| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 145,483 | C→A | R327S (CGT→AGT) | unknown → | Glycerate kinase (EC 2.7.1.31) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 145,483 | 0 | C | A | 100.0% | 259.3 / NA | 95 | R327S (CGT→AGT) | unknown | Glycerate kinase (EC 2.7.1.31) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (47/48); total (47/48) | |||||||||||
CCGGGTGCCGGCGCCGCAGGCGGTATGGGCGGCGGCTTATTGCTGTTACCGAATGTGGAATTAAAAGCCGGTGTGCAAATCATGTTGGAAAATTTGCAACTGGCGGACAAAGTGCATGACGCCGATTTGGTGATTACCGGTGAAGGCCGCATGGACGCACAGAGTATTCTCGGTAAAACGCCTATTGGTGTGGCGCGTACGGCGAAGCAGTTCAATAAACCGGTGATTGCCATTGTTGGTTGTCTGCGTGAGGATTATGAAGTGGTGTACGAGCATGGCATTGATGTGGTGTTCCCGATCATTCGCCAGCTGGCACCGTTATCGGAAATTTTGCAGCAGGGCAGGGAGAACCTGGTTTCCGCTGCACAAAATATCGCCCGCCTGTTTGCGTTACAAGGGAAAATTTGAGGCGTTCCGCCGAAAAGTGCGGTGCTTTTTAGATGAATTTACGGCTTCACATGATAAGCCGTTTTTTCGTTATTCTT > 1/145237‑145721 | ccGGGTGCCGGCGCCGCAGGCGGTATGGGCGGCGGCTTATTGCTGTTACCGAATGTGGAATTAAAAGCCGGTGTGCAAATCATGTTGGAAAATTTGCAACTGGCGGACAAAGTGCATGACGCCGATTTGGTGATTACCGGTGAAGGCCGCATGGACGCACAGAGTATTCTCGGTAAAACGCCTATTGGTGTGGCGCGTACGGCGAAGCAGTTCAATAAACCGGTGATTGCCATTGTTGGTTGTCTGAGTg < 1:36979/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |