| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,127,919 | A→G | N80D (AAC→GAC) | unknown → | Tryptophan synthase alpha chain (EC 4.2.1.20) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,127,919 | 0 | A | G | 100.0% | 180.1 / NA | 65 | N80D (AAC→GAC) | unknown | Tryptophan synthase alpha chain (EC 4.2.1.20) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (33/32); total (33/32) | |||||||||||
GAATGTAATCATGAGCCGTTTTGAAACCACATTTGCCCAATTACACGCGCAAAATGAAGGCGCATTCGTTCCTTTCGTGACCTTATGCGACCCGACTTTCGACCGTTCTTTTGACATTATTTGCACCCTGGTGGATAACGAGGCGGACGCATTGGAACTGGGTTTTCCGTTCTCCGATCCCTTATTGGACGGACCGGTGATTCAAGCCGCCAACAATCGTGCGTTAAACGCCGGTCACAGCACGGAAAACAGCTTTAAATTGCTGGAAAAAGTGCGGTCAAAATATCCGGAGATTCCGATGAGTTTGCTGCTTTGCGCCAATTTAATTTTTGCCAAAGGCTTGGATAATTTTTATCAGCGTTGCGCCGACGTGGGCGTGGACGCCGTGTTGGTTGCCGATATTCCGTTGTTGGCGAAAGACGATTATGTCGCCGCCGCGAAAAGACACGGTATTCAACCCGTTTTTATTTGCCCGCCGAATGCAGACG > 1/1127672‑1128159 | gAATGTAATCATGAGCCGTTTTGAAACCACATTTGCCCAATTACACGCGCAAAATGAAGGCGCATTCGTTCCTTTCGTGACCTTATGCGACCCGACTTTCGACCGTTCTTTTGACATTATTTGCACCCTGGTGGATAACGAGGCGGACGCATTGGAACTGGGTTTTCCGTTCTCCGATCCCTTATTGGACGGACCGGTGATTCAAGCCGCCAACAATCGTGCGTTAAACGCCGGTCACAGCACGGAAGACa > 1:81709/1‑251 (MQ=255) 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ttttGAAACCACATTTGCCCAATTACACGCGCAAAATGAAGGCGCATTCGTTCCTTTCGTGACCTTATGCGACCCGACTTTCGACCGTTCTTTTGACATTATTTGCACCCTGGTGGATAACGAGGCGGACGCATTGGAACTGGGTTTTCCGTTCTCCGATCCCTTATTGGACGGACCGGTGATTCAAGCCGCCAACAATCGTGCGTTAAACGCCGGTCACAGCACGGAAGACAGCTTTAAATTGCTGGaaa > 1:754655/1‑251 (MQ=255) ccAATTACACGCGCAAAATGAAGGCGCATTCGTTCCTTTCGTGACCTTATGCGACCCGACTTTCGACCGTTCTTTTGACATTATTTGCACCCTGGTGGATAACGAGGCGGACGCATTGGAACTGGGTTTTCCGTTCTCCGATCCCTTATTGGACGGACCGGTGATTCAAGCCGCCAACAATCGTGCGTTAAACGCCGGTCACAGCACGGAAGACAGCTTTAAATTGCTGGAAAAAGTGCGGTCAAAATATc < 1:669142/251‑1 (MQ=255) tACACGCGCAAAATGAAGGCGCATTCGTTCCTTTCGTGACCTTATGCGACCCGACTTTCGACCGTTCTTTTGACATTATTTGCACCCTGGTGGATAACGAGGCGGACGCATTGGAACTGGGTTTTCCGTTCTCCGATCCCTTATTGGACGGACCGGTGATTCAAGCCGCCAACAATCGTGCGTTAAACGCCGGTCACAGCACGGAAGACAGCTTTAAATTGCTGGAAAAAGTGCGGTCAAAATATCCGgag < 1:242282/251‑1 (MQ=255) 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gTTAAACGCCGGTCACAGCACGGAAGACAGCTTTAAATTGCTGGAAAAAGTGCGGTCAAAATATCCGGAGATTCCGATGAGTTTGCTGCTTTGCGCCAATTTAATTTTTGCCAAAGGCTTGGATAATTTTTATCAGCGTTGCGCCGACGTGGGCGTGGACGCCGTGTTGGTTGCCGATATTCCGTTGTTGGCGAAAGa > 1:511461/1‑198 (MQ=255) gTCACAGCACGGAAGACAGCTTTAAATTGCTGGAAAAAGTGCGGTCAAAATATCCGGAGATTCCGATg < 1:613016/68‑1 (MQ=255) gTCACAGCACGGAAGACAGCTTTAAATTGCTGGAAAAAGTGCGGTCAAAATATCCGGAGATTCCGATGAGTTTGCTGCTTTGCGCCAATTTAATTTTTGCCAAAGGCTTGGATAATTTTTATCAGCGTTGCGCCGACGTGGGCGTGGACGCCGTGTTGGTTGCCGATATTCCGTTGTTGGCGAAAGACGATTATGTCGCCGCCGCGAAAAGACACGGTATTCAACCCGTTTTTATTTGCCCGCCGAATGCa > 1:404770/1‑251 (MQ=255) caGCACGGAAGACAGCTTTAAATTGCTGGAAAAAGTGCGGTCAAAATATCCGGAGATTCCGATGAGTTTGCTGCTTTGCGCCAATTTAATTTTTGCCAAAGGCTTGGATAATTTTTATCAGCGTTGCGCCGACGTGGGCGTGGACGCCGTGTTGGTTGCCGATATTCCGTTGTTGGCGAAAGACGATTATGTCGCCGCCGCGAAAAGACACGGTATTCAACCCGTTTTTATTTGCCCGCCGAATGCAGACg > 1:745924/1‑251 (MQ=255) caGCACGGAAGACAGCTTTAAATTGCTGGAAAAAGTGCGGTCAAAATATCCGGAGATTCCGATGAGTTTGCTGCTTTGCGCCAATTTAATTTTTGCCAAAGGCTTGGATAATTTTTATCAGCGTTGCGCCGACGTGGGCGTGGACGCCGTGTTGGTTGCCGATATTCCGTTGTTGGCGAAAGACGATTATGTCGCCGCCGCGAAAAGACACGGTATTCAACCCGTTTTTATTTGCCCGCCGAATGCAGACg > 1:499827/1‑251 (MQ=255) caGCACGGAAGACAGCTTTAAATTGCTGGAAAAAGTGCGGTCAAAATATCCGGAGATTCCGATGAGTTTGCTGCTTTGCGCCAATTTAATTTTTGCCAAAGGCTTGGATAATTTTTATCAGCGTTGCGCCGACGTGGGCGTGGACGCCGTGTTGGTTGCCGATATTCCGTTGTTGGCGAAAGACGATTATGTCGCCGCCGCGAAAAGACACGGTATTCAACCCGTTTTTATTTGCCCGCCGAATGCAGACg > 1:211154/1‑251 (MQ=255) | GAATGTAATCATGAGCCGTTTTGAAACCACATTTGCCCAATTACACGCGCAAAATGAAGGCGCATTCGTTCCTTTCGTGACCTTATGCGACCCGACTTTCGACCGTTCTTTTGACATTATTTGCACCCTGGTGGATAACGAGGCGGACGCATTGGAACTGGGTTTTCCGTTCTCCGATCCCTTATTGGACGGACCGGTGATTCAAGCCGCCAACAATCGTGCGTTAAACGCCGGTCACAGCACGGAAAACAGCTTTAAATTGCTGGAAAAAGTGCGGTCAAAATATCCGGAGATTCCGATGAGTTTGCTGCTTTGCGCCAATTTAATTTTTGCCAAAGGCTTGGATAATTTTTATCAGCGTTGCGCCGACGTGGGCGTGGACGCCGTGTTGGTTGCCGATATTCCGTTGTTGGCGAAAGACGATTATGTCGCCGCCGCGAAAAGACACGGTATTCAACCCGTTTTTATTTGCCCGCCGAATGCAGACG > 1/1127672‑1128159 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |