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gATTTGATGCAGGTAGATCGCTATTCGCAC‑ATTATGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGGAAAAACGCCACAGTTAcgg > 1:879697/1‑194 (MQ=255) gATTTGATGCAGGTAGATCGCTATTCGCAC‑ATTATGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGGAAAAACGCCACAGTTACGGCGGTGCGGTGGGGGATCTGCAATCCGACGGCAATTTTTACACCTGTATCGTGATTCg > 1:475544/1‑251 (MQ=255) gATGCAGGTAGATCGCTATTCGCAC‑ATTATGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGAAAAAACGCCACAGTTACGGCGGTGCGGTGGGGGATCTGCAATCCGACGGCAATTTTGACACCTGTATCGTGATTCGTTCCg > 1:451334/1‑251 (MQ=255) cAGGTAGATCGCTATTCGCAC‑ATTATGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGGAAAAACGCCACAGTTACGGCGGTGCGGTgg > 1:161824/1‑196 (MQ=255) ggTAGATCGCTATTCGCAC‑GTTATGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGGAAAAACGCCACAGTTACGGCGGTGCGGTGGGGTATCTGCAATCCGACGGCAATTTTGACACCTGTATCg < 1:290359/233‑1 (MQ=255) ggTAGATCGCTATTCGCAC‑ATTATGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGGAAAAACGCCACAGTTACGGCGGTGCGGTGGGGGATCTGCAATCCGACGGCAATTTTGACACCTGTATCg > 1:625300/1‑233 (MQ=255) gTAGATCGCTATTCGCAC‑ATTATGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGc > 1:765898/1‑105 (MQ=255) gTAGATCGCTATTCGCAC‑ATTATGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGGAAAAACGCCACAGTTACGGCGGTGCGGGGGGGGATCTGCAATCCGACGGCAATTTTGACACCTGTATCGTGATTCGTTCCGCTTTCGt > 1:717281/1‑251 (MQ=255) cGCAC‑ATTATGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGGAAAAACGCCACAGTTACGGCGGTGCGGTGGGGGATCTGCAATCCGACGGCAATTTTGACACCTGTATCGTGATTCGTTCCGCTTTCGTGCAAAACGGCAtt > 1:347562/1‑251 (MQ=255) c‑aTTATGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGGAAAAACGCCACAGTTAcgg < 1:671837/165‑1 (MQ=255) tATGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGGAAAAACGCCACAGTTACGGCGGTGCGGTGGGGTATCTGCAATCCGACGGCAATTTTGACACCTGTATCGTGATTCGTTCCGCTTTCGTGCAAAACGGCATTGCCCACg < 1:205530/251‑1 (MQ=255) tGCACTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGGAAAAACGCCACAGTTACGGCGGTGCGGTGGGGTATCTGCAATCCGACGGCAATTTTGACACCTGTATCGTGATTCGTTCCGCTTTCGTGCAAAACGGCATTGCCCACGTa < 1:408240/251‑1 (MQ=255) | CCCGCCAACTGGAAATTTACCCGATTGCCGGTTCCCGTCCGCGCGGTTTTGATGCTGATGGCAATATCGATCCGGAATTGGATTCCCGCCTGGAATTGGAATTACGTTTAGATCACAAAGAACAGGCGGAACATTTGATGTTGGTGGATTTGGCGCGTAACGACATCGCCCGCGTATGTGAAAGCAAAACCCGTCATGTGAAGGATTTGATGCAGGTAGATCGCTATTCGCAC‑ATTATGCATTTGGTTTCCCGCGTAGTGGGTAAACTCCGTCCTGAACTGGATGCGTTGCACGCTTATCAAGCCTGTATGAACATGGGCACACTAACCGGCTCGCCGAAAATTAAAGCCATGCAGCTGATTTATCAATTTGAACAGGAAAAACGCCACAGTTACGGCGGTGCGGTGGGGTATCTGCAATCCGACGGCAATTTTGACACCTGTATCGTGATTCGTTCCGCTTTCGTGCAAAACGGCATTGCCCACGTA > 1/1112261‑1112748 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |