| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,065,639 | C→T | P142L (CCA→CTA) | unknown → | Integral membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,065,639 | 0 | C | T | 100.0% | 217.0 / NA | 79 | P142L (CCA→CTA) | unknown | Integral membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (37/42); total (37/42) | |||||||||||
ATCGCACAAAGTGAAAATATGCCGATTTTCTTGGCATTAGGTATTTTGTTACCAAGCGTATTTATTATTATGTCCAAAGCGGTGGAATTCGCCGGTATTGTACGTTCCGATGCGGCACAGCGTTTATCCTTATTCTTACCGATTCTCGCCGCATTTTTAATCTTTCATGAAACCTTAAGCCAACCAAAGCTTGTCGGAATTGTGTTGGCGTTTATCGGGTTATTTTGTCTATTAAGCAAACCGAATCCACAAAGTGCGGTCGATCTTCGTGGTATTTTGGGATTGGTTGGCGTATGGTTCGGCTACGGTATTATTGATATTTTATTCAAACAAGTAGCGAAAAGCGGCGGCGCATTCCCAACAACCTTGTTTATCGCGTTCTCATTGGCAGCCTGCATTATGTTCATTTATTTGCTGTTTAAACAAACCAAATGGAATATAGAGAGCTTTGTAGGCGGCATTATTTTAGGTGTGCTGAA > 1/1065392‑1065870 | aTCGCACAAAGTGAAAATATGCCGATTTTCTTGGCATTAGGTATTTTGTTACCAAGCGTATTTATTATTATGTCCAAAGCGGTGGAATTCGCCGGTATTGTACGTTCCGATGCGGCACAGCGTTTATCCTTATTCTTACCGATTCTCGCCGCATTTTTAATCTTTCATGAAACCTTAAGCCAACCAAAGCTTGTCGGAATTGTGTTGGCGTTTATCGGGTTATTTTGTCTATTAAGCAAACCGAATCtaca < 1:21217/251‑1 (MQ=255) 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ATCGCACAAAGTGAAAATATGCCGATTTTCTTGGCATTAGGTATTTTGTTACCAAGCGTATTTATTATTATGTCCAAAGCGGTGGAATTCGCCGGTATTGTACGTTCCGATGCGGCACAGCGTTTATCCTTATTCTTACCGATTCTCGCCGCATTTTTAATCTTTCATGAAACCTTAAGCCAACCAAAGCTTGTCGGAATTGTGTTGGCGTTTATCGGGTTATTTTGTCTATTAAGCAAACCGAATCCACAAAGTGCGGTCGATCTTCGTGGTATTTTGGGATTGGTTGGCGTATGGTTCGGCTACGGTATTATTGATATTTTATTCAAACAAGTAGCGAAAAGCGGCGGCGCATTCCCAACAACCTTGTTTATCGCGTTCTCATTGGCAGCCTGCATTATGTTCATTTATTTGCTGTTTAAACAAACCAAATGGAATATAGAGAGCTTTGTAGGCGGCATTATTTTAGGTGTGCTGAA > 1/1065392‑1065870 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |