| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,137,367 | C→T | M161I (ATG→ATA) | unknown ← | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,137,367 | 0 | C | T | 100.0% | 201.1 / NA | 75 | M161I (ATG→ATA) | unknown | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (34/41); total (34/41) | |||||||||||
CTGAATCTGACCGCTACGGAACTCACCGAACACGGTAGAGCCTTTTTCAATCAGTAGTACCGTGCCGTTTGCACTATATACATCGTTTGCCACAACGCAGCCGAGATTGCCGGCCACGGTGGAAACAAGTTTTGTGCGTAAGGAACACTGAATAAAAGTGCCTTTTGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGCGCTTTACCCGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAACATATCGCCTTTTGCCGGTTCCGGTGGTTGATTAGTTACCGTGTCAGTTGTATCTGTATTCTGAACATTTGAAACGGCTTGTAACGTTTCGCCATCGATAGTACCCGGAGACAATCCTTTGATTAAACGGGGGGCGGATGGAATATCTAACGCCTCTGTCGTACTATGATTTTCTACTGGAGCGGTTGCGGTAGGAATTGGTTGTGGCTCCGGATTTAAAATCGCCGGGATTTCTGCCGGTGGT > 1/1137127‑1137610 | ggttcttataaagcgtaggcggaatattaatggttttctccaggatactttgtgcaatttcagagccggcttgtaccgtatcagtcggattaaatgtcccccgtttggctaattgagtagataatgcactggttgaatcggtgatcatgcttaacatgatggcattGCCAACAGTAAATTGGCATTGACCGGGAGTTTATGGGCTTTACCTGCTTTAAACGTACTGACGTTATCTTCAAATATATCGCCtt > 1:465062‑M2/167‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |