAGAATCGATACTCTCAAAGAATCTCATAATGATAACCTAATTAGAAAAATTAACACCTCGAGTATTCATACGTCGAATACTTGCTTGTGCTTTATTTGCGTTTCGACAATTAGAA > 1/1140265‑1140745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |