| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,108,080 | C→A | intergenic (‑314/+26) | unknown ← / ← unknown | Phenylalanyl‑tRNA synthetase alpha chain (EC 6.1.1.20)/Protease HtpX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,108,080 | 0 | C | A | 100.0% | 132.3 / NA | 50 | intergenic (‑314/+26) | unknown/unknown | Phenylalanyl‑tRNA synthetase alpha chain (EC 6.1.1.20)/Protease HtpX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (26/24); total (26/24) | |||||||||||
ATCACGCAATTTATCACGTTTTACGCAAATTATTCGTGAGTAGAAAAGGATACCGATAAAAAACGCCCGAAAAAATTATTTACAAACTCGCTCTCTCGTTTCTTCACCCCTAACGGGCGGTTGGAAAAGCCAACGTTCAAAAAACGTTGTTTTTTGTGACCGCACTTTTTGTCCTGCAGGAAATTTTAGTGCTGAATCTATTAAGCTATTTTTCATAGACAAAAAAATAGAGGCTTCAAAAGCCTCTATTCCGTATCGGTAAAATGAAATTTTATAACTGACGCAACTGTTGCAACGCTTCAATACGTTTTTCCAACGGC‑GGGTGGCTTAAAAGTAACTCTTTCAAACCGCCACCACGTTTACCGTTAATGGCAAATGCCGCTAAGGCGGAGCCTTCTAATTCTTGCGGTTCATG‑CAAACTTTGCAGAC‑GTTTTAACGCATCAATCATTTTTTGTTTGCCCACCAAATCCGCCGAACCGGCATCCGCT > 1/1107835‑1108322 | aTCACGCAATTTATCACGTTTTACGCAAATTATTCGTGAGTAGAAAAGGATACCGATAAAAAACGCCCGAAAAAATTATTTACAAACTCGCTCTCTCGTTTCTTCACCCCTAACGGGCGGTTGGAAAAGCCAACGTTCAAAAAACGTTGTTTTTTGTGACCGCACTTTTTGTCCTGCAGGAAATTTTAGTGCTGAATCTATTAAGCTATTTTTCATAGACAAAAAAATAGAGGCTTCAAAAGCCTATATTc < 1:619421/251‑1 (MQ=255)aTCACGCAATTTATCACGTTTTACGCAAATTATTCGTGAGTAGAAAAGGATACCGATAAAAAACGCCCGAAAAAATTATTTACAAACTCGCTCTCTCGTTTCTTCACCCCTAACGGGCGGTTGGAAAAGCCAACGTTCAAAAAACGTTGTTTTTTGTGACCGCACTTTTTGTCCTGCAGGAAATTTTAGTGCTGAATCTATTAAGCTATTTTTCATAGACAAAAAAATAGAGGCTTCAAAAGCCTATATTc < 1:478458/251‑1 (MQ=255) cAATTTATCACGTTTTACGCAAATTATTCGTGAGTAGAAAAGGATACCGATAAAAAACGCCCGAAAAAATTATTTACAAATTCGCTCTCTCGTTTCTTCACCCCTAACGGGCGGTTGGAAAAGCCAACGTTCAAAAAACGTTGTTTTTTGTGACCGCACTTTTTGTCCTGCAGGAAATTTTAGTGCTGAATCTATTAAGCTATTTTTCATAGACAAAAAAATAGAGGCTTCAAAAGCCTATATTCCGTAt < 1:423772/250‑1 (MQ=255) cAATTTATCACGTTTTACGCAAATTATTCGTGAGTAGAAAAGGATACCGATAAAAAACGCCCGAAAAAATTATTTACAAATTCGCTCTCTCGTTTCTTCACCCCTAACGGGCGGTTGGAAAAGCCAACGTTCAAAAAACGTTGTTTTTTGTGACCGCACTTTTTGTCCTGCAGGAAATTTTAGTGCTGAATCTATTAAGCTATTTTTCATAGACAAAAAAATAGAGGCTTCAAAAGCCTATATTCCGTAt < 1:433416/250‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |