| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,056,896 | T→C | V157A (GTC→GCC) | unknown → | Lysophospholipid transporter LplT / 2‑acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase (EC 2.3.1.40) / Acyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthetase (EC 6.2.1.20) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,056,896 | 0 | T | C | 100.0% | 159.4 / NA | 57 | V157A (GTC→GCC) | unknown | Lysophospholipid transporter LplT / 2‑acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase (EC 2.3.1.40) / Acyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthetase (EC 6.2.1.20) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (27/30); total (27/30) | |||||||||||
TCATTCGCTATGCCGCTACTGCCAGCGTGTTAATTTCCTTTGCGATTTTCCTCAGCTACTTTTTCGGTGCATTTGAGCTTGCTTTCCTGTTGACCTTGATTCTGGCGGCGCAAAGTGCGGTCTATTCTCCCGCCAAATATGGGATTATCAAATCTATTGTGGGTACGGAAAATCTGGGCGCCGCCAACGGTATTATCCAAGCCTTAACCATCGTGGCGATTTTATTCAGTTCCTTTGTCTTCTCTTATCTTTTTGAAGCCATTTATGTGGCAAGCAACAACCCGGCGGATATACTTTCCAGTATTTATGTGATCGGTTTCTTAATGTTGATTTTCAGCGCATTTGAAGTCATTTTCGCCTTTAGATTGCCTTATTTTCCACCGGCAGAAAGTGAAGAAAAAACACATTTCAGCAGCAAAAAATATTTTTCTTTAAGCTACTTAAGAGAAAACATGAAATTAGTTCGCGCCGATA > 1/1056659‑1057132 | tCATTCGCTATGCCGCTACTGCCAGCGTGTTAATTTCCTTTGCGATTTTCCTCAGCTACTTTTTCGGTGCATTTGAGCTTGCTTTCCTGTTAACCTTGATTCTGGCGGCGCAAAGTGCGGTCTATTCTCCCGCCAAATATGGGATTATCAAATCTATTGTGGGTACGGAAAATCTGGGCGCCGCCAACGGTATTATCCAAGCCTTAACCATCGTGGCGATTTTATTCAGTTCCTTTGCCTTCTCTTATCt < 1:586238/250‑1 (MQ=255) tCGCTATGCCGCTACTGCCAGCGTGTTAATTTCCTTTGCGATTTTCCTCAGCTACTTTTTCGGTGCATTTGAGCTTGCTTTCCTGTTGACCTTGATTCTGGCGGCGCAAAGTGCGGTCTATTCTCCCGCCAAATATGGGATTATCAAATCTATTGTGGGTACGGAAAATCTGGGCGCCGCCAACGGTATTATCCAAGCCTTAACCATCGTGGCGATTTTATTCAGTTCCTTTGCCTTCTCTTATc < 1:611619/245‑1 (MQ=255) cTATGCCGCTACTGCCAGCGTGTTAATTTCCTTTGCGATTTTCCTCAGCTACTTTTTCGGTGCATTTGAGCTTGCTTTCCTGTTGACCTTGATTCTGGCGGCGCAAAGTGCGGTCTATTCTCCCGCCAAATATGGGATTATCAAATCTATTGTGGGTACGGAAAATCTGGGCGCCGCCAACGGTATTATCCAAGCCTTAACCATCGTGGCGATTTTATTCAGTTCCTTTGCCTTCTCTTATCTTTTTGAAg < 1:817828/251‑1 (MQ=255) tATGCCGCTACTGCCAGCGTGTTAATTTCCTTTGCGATTTTCCTCAGCTACTTTTTCGGTGCATTTGAGCTTGCTTTCCTGTTGACCTTGATTCTGGCGGCGCAAAGTGCGGTCTATTCTCCCGCCAAATATGGGATTATCAAATCTATTGTGGGTACGGAAAATCTGGGCGCCGCCAACGGTATTATCCAAGCCTTAACCATCGTGGCGATTTTATTCAGTTCCTTTGCCTTCTCTTATCTTTTTGAAGc < 1:288995/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |