| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,136,800 | C→T | V350V (GTG→GTA) | unknown ← | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,136,800 | 0 | C | T | 100.0% | 201.9 / NA | 74 | V350V (GTG→GTA) | unknown | Inner membrane protein of type IV secretion of T‑DNA complex, TonB‑like, VirB10 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (41/33); total (41/33) | |||||||||||
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|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |