| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,056,556 | C→T | L44L (CTA→TTA) | unknown → | Lysophospholipid transporter LplT / 2‑acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase (EC 2.3.1.40) / Acyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthetase (EC 6.2.1.20) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,056,556 | 0 | C | T | 100.0% | 118.8 / NA | 44 | L44L (CTA→TTA) | unknown | Lysophospholipid transporter LplT / 2‑acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase (EC 2.3.1.40) / Acyl‑[acyl‑carrier‑protein] synthetase (EC 6.2.1.20) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (21/23); total (21/23) | |||||||||||
CACTTGTTCGCTTGTGCACCCCTTACGGGGCCGTCGGCAAAGCCGACGTTCAAAATCCGCTGGATTTTGTCACCACACTTTTGGCAGCAAGAACAAATTAATATAAAGGAGAAATATGAAAGAATTACTTAAAATCCGCGGCTTTTTACCTTATCTCGCCATCGCGTTTTTAAATGCGGGCGTGGATTTGGCGCATAAAATTAATATTCAAAACGTGCTGTTAAAAAGTTTCGACGGCGATACGCTAGTAGTGCTGACGGCTTTAGTCAACGCCATGATTTTGTTGCCTTTCGTGTTTTTATTTTCGCCCGCCGGTTTTATTAACGATAAATATTCCCAAACAAAAGTCATTCGCTATGCCGCTACTGCCAGCGTGTTAATTTCCTTTGCGATTTTCCTCAGCTACTTTTTCGGTGCATTTGAGCTTGCTTTCCTGTTGACCTTGATTCTGGCGGCGCAAAGTGCGGTCTATTCTCCCGCCAAATA > 1/1056312‑1056797 | cACTTGTTCGCTTGTGCACCCCTTACGGGGCCGTCGGCAAAGCCGACGTTCAAAATCCGCTGGATTTTGTCACCACACTTTTGGCAGCAAGAACAAATTAATATAAAGGAGAAATATGAAAGAATTACTTAAAATCCGCGGCTTTTTACCTTATCTCGCCATCGCGTTTTTAAATGCGGGCGTGGATTTGGCGCATAAAATTAATATTCAAAACGTGCTGTTAAAAAGTTTCGACGGCGATACGTtagtag < 1:517558/251‑1 (MQ=255) 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1/1056312‑1056797 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |