| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,137,397 | A→G | N151N (AAT→AAC) | unknown ← | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,137,397 | 0 | A | G | 100.0% | 215.1 / NA | 77 | N151N (AAT→AAC) | unknown | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (34/43); total (34/43) | |||||||||||
AACACGGTAGAGCCTTTTTCAATCAGTAGTACCGTGCCGTTTGCACTATATACATCGTTTGCCACAACGCAGCCGAGATTGCCGGCCACGGTGGAAACAAGTTTTGTGCGTAAGGAACACTGAATAAAAGTGCCTTTTGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGCGCTTTACCCGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAACATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGATTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATTTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGGGGGGCGGATGGAATATCTAACGCCTCTGTCGTACTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGAATTGGTTGTGGCTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGTGCCGTAAATGTTTTTGAACGCACCGTCGTAC > 1/1137155‑1137641 | aatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGGTTAGTTAc < 1:11000‑M2/113‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |