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atCTAACGCCTCTGTCGTTCTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGCATTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGCCGGTTGCGTATCCTTTTTATTCAAAAAGGAATAACCCAAAAACGCCACGGCAAGCAGTGCAATAATCAGAAAAATAAATAGATTTTGGtttt > 1:648330/1‑251 (MQ=255) tCTAACGCCTCTGTCGTTCTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGCATTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGCCGGTTGCGTATCCTTTTTATTCAAAAAGGAATAAccc < 1:721287/195‑1 (MQ=255) tCTAACGCCTCTGTCGTTCTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGCATTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGCCGGTTGCGTATCCTTTTTATTCAAAAAGGAATAACCCAAAAACGCCACGGCAAGCAGTGCAATAATCAGAAAAATAAATAGATTTTGGtt < 1:887704/248‑1 (MQ=255) cGCCTCTGTCGTTCTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGCATTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGCCGGTTGCGTATCCTTTTTATTCAAAAAGGAATAACCCAAAAACGCCACGGCAAGCAGTGCAATAATCAGAAAAATAAATAGATTTTGGTTTTTACcg > 1:717041/1‑250 (MQ=255) ccTCTGTCGTTCTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGCATTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGc < 1:811604/151‑1 (MQ=255) ccTCTGTCGTTCTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGCATTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGCCGGTTGCGTATCCTTTTTATTCAAAAAGGAATAAccc > 1:159999/1‑188 (MQ=255) ccTCTGTCGTTCTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGCATTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGCCGGTTGCGTATCCTTTTTATTCAAAAAGGAATAACCCAAAAACGCCACGGCAAGCAGAGCaa > 1:147723/1‑213 (MQ=255) gTCGTTCTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGCATTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGCCGGTTGCGTATCCTTTTTATTCAAAAAGGAATAACCCAAAAACGCCACGGCAAGCAGTGCAATAATCAGAAAAATAAATAGATTTTGGTTTTTACCGCGTTTgg > 1:822487/1‑250 (MQ=255) ttcTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGCATTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGc < 1:676221/102‑1 (MQ=255) cTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGCATTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGCCGGTTGCGTATCCTTTTTATTCAAAAAGGAATAACCCAAAAACGCCACGGCAAGCAGTGCaa > 1:241651/1‑192 (MQ=255) ggAGCGGTTGCGGTAGGCATTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAAcc < 1:114553/120‑1 (MQ=255) aggcaTTGGTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGCCGGTTGCGTATCCTTTTTATTCAAAAAGGAATAACCCAAAAACGCCACGGCAAGCAGTGCAATAATCAGAAAAATAAATAGATTTTGGTTTTTACCGCGTTTGGCAATTTTGCTGACTTCCGGTTGATAATCGGTTTCCg > 1:148901/5‑251 (MQ=255) gTTGTGGTTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGCCGGTTGCGTATCCTTTTTATTCAAAAAGGAATAACCCAAAAACGCCACGGCAAGCAGTGCAATAATCAGAAAAATAAATAGATTTTGGTTTTTACCGCGTTTGGCAATTTTGCTGACTTCCGGTTGATAATCGGTTTCCGTTTTGTCa > 1:155866/1‑251 (MQ=255) | GCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAACATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGATTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATTTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGGGGGGCGGATGGAATATCTAACGCCTCTGTCGTACTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGAATTGGTTGTGGCTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTACCGAATTCTTCTTTTTCCTTAACCTGTGCCGGTTGCGTATCCTTTTTATTCAAAAAGGAATAACCCAAAAACGCCACGGCAAGCAGTGCAATAATCAGAAAAATAAATAGATTTTGGTTTTTACCGCGTTTGGCAATTTTGCTGACTTCCGGTTGATAATCGGTTTCCGTTTTGTCA > 1/1137338‑1137817 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |