| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 144,195 | T→C | I321T (ATC→ACC) | unknown → | D‑glycerate transporter (predicted) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 144,195 | 0 | T | C | 100.0% | 247.6 / NA | 89 | I321T (ATC→ACC) | unknown | D‑glycerate transporter (predicted) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (50/39); total (50/39) | |||||||||||
TTATTCGGCATCAAAGTGGATCCCCTGATTGCGTTGCCGGCGGGCGGTTTGGTCGGTGCGTTGTGTATGGGAAAAATTCGCCATGCGAATAATTATGCCATCAGCGGATTGGGCAAAATGGCGCCGGTTGCCATTATGTTGCTTGGTACGGGCGCACTTGCCGGGATTATCGCTAATTCAGGGTTAAA‑‑AGATGTGTTAATTCAAGGTTTAGAACATTCCGGGTTACCTTCCTATATTCTGGCACCTATCTCAGGCGTATTAATGTCTTTGGCGACGGCTTCGACCACGGCGGGGACGGCGGTGGCGTCC‑AACGTGTTTAGCGGCATTTTGTTA‑GAATTAGGCGTGAGCGGTTTAGCAGCGGCAGCCATGATTCATGCCGGTGCGACAGTATTCGACCATATGCCGCACGGTTCTTTCTTCCATGCCACCGGCGGCAGCGTGAACATGGATATTAAAGAACGCTTGAAACTGATCCCTTATGAAAGTGCGGTGG > 1/143948‑144440 | ttATTCGGCATCAAAGTGGATCCCCTGATTGCGTTGCCGGCGGGCGGTTTGGTCGGTGCGTTGTGTATGGGAAAAATTCGCTATGCGAATAATTATGCCATCAGCGGATTGGGCAAAATGGCGCCGGTTGCCATTATGTTGCTTGGTACGGGCGCACTTGCCGGGATTATCGCTAATTCAGGGTTAAA‑‑AGATGTGTTAATTCAAGGTTTAGAACATTCCGGGTTACCTTCCTATATTCTGGCACCTAcctc < 1:443551/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ccTATATTCTGGCACCTACCTCAGGCGTATTAATGTCTTTGGCGACGGCTTCGACCACGGCGGGGACGGCGGTGGCGTCC‑CACGTGTTTAGCGGCATTTTGTTA‑GAATTAGGCGTGAGCGGGTTAGCAGCGGCAGCCATGATTCATGCCGGTGCGACAGTATTCGACCATATGCCGCACGGTTCTTTCTTCCATGCCCCCGGCGGCAGCGTGAACATGGATATTAAAGAAAGCTTGAAACTGATTCCTTAt > 1:897393/1‑251 (MQ=255) ccTATATTCTGGCACCTACCTCAGGCGTATTAATGTCTTTGGCGACGGCTTCGACCACGGCGGGGACGGCGGTGGCGTCC‑AACGTGTTTAGCGGCATTTTGTTT‑GAATTAGGCGTGAGCGGTTTAGCAGCGGCAGCCATGATTCATGCCGGTGCGACAGTATTCGACCATATGCCGCACGGTTCTTTCTTCCATGCCACCGGCGGCAGCGTGAACATGGATATTAAAGAACGCTTGAAACTGATCCCtttt > 1:124970/1‑249 (MQ=255) ccTATATTCTGGCACCTACCTCAGGCGTATTAATGTCTTTGGCGACGGCTTCGACCACGGCGGGGACGGCGGTGGCGTCC‑AACGTGTTTAGCGGCATTTTGTTA‑GGATTAGGGGTGAGCGGTTTagcag > 1:643363/1‑129 (MQ=255) ccTATATTCTGGCACCTACCTCAGGCGTATTAATGTCTTTGGCGACGGCTTCGACCACGGCGGGGACGGCGGTGGCGTCC‑AACGTGTTTAGCGGCATTTTGTTA‑GAATTAGGCGTGAGCGGTTTAGCAGCGGCAGCCATGATTCATGcc < 1:282601/149‑1 (MQ=255) 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TTATTCGGCATCAAAGTGGATCCCCTGATTGCGTTGCCGGCGGGCGGTTTGGTCGGTGCGTTGTGTATGGGAAAAATTCGCCATGCGAATAATTATGCCATCAGCGGATTGGGCAAAATGGCGCCGGTTGCCATTATGTTGCTTGGTACGGGCGCACTTGCCGGGATTATCGCTAATTCAGGGTTAAA‑‑AGATGTGTTAATTCAAGGTTTAGAACATTCCGGGTTACCTTCCTATATTCTGGCACCTATCTCAGGCGTATTAATGTCTTTGGCGACGGCTTCGACCACGGCGGGGACGGCGGTGGCGTCC‑AACGTGTTTAGCGGCATTTTGTTA‑GAATTAGGCGTGAGCGGTTTAGCAGCGGCAGCCATGATTCATGCCGGTGCGACAGTATTCGACCATATGCCGCACGGTTCTTTCTTCCATGCCACCGGCGGCAGCGTGAACATGGATATTAAAGAACGCTTGAAACTGATCCCTTATGAAAGTGCGGTGG > 1/143948‑144440 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |