| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,096,349 | A→G | A215A (GCT→GCC) | unknown ← | TonB‑dependent receptor; Outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,096,349 | 0 | A | G | 100.0% | 231.5 / NA | 80 | A215A (GCT→GCC) | unknown | TonB‑dependent receptor; Outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (37/43); total (37/43) | |||||||||||
TGGCTTGGCTGACTAAAACGGAGCTATTTTACGTATCGCCGTTATAAATATTACCTTGACGGCTGTATGTGGCATCAAGGGTTAATTTTTGATCCGGCGTGATGTTCCAAACTAACTGGGCTGCCACATCACGATTACGCACGCCTTCACGACCGGCATAGCGGGTGTTGTCTTGTGTCGCCGCATTATTATTGGTCCCGGCATCTTCAGCGGAATTAATATCCAATGCATCGGCTTTTGTTTTAGCAATGTTGCCGTATAAACGGAAGCCTAAAACATCTTTAATCAACGGACCGCTGAAATTAAAACCCAGACGGTTGGTATGGCCTTCTTTGCTGTCTTCCGGTTGCTCGGTAAATAGATTTAAACTGCCGTGATATTCTGCGGTTGGTGCTTTGGTTTTAATGTTCACCACCCCGCCCATGGCGCCTGAACCATAACGTGCTGCTGCCGGACCTCGCAAGACTTCAATGGACTCAATAGCAT > 1/1096105‑1096590 | tggcttggctGACTAAAACGGAGCTATTTTACGTATCGCCGTTATAAATATTACCTTGACGGCTGTATGTGGCATCAAGGGTTAATTTTTGATCCGGCGTGATGTTCCAAACTAACTGGGCTGCCACATCACGATTACGCACGCCTTCACGACCGGCATAGCGGGTGTTGTCTTGTGTCGCCGCATTATTATTGGTCCCGGCATCTTCAGCGGAATTAATATCCAATGCATCGGCTTTTGTTTTGGCAATg > 1:870854/1‑251 (MQ=255) 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ttattGGTCCCGGCATCTTCAGCGGAATTAATATCCAATGCATCGGCTTTTGTTTTGGCAATGTTGCCGTATAAACGGAAGCCTAAAACATCTTTAATCAACGGACCGCTGAAATTAAAACCCAGACGGTTGGTATGGCCTT‑TTTGCTGTCTTCCGGTTGCTCGGTAAATAGATTTAAACTGCCGTGATATTCTGCGGTTGGTGCTTTGGTTTTAATGTTCACCACCCCGCCCATGGCGCCTGAACCATaa < 1:746188/251‑1 (MQ=255) ggTCCCGGCATCTTCAGCGGAATTAATATCCAATGCATCGGCTTTTGTTTTGGCAATGTTGCCGTATAAACGGAAGCCTAAAACATCTTTAATCAACGGACCGCTGAAATTAAAACCCAGACGGTTGGTATGGCCTT‑TTTGCTGTCTTCCGGTTGCTCGGTAAATAGATTTAAACTGCCGTGATATTCTGCGGTTGGTGCTTTGGTTTTAATGTTCACCACCCCGCCCATGGCGCCTGAACCATAACGtg > 1:836679/1‑250 (MQ=255) gTCCCGGCATCTTCAGCGGAATTAATATCCAATGCATCGGCTTTTGTTTTGGCAATGTTGCCGTATAAACGGAAGCCTAAAACATCTTTAATCAACGGACCGCTGAAATTAAAACCCAGACGGTTGGTATGGCCTT‑TTTGCTGTCTTCCGGTTGCTCGGTaa > 1:659556/1‑162 (MQ=255) gTCCCGGCATCTTCAGCGGAATTAATATCCAATGCATCGGCTTTTGTTTTGGCAATGTTGCCGTATAAACGGAAGCCTAAAACATCTTTAATCAACGGACCGCTGAAATTAAAACCCAGACGGTTGGTATGGCCTT‑TTTGCTGTCTTCCGGTTGCTCGGTAAATAGATTTAAACTGCCGTGATATTCTGCGGTTGGTGCTTTGGTTTTAATg > 1:359222/1‑212 (MQ=255) 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1:567459/179‑1 (MQ=255) atCCAATGCATCGGCTTTTGTTTTGGCAATGTTGCCGTATAAACGGAAGCCTAAAACATCTTTAATCAACGGACCGCTGAAATTAAAACCCAGACGGTTGGTATGGCCTT‑TTTGCTGTCTTCCGGTTGCTCGGTAAATAGATTTAAACTGCCGTGATATTCTGCGGTTGGTGCTTTGGTTTTAATGTTCACCACCCCGCCCATGGCGCCTGAACCATAACGTGCTGCTGCCGGACCTCGCAAGACTTCAAt > 1:21366/1‑251 (MQ=255) ccAATGCATCGGCTTTTGTTTTGGCAATGTTGCCGTATAAACGGAAGCCTAAAACATCTTTAATCAACGGACCGCTGAAATTAAAACCCAGACGGTTGGTATGGCCTT‑TTTGCTGTCTTCCGGTTGCTCGGTAAATAGATTTAAACTGCCGTGATATTCTGCGGTTGGTGCTTTGGTTTTAATGTTCACCACCCCGCCCATGGCGCCTGAACCATAACGTGCTGCTGCCGGACCTCGCAAGACTTCAATgg > 1:601890/1‑251 (MQ=255) ccAATGCATCGGCTTTTGTTTTGGCAATGTTGCCGTATAAACGGAAGCCTAAAACATCTTTAATCAACGGACCGCTGAAATTAAAACCCAGACGGTTGGTATGGCCTT‑TTTGCTGTCTTCCGGTTGCTCGGTAAATAGATTTAAACTGCCGTGATATTCTGCGGTTGGTGCTTTGGTTTTAATGTTCACCACCCCGCCCATGGCGCCTGAACCATAACGTGCTGCTGCCGGACCTCGCAAGACTTCAATgg < 1:517875/251‑1 (MQ=255) 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TGGCTTGGCTGACTAAAACGGAGCTATTTTACGTATCGCCGTTATAAATATTACCTTGACGGCTGTATGTGGCATCAAGGGTTAATTTTTGATCCGGCGTGATGTTCCAAACTAACTGGGCTGCCACATCACGATTACGCACGCCTTCACGACCGGCATAGCGGGTGTTGTCTTGTGTCGCCGCATTATTATTGGTCCCGGCATCTTCAGCGGAATTAATATCCAATGCATCGGCTTTTGTTTTAGCAATGTTGCCGTATAAACGGAAGCCTAAAACATCTTTAATCAACGGACCGCTGAAATTAAAACCCAGACGGTTGGTATGGCCTTCTTTGCTGTCTTCCGGTTGCTCGGTAAATAGATTTAAACTGCCGTGATATTCTGCGGTTGGTGCTTTGGTTTTAATGTTCACCACCCCGCCCATGGCGCCTGAACCATAACGTGCTGCTGCCGGACCTCGCAAGACTTCAATGGACTCAATAGCAT > 1/1096105‑1096590 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |