| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,111,262 | T→C | intergenic (+109/‑59) | unknown → / → unknown | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonate 8‑phosphate phosphatase (EC 3.1.3.45)/Anthranilate synthase, aminase component (EC 4.1.3.27) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,111,262 | 0 | T | C | 100.0% | 232.9 / NA | 85 | intergenic (+109/‑59) | unknown/unknown | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonate 8‑phosphate phosphatase (EC 3.1.3.45)/Anthranilate synthase, aminase component (EC 4.1.3.27) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (41/44); total (41/44) | |||||||||||
GATTACGTCTTGGGTTTAGGCGGTGGCAAAGGGGCGTTTCGTGAAATGTCCGACATGATCTTAAACGCCCAAGGCAAAAGCGACATTTACAGCTCCGCACAAGGATTTTTGAAAACAGCGAAGAAGATGGCACAGTAAAAACGCTTGAAAAAAGAACCGCACTTTACGGGCGCAGATAACGCGCCCTACTTTTCCCCTCAACTATTTCCATAAACCTTAAACAAAATTTTTATTTCCCTTGACTTTTACCCCTTGTACTAGTTTAATAGTGCAAAATTTATTTCATGCTTTATAAGGAAATGAGAATGTCCTCCGCTTTTATTCAAACGTTTACGCAAAATGTCCCTTATCACAGCGATCCTACCGCAATTTTCGCCACATTATGTGAAAACAAACCGAACACCCTGCTTTTAGAATCCGCCGAAATTTCCAGCAAAAACAGTTTAAAAAGTTTATTACTCGTCAATGCCGCCATCAAAATTTCCTGTTTGGG > 1/1111016‑1111508 | gATTACGTCTTGGGTTTAGGCGGTGGCAAAGGGGCGTTTCGTGAAATGTCCGACATGATCTTAAACGCCCAAGGCAAAAGCGACATTTACAGCTCCGCACAAGGATTTTTGAAAACAGCGAAGAAGATGGCACAGTAAAAACGCTTGAAAAAAGAACCGCACTTTACGGGCGCAGATAACGCACCCTACTTTTCCCCTCAACTATTTCCATAAACCTTAAACAAAATTTTTATTTCCCTTGACTTTCAcc > 1:207319/1‑250 (MQ=255) 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(MQ=255) | GATTACGTCTTGGGTTTAGGCGGTGGCAAAGGGGCGTTTCGTGAAATGTCCGACATGATCTTAAACGCCCAAGGCAAAAGCGACATTTACAGCTCCGCACAAGGATTTTTGAAAACAGCGAAGAAGATGGCACAGTAAAAACGCTTGAAAAAAGAACCGCACTTTACGGGCGCAGATAACGCGCCCTACTTTTCCCCTCAACTATTTCCATAAACCTTAAACAAAATTTTTATTTCCCTTGACTTTTACCCCTTGTACTAGTTTAATAGTGCAAAATTTATTTCATGCTTTATAAGGAAATGAGAATGTCCTCCGCTTTTATTCAAACGTTTACGCAAAATGTCCCTTATCACAGCGATCCTACCGCAATTTTCGCCACATTATGTGAAAACAAACCGAACACCCTGCTTTTAGAATCCGCCGAAATTTCCAGCAAAAACAGTTTAAAAAGTTTATTACTCGTCAATGCCGCCATCAAAATTTCCTGTTTGGG > 1/1111016‑1111508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |