| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,072,896 | T→C | V211V (GTT→GTC) | unknown → | Fumarate and nitrate reduction regulatory protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,072,896 | 0 | T | C | 100.0% | 142.6 / NA | 53 | V211V (GTT→GTC) | unknown | Fumarate and nitrate reduction regulatory protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (21/32); total (21/32) | |||||||||||
TGATTTATCCGGCAAAATGCCTAAACTGCGCCAGCAAATTATGCGTTTAATGAGTAATGAAATTAAAAGTGATCAGGAAATGATTTTATTACTCTCTAAAATGAATGCAGAAGAACGTCTTGCCGCATTTATTTATAACTTATCTCAACGCTACTCCGCCCGAGGTTTTTCTGCCAGGGAATTCCGCTTAACCATGACTCGTGGTGATATCGGCAATTATCTCGGTTTAACCGTTGAAACTATCAGTCGTTTACTCGGTCGCTTCCAAAAACTTGGTGTATTATCGGTTCAAGGAAAATACATTACGATTAATAATATGGCGGAATTAATCGAACTATCCGGTACCAACAAAAACAAAATTCAACTGATTATTTAGTCCGTTCATTCTTCCGGTGTAATATAAAATATTGCATCGGATCACCTTTTTAAACTGCCTGCCTTGTTATTTATTCAATAATGTTCTACCCTATTATACC > 1/1072662‑1073137 | tgatTTATCCGGCAAAATGCCTAAACTGCGCCAGCAAATTATGCGTTTAATGAGTAATGAAATTAAAAGTGATCAGGAAATGATTTTATTACTCTCTAAAATGAATGCAGAAGAACGTCTTGCCGCATTTATTTATAACTTATCTCAACGCTACTCCGCCCGAGGTTTTTCTGCCAGGGAATTCCGCTTAACCATGACTCGTGGTGATATCGGCAATTATCTCGGTTTAACCGTCGAAACTATCAGTCGtt < 1:322988/251‑1 (MQ=255) 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tcGGTTTAACCGTCGAAACTATCAGTCGTTTACTCGGTCGCTTCCAAAAACTTGGTGTATTATCGGTTCAAGGAAAATACATTACGATTAATAATATGGCGGAATTAATCGAACTATCCGGTACCAACAAAAACAAAATTCAACTGATTATTTAGTCCGTTCATTCTTCCGGTGTAATATAAAATATTGCATCGGATCACCTTTTTAAACTGCCTGCCTTGTTATTTATTCAATAATGTTCTACCCtatta < 1:847015/251‑1 (MQ=255) cGGTTTAACCGTCGAAACTATCAGTCGTTTACTCGGTCGCTTCCAAAAACTTGGTGTATTATCGGTTCAAGGAAAATACATTACGAt < 1:210656/87‑1 (MQ=255) tttAACCGTCGAAACTATCAGTCGTTTACTCGGTCGCTTCCAAAAACTTGGTGTATTATCGGTTCAAGGAAAATACATTACGATTAATAATATGGCGGAATTAATCGAACTATCCGGTACCAACAAAAACAAAATTCAACTGATTATTTAGTCCGTTCATTCTTCCGGTGTAATATAAAATATTGCATCGGATCACCTTTTTAAACTGCCTGCCTTGTTATTTATTCAATAATGTTCTACCCTATTATAcc < 1:219278/251‑1 (MQ=255) tttAACCGTCGAAACTATCAGTCGTTTACTCGGTCGCTTCCAAAAACTTGGTGTATTATCGGTTCAAGGAAAATACATTACGATTAATAATATGGCGGAATTAATCGAACTATCCGGTACCAACAAAAACAAAATTCAACTGATTATTTAGTCCGTTCATTCTTCCGGTGTAATATAAAATATTGCATCGGATCACCTTTTTAAACTGCCTGCCTTGTTATTTATTCAATAATGTTCTACCCTATTATAcc < 1:119750/251‑1 (MQ=255) | TGATTTATCCGGCAAAATGCCTAAACTGCGCCAGCAAATTATGCGTTTAATGAGTAATGAAATTAAAAGTGATCAGGAAATGATTTTATTACTCTCTAAAATGAATGCAGAAGAACGTCTTGCCGCATTTATTTATAACTTATCTCAACGCTACTCCGCCCGAGGTTTTTCTGCCAGGGAATTCCGCTTAACCATGACTCGTGGTGATATCGGCAATTATCTCGGTTTAACCGTTGAAACTATCAGTCGTTTACTCGGTCGCTTCCAAAAACTTGGTGTATTATCGGTTCAAGGAAAATACATTACGATTAATAATATGGCGGAATTAATCGAACTATCCGGTACCAACAAAAACAAAATTCAACTGATTATTTAGTCCGTTCATTCTTCCGGTGTAATATAAAATATTGCATCGGATCACCTTTTTAAACTGCCTGCCTTGTTATTTATTCAATAATGTTCTACCCTATTATACC > 1/1072662‑1073137 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |